; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G09540 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G09540
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr4:7521528..7524876
RNA-Seq ExpressionCSPI04G09540
SyntenyCSPI04G09540
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038894275.1 uncharacterized protein LOC120082923 [Benincasa hispida]6.9e-7795.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZD2 Uncharacterized protein4.2e-8099.31Show/hide
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A0A1S3CHZ2 uncharacterized protein LOC1035011672.8e-7997.93Show/hide
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A0A5A7UN65 Uncharacterized protein2.8e-7997.93Show/hide
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A0A6J1CI74 uncharacterized protein LOC1110117291.5e-7795.86Show/hide
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A0A6J1HTL7 uncharacterized protein LOC111467357 isoform X21.5e-7293.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G49550.1 unknown protein2.8e-5265.77Show/hide
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        ME+ GKS +V   ANVIYLS ILG +G    HKC WKCENE+VCGNMYRCK TG+TH+CDKNC+QRILYDNH+SLCRASG+IFPLSL EE A++G+RRKL
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        D ++     +    +RRRDAQFH SPFERSF+A  P CSQ  GDGM+++
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AT5G24610.1 unknown protein1.0e-5470.07Show/hide
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        ME+ GKS MV   ANVIYLS ILGRD     HKC WKCENE+VCGNMYRCK TG+TH+CDKNC+QRILYDNHSSLCRASG+IFPLS  EE A++G+RRKL
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        D A++   +  +FK RRRDAQFH SPFERSF+A  PICS  GDGM++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTAAACGGCAAATCCATGGTCTCAGAGCCTGCAAATGTTATTTATCTTTCAACTATTCTGGGTAGAGATGGGCAAGTTCTTGCCCACAAATGTGGTTGGAAATG
TGAGAATGAACATGTGTGTGGTAATATGTACCGCTGCAAATTTACAGGAATGACTCACATTTGTGACAAAAACTGTGACCAACGAATTCTGTATGATAACCATAGCTCAC
TTTGCCGTGCAAGTGGGCAAATATTCCCCCTTTCACTGACAGAAGAACATGCAATCAGAGGCATTCGCAGGAAGCTTGATGCTGACAATTCCTCCGTTGATGACTTTGCT
TTTAAGCGTAGGCGGGATGCCCAGTTTCATCCTTCACCTTTTGAGAGATCTTTCTCTGCTGCCGTCCCAATTTGCAGTCAAGTTGGAGATGGCATGGATATGAGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTATTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATCGTGGTTGTTGCTAGATTATCCAAAATCAAAGGGAAACGGAGACGAGGGAGTGCGGGAGTTGA
TTCAGAGGGAGACAGCGCCCCCGCGTTTTGTCGTTTTCTTCTTCTTCCTTTTGTTCCGATACTCTGGGTGGTGCCGTGTGACCTCTCAGATCAAAAATTTTGAGGCAAGA
CTTTCCTTTTGACAGCATCATTTCAATGGAGTTAAACGGCAAATCCATGGTCTCAGAGCCTGCAAATGTTATTTATCTTTCAACTATTCTGGGTAGAGATGGGCAAGTTC
TTGCCCACAAATGTGGTTGGAAATGTGAGAATGAACATGTGTGTGGTAATATGTACCGCTGCAAATTTACAGGAATGACTCACATTTGTGACAAAAACTGTGACCAACGA
ATTCTGTATGATAACCATAGCTCACTTTGCCGTGCAAGTGGGCAAATATTCCCCCTTTCACTGACAGAAGAACATGCAATCAGAGGCATTCGCAGGAAGCTTGATGCTGA
CAATTCCTCCGTTGATGACTTTGCTTTTAAGCGTAGGCGGGATGCCCAGTTTCATCCTTCACCTTTTGAGAGATCTTTCTCTGCTGCCGTCCCAATTTGCAGTCAAGTTG
GAGATGGCATGGATATGAGCTAGATTTACATAAGAAAAAGGATGGGAAAACTGGGGCTTATCACTATGCTGTTCTTTTGAATAATTTCCTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTT
TTCTTTTTTGTTTTGCCTACGGACTGATATCATATAATGGACTTGACCTGCGGGTACTTGAAGTGATGGACCTTTGTATGCCCCACCTGTTTGTAGGAACGCTTATATTT
CTAATCTTGTTTAATGCCAATATGTAGCTGACACTAGATTGACTATAACAGCTGGGATGGAGCAGGATGATCATGAACTTTACATTTATAATTAGACTTTACGTACCCTG
TATCATCTCAACATATACTATTGTAGCTCTAAAGGCTTCCTTAGTATCCTTTCTTGATATACTTTCCTCACGTTATTTGATATGCTTTTACACTGCTAAAGCATTTTGAG
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TGTTCATTATCTAATATATTTGTTGTTTCCTTATTTTATTACCAAGATGTCCTTGAGGCTCTTTTTTTTTCTTATTCAGCAGGGGTTTGGTCATTTTCCTAATCGTGTGA
TTTTAGTTATGCTTGTCGTTTAATGCTTCTTGCTTTGCAATTTGTTTAAATCTAATCACTGATGTTTGACTTTGATCACCTTTCTTGGCAGGTTACGTAGCCTCTTGGTC
AATGTGGAGAACAAATTTGAATAAAATGTTCAAACTTTAAAATGGTCCTACCTCTTTGGAGGTGCTGGTGCCCTTCGTAAATGTGGAGAACCAGTTGACAGAACAAGATG
TTATCCTGAAATTGCAAAAAAGATATTTGAGGTTTCCCCAAGCATTTAATTTACCGGGACAAGGCTTGAAAGTTATTCTCTGCAGCCTATTGAATTGTATATTAAGTTTG
TTAAGATGTGCAATATTCAGAACAGCATAAAGTATGACGTAGAGAAGTTTTTGTATTATCACTAAAGATTGTTTACAGTTGATAGTTAATCTAATTTGAATTGAATGCTT
GGTTTGTTCAATTGTTCTTGAGCAACTCTGTGACAGAACTATTTCAATTCTCATCTTTCCATACTGTCCTGCTTGGTTGGTTGGAGCAGGGATGGCTCGTCACTCAATTT
TTGTGGTTTCTTGTAGCCTTCGTTGGCAAAGTTGATATTGGATTATGCAGGCAGGGTCTTTTGTAGCCTTCGTTGGCAAAGTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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