; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G16780 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G16780
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionKH domain-containing protein
Genome locationChr4:14159072..14165313
RNA-Seq ExpressionCSPI04G16780
SyntenyCSPI04G16780
Gene Ontology termsGO:0048024 - regulation of mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR004088 - K Homology domain, type 1
IPR032377 - STAR protein, homodimerisation region
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR045071 - KH domain-containing BBP-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142668.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X2 [Cucumis sativus]1.1e-15599.65Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQE RLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

XP_008463293.1 PREDICTED: KH domain-containing protein At2g38610 [Cucumis melo]3.2e-15599.29Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLM+NVSSTGLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQE RLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

XP_011653733.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X1 [Cucumis sativus]1.2e-157100Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

XP_022925242.1 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X1 [Cucurbita moschata]8.0e-15497.16Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPIC RLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNL++NVSS GLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQEQRLSR PGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIE DLP N+VDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

XP_038882687.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X1 [Benincasa hispida]5.5e-15598.58Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMAS+NLM+NV STGLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIEADLPAN+VDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXW7 KH domain-containing protein5.4e-15699.65Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQE RLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

A0A1S3CIV3 KH domain-containing protein At2g386101.6e-15599.29Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLM+NVSSTGLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQE RLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

A0A5D3C4T5 KH domain-containing protein6.6e-15499.28Show/hide
Query:  MYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGWNG
        MYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLM+NVSSTGLSGWNG
Subjt:  MYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGWNG

Query:  LPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPL
        LPQE RLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPL
Subjt:  LPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPL

Query:  HILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        HILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  HILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

A0A6J1EB88 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X13.9e-15497.16Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPIC RLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNL++NVSS GLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQEQRLSR PGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIE DLP N+VDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

A0A6J1HTR7 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X11.5e-15396.81Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG
        MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFM VLPIC RLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNL++NVSS GLSG
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSG

Query:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
        WNGLPQEQRLSR PGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
Subjt:  WNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        EPLHILIE DLP N+VDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WLR1 KH domain-containing protein At4g264805.7e-7855.36Show/hide
Query:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGW
        S   S NFS    + P      +   +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RL+NQEILRV+ ++ N     L + R   PSP+AS  +  N S   ++GW
Subjt:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGW

Query:  -NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
         +  P E+ +S +P    +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLN
Subjt:  -NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        EPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL PV+E+HD+ K+QQLRELA+LN S REE     GS+SP+NS GMKRAKT
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT

Q75GR5 KH domain-containing protein SPIN19.3e-11372.08Show/hide
Query:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTP-DVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLS
        MSG+YS  FSPAR  SP IR+ P DVDSQYL+ELLAEHQK GPFMQVLPIC +LL+QEI+RVS ++ N GF D DR R RSPSPM+S N  +N S  G S
Subjt:  MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTP-DVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLS

Query:  GWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHL
         WNGL QE RL    G +MDWQ AP SPSS  VK+ILRL++PVD+YPNFNFVGR+LGPRGNSLKRVE +TGCRV+IRGKGSIKDP KE+KLRG+PGYEHL
Subjt:  GWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHL

Query:  NEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        ++PLHILIEA+ PA+++D RLR AQE+IEELLKPVDES D+ KRQQLRELAMLNS+ RE+SP P GSVSPF++ GMKRAKTG+
Subjt:  NEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

Q8GYR4 KH domain-containing protein At3g086201.9e-12679.58Show/hide
Query:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGL
        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLM+NVS  GL
Subjt:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGL

Query:  SGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH
         GWNGLP E R+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEH
Subjt:  SGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH

Query:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        LNE LHILIEADLP ++VDI+LRQAQEIIEEL+KPVDES DYIKRQQLRELA+LNS+ RE SPGP GSVSPFNS+ MKR KTGR
Subjt:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

Q9FKT4 KH domain-containing protein At5g561403.7e-7754.9Show/hide
Query:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS
        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
Subjt:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS

Query:  TGLSGW-NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP
          ++GW +  P E+ +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
Subjt:  TGLSGW-NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP

Query:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL P++E+HD  K+QQLRELA+LN + REE     GSVSP+NS GMKRAKT
Subjt:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT

Q9ZVI3 KH domain-containing protein At2g386101.0e-12783.28Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLM+NVS+TG
Subjt:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG

Query:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE
        L GWNGL QE RLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYE
Subjt:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE

Query:  HLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        HLNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
Subjt:  HLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38610.1 RNA-binding KH domain-containing protein7.3e-12983.28Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLM+NVS+TG
Subjt:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG

Query:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE
        L GWNGL QE RLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYE
Subjt:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE

Query:  HLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        HLNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
Subjt:  HLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG

AT2G38610.2 RNA-binding KH domain-containing protein7.3e-12983.28Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLM+NVS+TG
Subjt:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTG

Query:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE
        L GWNGL QE RLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYE
Subjt:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE

