CuGenDBv2

Gene ID	CSPI04G16400
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	ACT domain-containing protein
Genome location	Chr4:13734167..13735971
RNA-Seq Expression	CSPI04G16400
Synteny	CSPI04G16400
Gene Ontology terms	GO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0050896 - response to stimulus (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function) GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_004149926.1 uncharacterized protein LOC101209807 [Cucumis sativus]

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A0A0A0L039 Uncharacterized protein

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A0A1S3CLI8 uncharacterized protein LOC103502184

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A0A6J1CQF9 uncharacterized protein LOC111013797

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A0A6J1GFJ5 uncharacterized protein LOC111453491

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A0A6J1IM47 uncharacterized protein LOC111477723

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT2G40435.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transcription regulators (TAIR:AT3G56220.1)

2.0e-19

51.76

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        T +V VE++++GF+INVF  +N PG+LV +LEAFE +GL VL+A  SC+D F L A G ENE  + + A+ VK AV  AI+ W E
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AT3G56220.1 transcription regulators

2.5e-17

42.72

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        N++  + + FR S+    +V VE++E+GF+I V   +N  G+LV +LE FE LGL V++A +SC+D F L A G   N+    I A+ VK AV +AI+ W
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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AAGGAATGGAGTGAAAGTGATGGGCAAACATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AGAAATTGGTAAAGCAAAAATAGGGGGCAAGTCCAATCACGTAAATATATTCAAGTAAGTACAAATTTTGAATTTCGTAAGTGAAACGACAGAGTACTCATGCAAAAAGG
AAAATAAAATTATTTTTTTCTAAATTTAAAAAAAAAAATAAGAAGAAGAAGAGAAGAAAGAAAATAGAAAAATGCAAATATAAATAAAGAGAAAACTGGTGGTCTACTTT
GTTTCAAGAAGCTTAGCTTTCAACAAGAGAAAGCAAGAACCTGCGGTGGCGCGTGAACGAGACACACGGCGGGGTTTGCAATAATAATAAACATCTCCGGTGGCCGTGAA
ATGGGTTCTAGAGAGCGAAAGAAAGCAGCAGCAGCAGCACCTAATTCTTCTCATCACAACTCTAAAGAATTTCGTGCTTCCACAAGCTCTACTGCTGTGGTGAATGTGGA
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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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KEWSESDGQT

CSPI04G16400 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome