; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G11850 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G11850
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionMADS-box protein SVP-like
Genome locationChr4:10099513..10107381
RNA-Seq ExpressionCSPI04G11850
SyntenyCSPI04G11850
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649388.1 hypothetical protein Csa_011848 [Cucumis sativus]4.7e-80100Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
        MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK

Query:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
        TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
Subjt:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

KAG7027510.1 MADS-box protein SVP [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.3e-6885.8Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSI-SQPPSQLEKSAHAKLTEEFAA
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM +LLRRHNM+PE+NS   QPPSQ+EK A+AKL+EEFAA
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSI-SQPPSQLEKSAHAKLTEEFAA

Query:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV
        KTKEL+HM+GE+LQ+LGIEELKQLEKLLE GLNRVIETKD+KFLKEI   KEKE+LLMKENQRLRN +V
Subjt:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV

XP_008454463.1 PREDICTED: MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 [Cucumis melo]2.9e-7794.22Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQ-PPSQLEKSAHAKLTEEFAA
        MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELN+ISQ PPSQLEKSAHAKLTEEFAA
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQ-PPSQLEKSAHAKLTEEFAA

Query:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFI
        KTKELRHMKGEELQELGIEELK+LEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEI TVKEKE+LLMKENQRLRNKL+   +
Subjt:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFI

XP_011653451.1 MADS-box protein JOINTLESS [Cucumis sativus]7.3e-8197.11Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
        MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK

Query:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFIS
        TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL+   I+
Subjt:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFIS

XP_038905492.1 MADS-box protein SVP-like isoform X1 [Benincasa hispida]5.6e-7392.22Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSML+LLRRHNMLPELN+ SQPPSQLEKSA+ KLTEEFAAK
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK

Query:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
        TKELRHMKGEELQ LGIEELKQLEKLLE GLNRVIETKDEKFLKEI  VKEKE+LLM+ENQRLRNK+
Subjt:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYS5 MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X11.4e-7794.22Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQ-PPSQLEKSAHAKLTEEFAA
        MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELN+ISQ PPSQLEKSAHAKLTEEFAA
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQ-PPSQLEKSAHAKLTEEFAA

Query:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFI
        KTKELRHMKGEELQELGIEELK+LEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEI TVKEKE+LLMKENQRLRNKL+   +
Subjt:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFI

A0A6J1E6W1 MADS-box protein SVP-like isoform X27.2e-6685.63Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM +LL RHN LPE+N+  QP  Q+EKS  A L EEFAAK
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK

Query:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
        TKELRHMKGEEL+ELGIEELKQLEKLLE GLNRVIETKDEKFLKEI  VKEKE+LL KENQRLRN++
Subjt:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

A0A6J1EDZ0 MADS-box protein SVP-like4.5e-6885.8Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSI-SQPPSQLEKSAHAKLTEEFAA
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM +LLRRHNM+PE+NS   QPPSQ+EK A+AKL+EEFAA
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSI-SQPPSQLEKSAHAKLTEEFAA

Query:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV
        KTKEL+HM+GE+LQ+LGIEELKQLEKLLE GLNRVIETKD+KFLKEI   KEKE+LLMKENQRLRN +V
Subjt:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV

A0A6J1HRP2 MADS-box protein SVP-like4.5e-6885.8Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSI-SQPPSQLEKSAHAKLTEEFAA
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM +LLRRHNM+PE+N+   QPPSQLEK A+AKL+EEFAA
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSI-SQPPSQLEKSAHAKLTEEFAA

Query:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV
        KTKEL+HM+GE+LQ+LGIEELKQLEKLLE GLNRVIETKD+KFLKEI   KEKE+LLMKENQRLRN +V
Subjt:  KTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV

A0A6J1J9W9 MADS-box protein SVP-like isoform X22.5e-6685.63Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
        MTRQKI+IKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSM +LL RHN LPE+N+  QP  Q+EKS  A L EEFAAK
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK

Query:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
        TKELRHMKGEELQELGIEELK+LEKLLE GLNRV+ETKDEKFLKEI  VKEKE+LLMKENQRLRN++
Subjt:  TKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82794 MADS-box protein AGL242.2e-4054.97Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNM-LPELNSISQPPS---QLEKSAHAKLTEE
        M R+KI IKKIDNI ARQVTFSKRRRG+FKKA EL+ LCDAD+ALI+FSA+GKLF++SSS M D+L R+++    +N +  PPS   +LE    ++L++E
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNM-LPELNSISQPPS---QLEKSAHAKLTEE

Query:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
           KTK+LR ++GE+L  L +EEL++LEKLLE+GL+RV E K E  + +I +++++ S L+ EN+RLR+KL
Subjt:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

