; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G07430 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G07430
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationChr4:5261889..5263848
RNA-Seq ExpressionCSPI04G07430
SyntenyCSPI04G07430
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062958.1 putative serine-rich protein [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-21691.05Show/hide
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XP_008451820.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo]2.2e-21791.67Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-19084.21Show/hide
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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]5.2e-20388.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXH6 Uncharacterized protein1.0e-24199.78Show/hide
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A0A1S3BT64 uncharacterized serine-rich protein C215.131.1e-21791.67Show/hide
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A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein8.9e-21791.05Show/hide
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein1.1e-21791.67Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like1.9e-19083.99Show/hide
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Query:  PKSESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRL-GMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPV
        PKSE+NPRSTST D HHP+ATRVGRSP+RRTPG+  SSSSRL G+RGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPV
Subjt:  PKSESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRL-GMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPV

Query:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGRR
        LNVPVCSSLRGSSKS SVFGFGP LFTGTGG    RSHQ   S+SSSSS+NRT  R
Subjt:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGRR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein4.0e-6845.59Show/hide
Query:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELL-PVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDG
        MASACV + G+S E F          SYGW  PR+S +RDD+  S+             +      DP PE+  PV DFEF L+DPV+ ML ADELF DG
Subjt:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELL-PVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDG

Query:  KLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQ-----TTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEAN
        KLVPL+ S  K +     +T   ++ +       ++S RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L       N   + ++ KA+++S  +   
Subjt:  KLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQ-----TTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEAN

Query:  SKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN-NPPRMRLVKPRPKS
        + + K FLHR SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD + KP+ NP +  R  + N N PR+RL KPR   
Subjt:  SKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN-NPPRMRLVKPRPKS

Query:  ESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVL
         ++P ST + D                    SSSSS+ +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ K + GM RSYSANVR+TPVL
Subjt:  ESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVL

Query:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR
        NVPVCS   G         FG L  + +  SSSS S  N S   S+ S NR  R
Subjt:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR

AT1G79060.1 unknown protein8.3e-7449.04Show/hide
Query:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK
        MAS CVNNV +S +            +YG   PR SFSRDD   S  +G ++   P            +   +   DFEFRL++    MLPADELF DGK
Subjt:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK

Query:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL
        LV  Q       + G    +C        +    VE E S   D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS            ATTT+    +++ +L
Subjt:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL

Query:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN--------------NPPRM
        K FLHRSS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD E +PN N I    N NHN              NPPRM
Subjt:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN--------------NPPRM

Query:  RLVKPRPKSESNPRSTSTADHHHPSAT---RVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERSY
        RLV                 +H  S T   RVGRSP+RR+ GE+S+  +    RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   +++RGMERSY
Subjt:  RLVKPRPKSESNPRSTSTADHHHPSAT---RVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERSY

Query:  SANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGRREN
        S+NVRVTPVLNVPVC S+RG S    VFG                   +SSS+SSSS +NRTG   N
Subjt:  SANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGRREN

AT3G05980.1 unknown protein2.5e-0632.68Show/hide
Query:  LGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVS--LMLPADELFFDGKLVPL-QVSSVKPSVN-GLKSTRCVSSPQ
        LGPR+SFS D S   +          P +   D  +      + V+DFEF   + VS   ML ADELF +GKL+P  QV   +   N  LK+     + +
Subjt:  LGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVS--LMLPADELFFDGKLVPL-QVSSVKPSVN-GLKSTRCVSSPQ

Query:  TTVQSRRRVEEECSTDPYLF-------SPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSN
          V+ +++ +E  + D  +        SP+ P+C+  W+ELL LKK    SS+
Subjt:  TTVQSRRRVEEECSTDPYLF-------SPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSN

AT3G12970.1 unknown protein5.4e-5742.79Show/hide
Query:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK
        MAS CV NVG S           P HS  W   ++S +R+  P +           PA+ + D          PV DFEF L+DPV+ ML ADELF DGK
Subjt:  MASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGK

Query:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL
        LVPL+ S V       +     S   T V+  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L ++    + ++      +  +S      + + 
Subjt:  LVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKAL

Query:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSESN
        ++FL+RSSKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD +NKP T                            N
Subjt:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSESN

Query:  PRSTSTADHHHPSATR-VGRSPIRRTP-GESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVLNVP
        P + S A HHH    +   R P R T   ES+ SS    +  V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K + GM RS+SANVR+TPVLNVP
Subjt:  PRSTSTADHHHPSATR-VGRSPIRRTP-GESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR
        V SSLR   KS   FG    LF  +  +SSS S  N +   S++  NRT R
Subjt:  VCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSNSSSSSSNRTGR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCATCATCCCCCCCCCTTTATCCATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATCTCCTCCGAAAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGTCATTCCTA
TGGTTGGCTCGGCCCTCGCCTCTCCTTCAGCCGTGATGACTCCCCTCCTTCTAACCTCGCCGGACCTTTGTCCAAGACTAAACCTCCTGCTGTTGCCGACTCCGACAGTA
CTCGAGATCCGGATCCTGAACTGCTTCCGGTTACTGACTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTTTCCTTGATGCTCCCTGCGGATGAGCTGTTTTTTGATGGCAAACTC
GTGCCGCTTCAGGTTTCGTCTGTTAAACCCTCAGTCAACGGGTTGAAGTCCACCAGGTGCGTTTCCTCGCCACAGACTACGGTTCAGTCCCGTCGAAGAGTTGAGGAAGA
ATGCAGTACGGATCCGTATCTTTTTTCTCCTAAAGCCCCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTGGGGCTCAAAAAGCTGTACCAGAGTAGCAGCAATGGCAATG
GCAACGCTAAAAACGATAACCACAAAGCCACGACCACCTCTTACTTCTCCGAAGCTAATTCGAAGGCGTTGAAGTACTTTCTTCACCGAAGTTCCAAATCGTCGTTGTCA
TCCTCTTTGGATTCGTCGCTGAGCCTTCCATTACTAAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCTCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGA
ACACGAAGATCTTCACAGACTGTCACTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATAGGAACCCCAATCACAACAATCCACCGCGGATGAGACTGG
TGAAACCGAGGCCTAAATCGGAGAGTAATCCAAGATCAACTTCAACAGCAGATCATCATCATCCATCGGCGACGAGAGTAGGGAGAAGCCCGATACGGCGTACGCCTGGA
GAATCATCGTCATCCTCCAGTAGATTAGGGATGCGAGGAGTATCGGTAGACAGTCCACGAATGAACTCATCAGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAG
CAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGGTCATACTCTGCTAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTT
CCTTAAGAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTATTCGGATTCGGACCATTATTATTCACCGGGACCGGCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCCACCAGAATAGCAGCAGCAAC
AGTAGTAGTAGTAGTAGTAACCGGACGGGGCGGAGGGAAAATCCATTGGTGAGAGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTATTATTTTTTTTATACATATAAATAGTGAGTTTCCTGTACGGTGCCACCACGGTCCTCTTTCTAAAAGCCCAACTCATCATCTCTCCAAACCCTAAACTCTCTCTCTT
CTTCCCTCCAGATCTCGCCGGATATTCACCCCATGTGATTTCCTCCACACCACGTTCACCATCTTCCGCCTCATTTCCTTCTCCCACCATCCAACTTCCATTTCACCTTC
GCATGATCATCATCCCCCCCCCTTTATCCATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATCTCCTCCGAAAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGTCATTCC
TATGGTTGGCTCGGCCCTCGCCTCTCCTTCAGCCGTGATGACTCCCCTCCTTCTAACCTCGCCGGACCTTTGTCCAAGACTAAACCTCCTGCTGTTGCCGACTCCGACAG
TACTCGAGATCCGGATCCTGAACTGCTTCCGGTTACTGACTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTTTCCTTGATGCTCCCTGCGGATGAGCTGTTTTTTGATGGCAAAC
TCGTGCCGCTTCAGGTTTCGTCTGTTAAACCCTCAGTCAACGGGTTGAAGTCCACCAGGTGCGTTTCCTCGCCACAGACTACGGTTCAGTCCCGTCGAAGAGTTGAGGAA
GAATGCAGTACGGATCCGTATCTTTTTTCTCCTAAAGCCCCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTGGGGCTCAAAAAGCTGTACCAGAGTAGCAGCAATGGCAA
TGGCAACGCTAAAAACGATAACCACAAAGCCACGACCACCTCTTACTTCTCCGAAGCTAATTCGAAGGCGTTGAAGTACTTTCTTCACCGAAGTTCCAAATCGTCGTTGT
CATCCTCTTTGGATTCGTCGCTGAGCCTTCCATTACTAAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCTCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCAC
GAACACGAAGATCTTCACAGACTGTCACTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATAGGAACCCCAATCACAACAATCCACCGCGGATGAGACT
GGTGAAACCGAGGCCTAAATCGGAGAGTAATCCAAGATCAACTTCAACAGCAGATCATCATCATCCATCGGCGACGAGAGTAGGGAGAAGCCCGATACGGCGTACGCCTG
GAGAATCATCGTCATCCTCCAGTAGATTAGGGATGCGAGGAGTATCGGTAGACAGTCCACGAATGAACTCATCAGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCA
AGCAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGGTCATACTCTGCTAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTC
TTCCTTAAGAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTATTCGGATTCGGACCATTATTATTCACCGGGACCGGCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCCACCAGAATAGCAGCAGCA
ACAGTAGTAGTAGTAGTAGTAACCGGACGGGGCGGAGGGAAAATCCATTGGTGAGAGATTAGAAGAAAAGGGATTTCTAATTTTGGGTAACACTAACCAAACCCCGTTTT
TTTCCCATTTTGCTCTCAATGTTTTAGGATTATACTGAAATTTCCCCCTTTATGATAGACGGATTTGGTTTCAATTTGCTAATTCTTAACACAAAAACAGGCATCATAAT
CATCATCATCACCATTCACCACCATCGTGTATTATGTAAATACGGCAGGGGAATTTTTGTATTTTAGTTTGATTTAATTTTAGTTAATCTGGTTGATCTTCTAATTAATC
TCTTCAACACTTTGAATTGTGTGTGTTTATGAGGATCATGAATGGCATCCAAAATGAGTATTTGTTGTAAAAAACAATCCCACAGCGCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIIIPPPLSMASACVNNVGISSENFLDCSSSVPCHSYGWLGPRLSFSRDDSPPSNLAGPLSKTKPPAVADSDSTRDPDPELLPVTDFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKL
VPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPQTTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNAKNDNHKATTTSYFSEANSKALKYFLHRSSKSSLS
SSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSESNPRSTSTADHHHPSATRVGRSPIRRTPG
ESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSRSHQNSSSN
SSSSSSNRTGRRENPLVRD