Q5K4R0 MADS-box transcription factor 474.1e-3450Show/hide
Query:  RQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQL-----EKSAHAKLTEEF
        R++I I++IDN+AARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDA++ L+VFSA+GKLF ++S+SM  ++ R+N   +    ++ PSQL     + S  A+L EE 
Subjt:  RQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQL-----EKSAHAKLTEEF

Query:  AAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
        A  +  LR M+GEEL  L +E+L++LEK LE+GL  V++TK +K L EI  ++ K   L++EN RL+ +L
Subjt:  AAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

Q9FUY6 MADS-box protein JOINTLESS1.5e-4155.81Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNM-LPELNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE
        M R+KI+IKKIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLFDYSSSSM  +L R ++    L  + QP  +L   E S +++L++E
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNM-LPELNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE

Query:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV
         + K+  LR M+GEELQ L IEEL+QLE+ LE GL+RVIE K +K ++EI  +++K   LM+EN++LR +++
Subjt:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLV

Q9FVC1 MADS-box protein SVP2.8e-4358.24Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPE-LNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE
        M R+KI+I+KIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLF++ SSSM ++L RHN+  + L  + QP  +L   E S HA++++E
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPE-LNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE

Query:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNK
         A K+  LR M+GEELQ L IEEL+QLEK LE GL RVIETK +K + EI  +++K   LM EN+RLR +
Subjt:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNK

Q9XJ66 MADS-box transcription factor 223.3e-3651.76Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPS---QLEKSAHAKLTEEF
        M R++ EIK+I++ AARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALIVFS++GKL  ++SSSM +++ ++N        ++ PS    LE S +A L E+ 
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPS---QLEKSAHAKLTEEF

Query:  AAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
        A  +  LR M+GEEL+ L I+EL+QLEK LE GL+RV+ TKD++F+++I  ++ K S L +EN +LRN++
Subjt:  AAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22540.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.0e-4458.24Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPE-LNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE
        M R+KI+I+KIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLF++ SSSM ++L RHN+  + L  + QP  +L   E S HA++++E
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPE-LNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE

Query:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNK
         A K+  LR M+GEELQ L IEEL+QLEK LE GL RVIETK +K + EI  +++K   LM EN+RLR +
Subjt:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNK

AT2G22540.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein1.6e-4157.06Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPE-LNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE
        M R+KI+I+KIDN  ARQVTFSKRRRGLFKKA EL+ LCDAD+ALI+FS++GKLFD     M ++L RHN+  + L  + QP  +L   E S HA++++E
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPE-LNSISQPPSQL---EKSAHAKLTEE

Query:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNK
         A K+  LR M+GEELQ L IEEL+QLEK LE GL RVIETK +K + EI  +++K   LM EN+RLR +
Subjt:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNK

AT4G24540.1 AGAMOUS-like 241.6e-4154.97Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNM-LPELNSISQPPS---QLEKSAHAKLTEE
        M R+KI IKKIDNI ARQVTFSKRRRG+FKKA EL+ LCDAD+ALI+FSA+GKLF++SSS M D+L R+++    +N +  PPS   +LE    ++L++E
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNM-LPELNSISQPPS---QLEKSAHAKLTEE

Query:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL
           KTK+LR ++GE+L  L +EEL++LEKLLE+GL+RV E K E  + +I +++++ S L+ EN+RLR+KL
Subjt:  FAAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKL

AT4G37940.1 AGAMOUS-like 211.0e-2441.28Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLP-ELNSISQPPSQLE--KSAHAKLTEEF
        M R KI I++ID+  +RQVTFSKRR+GL KKA ELA LCDA++ LI+FS++GKL+D++SSSM  ++ R+N    E   +  P S+++  +   A L +E 
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLP-ELNSISQPPSQLE--KSAHAKLTEEF

Query:  AAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVR
         A  +  R M GE+L  L + EL  LE  +E  L  +   K++   +EI  + +K +L+ +EN  L  K+ R
Subjt:  AAKTKELRHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVR

AT5G51870.3 AGAMOUS-like 711.4e-2438.92Show/hide
Query:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK
        M R KIEIKKI+N+ +RQVTFSKRR GLFKKAHEL+ LCDA +A IVFS SG+L +YSSS M  ++ R+        +++ P         K+  +   K
Subjt:  MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAK

Query:  TKEL-----RHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRL-----RNKLVRAFISIT
          +L     R + G+ L    + EL++++  +E  L  V   K E +  ++  +KEKE  L+ E +RL     R +L+R  +  T
Subjt:  TKEL-----RHMKGEELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRL-----RNKLVRAFISIT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAAGACAAAAAATAGAGATAAAGAAAATAGACAACATAGCAGCAAGACAAGTGACATTTTCAAAGAGGAGAAGAGGGCTATTCAAAAAAGCTCATGAACTTGCAAC
TCTCTGTGATGCTGATATTGCTCTCATTGTTTTTTCTGCTTCTGGAAAGCTTTTTGATTATTCTAGCTCAAGCATGCTGGATTTACTAAGAAGACATAATATGCTACCGG
AGCTGAATAGCATTAGCCAACCTCCATCCCAGTTGGAAAAGAGTGCCCATGCTAAATTGACTGAAGAATTTGCAGCCAAGACCAAAGAACTTAGGCATATGAAGGGAGAG
GAGCTTCAAGAACTTGGAATAGAAGAATTAAAGCAGTTGGAGAAATTGCTTGAGAATGGTTTGAATCGTGTAATAGAGACCAAGGATGAAAAGTTTCTGAAAGAAATTGT
TACCGTAAAGGAGAAGGAAAGCTTGCTAATGAAAGAGAATCAGAGACTGAGGAATAAATTAGTGAGAGCTTTTATCTCAATTACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTTAGGTACATACTCCCATTTCACAAATTTCCCTTTAAACCAATTCCATTCCCTTTCCTTTTTCCAGAAAAGGAAAAACATTTTCTTCTCTCTACAAATATCCATTGC
AGCTCCTAAATTTTGTTTCATAATCTCCAATACCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCAAATTTTTACAGCCAAAAAAAACCCAGAAACAGAAGAACACCAACATAGAACACGA
GGGAAGGAAGAAAAAAAAAGGGAAAAATGACAAGACAAAAAATAGAGATAAAGAAAATAGACAACATAGCAGCAAGACAAGTGACATTTTCAAAGAGGAGAAGAGGGCTA
TTCAAAAAAGCTCATGAACTTGCAACTCTCTGTGATGCTGATATTGCTCTCATTGTTTTTTCTGCTTCTGGAAAGCTTTTTGATTATTCTAGCTCAAGCATGCTGGATTT
ACTAAGAAGACATAATATGCTACCGGAGCTGAATAGCATTAGCCAACCTCCATCCCAGTTGGAAAAGAGTGCCCATGCTAAATTGACTGAAGAATTTGCAGCCAAGACCA
AAGAACTTAGGCATATGAAGGGAGAGGAGCTTCAAGAACTTGGAATAGAAGAATTAAAGCAGTTGGAGAAATTGCTTGAGAATGGTTTGAATCGTGTAATAGAGACCAAG
GATGAAAAGTTTCTGAAAGAAATTGTTACCGTAAAGGAGAAGGAAAGCTTGCTAATGAAAGAGAATCAGAGACTGAGGAATAAATTAGTGAGAGCTTTTATCTCAATTAC
TTAACAACTCTAATTCTCTTCCTAAGTGAAAATGAAAGTTAAAAAAAAAAAGACAAAATTAGCCTTTCTGGTGTTTTCTGTGATGTGATGGCAGATGGAAACCTTGATCA
ATAGAGATGATCAGCAAGAAGAAGAAGAAGCTGTGGTTCTTATTGCTGGAAATTCTGTGGGTTCAAAGTCAAAGTCAAACACCAGCAACAGCAGCTCCTCACAAAACCCT
AATTCTCAAGATTATGATGACATTTCTCTTAAATTGGGTCTTTGAAGGCACCAAGTTATGCATGCAGTTAGTTCTTTGCAGCAAAAAGGCAATGCAAAACACAGCCCTTC
TCTAATGGAAGCTTTACTAATCACATGGACTGCCAAAGCACGATCCTGTTTACATAGAGAAATTAAAGGATGTCAAAAAGGCATGCTTTTCCTTACCATATTGTACTTAT
TTTAATCCCAATTCTTTTAATTAGCACAGAATATATGATATGTGTTTTCAATACCAAAAAAGAAAAGTGTTGGATACTATATATGAGTATTTACTGTTTCTCTGCATATC
AATTGAGTAACCCACTTTACTATTGTATATTTATATAACTCAATCATAAGTTTCTCTTTTGCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTRQKIEIKKIDNIAARQVTFSKRRRGLFKKAHELATLCDADIALIVFSASGKLFDYSSSSMLDLLRRHNMLPELNSISQPPSQLEKSAHAKLTEEFAAKTKELRHMKGE
ELQELGIEELKQLEKLLENGLNRVIETKDEKFLKEIVTVKEKESLLMKENQRLRNKLVRAFISIT