Query:  HLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        HLNE LHILIEADLPA++V+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
Subjt:  HLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG

AT3G08620.1 RNA-binding KH domain-containing protein1.4e-12779.58Show/hide
Query:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGL
        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLM+NVS  GL
Subjt:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGL

Query:  SGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH
         GWNGLP E R+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEH
Subjt:  SGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH

Query:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        LNE LHILIEADLP ++VDI+LRQAQEIIEEL+KPVDES DYIKRQQLRELA+LNS+ RE SPGP GSVSPFNS+ MKR KTGR
Subjt:  LNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

AT4G26480.1 RNA-binding KH domain-containing protein4.0e-7955.36Show/hide
Query:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGW
        S   S NFS    + P      +   +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RL+NQEILRV+ ++ N     L + R   PSP+AS  +  N S   ++GW
Subjt:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGW

Query:  -NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
         +  P E+ +S +P    +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLN
Subjt:  -NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        EPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL PV+E+HD+ K+QQLRELA+LN S REE     GS+SP+NS GMKRAKT
Subjt:  EPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT

AT5G56140.1 RNA-binding KH domain-containing protein2.6e-7854.9Show/hide
Query:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS
        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
Subjt:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSS

Query:  TGLSGW-NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP
          ++GW +  P E+ +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
Subjt:  TGLSGW-NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP

Query:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  +VD RL QA+EI+++LL P++E+HD  K+QQLRELA+LN + REE     GSVSP+NS GMKRAKT
Subjt:  GYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGGACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCA
TCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAAGGTTTCTGCGACCTTG
ATAGGCTTCGGCATAGAAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGACTAATGTCAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGCAGAGATTA
AGTAGAGCCCCTGGGATGACAATGGATTGGCAAAGCGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTGCGTTTGGAAATACCCGTTGATACTTATCCCAA
TTTCAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGCGGCAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACCGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCGATAAAGGATC
CAGACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTGAACGAACCACTGCACATCTTGATTGAGGCAGACTTGCCAGCCAATGTTGTTGATATACGACTC
AGACAGGCACAAGAAATTATTGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGATGAGAGTCATGATTACATTAAAAGGCAGCAGTTACGCGAACTCGCAATGCTAAATTCAAGTTTCAG
AGAAGAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGCGTCTCTCCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAAAACAGGTCGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAGAAAAACCCTAAATATTAAAGAGAAATTTCACAGAAGAAAAAGAAAAAAAAAGGAAAAAGAAATTAAAAAGAAAAGAAAACGACGACCATTTACAATCATAGATTT
TCCTCATTTCAGCTTCCACCCTTTTACTCCTTAGCTCCGCCCCCGCCTCCCTCGTCGGAGTTGTCCTTATCCACCATCTTCTCCGGCGACATCCGCTCGCCTTCATCTCC
AAAACCCCACTGCAACTTTCCAATCCCCCAATTCTTGGAACATCCATTTCAGCTCATAGTTCAATAGCTTACAGCTATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTG
CAAGGACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCATCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCG
ATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAAGGTTTCTGCGACCTTGATAGGCTTCGGCATAGAAGCCCTAGTCCAATGGC
TTCTTCAAACCTTATGACTAATGTCAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGCAGAGATTAAGTAGAGCCCCTGGGATGACAATGGATTGGCAAA
GCGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTGCGTTTGGAAATACCCGTTGATACTTATCCCAATTTCAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGC
GGCAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACCGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCGATAAAGGATCCAGACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGG
CTATGAGCACTTGAACGAACCACTGCACATCTTGATTGAGGCAGACTTGCCAGCCAATGTTGTTGATATACGACTCAGACAGGCACAAGAAATTATTGAAGAACTGCTCA
AACCTGTGGATGAGAGTCATGATTACATTAAAAGGCAGCAGTTACGCGAACTCGCAATGCTAAATTCAAGTTTCAGAGAAGAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGCGTCTCT
CCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAAAACAGGTCGGTAAGTGCGCAATATCATTCCATACCCTAAACAATTTCTACCCCAGTCCAAATTTCGGTCACTTATATA
CTGAAGTGAATCATGATCGACCATGTGACATAGCTACGAGAAAGGGGAGGCTAACTTCAGTTCCAGGCGAGCCTTCTGTTGGCTTTTTCTTTGTGTTCCCTTTAATATTC
TTGACAGAAAGACTGGAAAAAAGTTGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAACAGAGGGTAAAAAGGAAAAAAAATTGTTAGTATTAGTAGGGATGGTTTTTCAAGTTGGGTGT
AGGTTTGAATAGGTCAGTTTTTCCAACAAAGTTAATATATTCATTGGATTTATTCTTGTGCTAGTGACTGCTGAGGAGTGTGTAGTTTTATTGCATTATTGATGCAAAAA
CCTTAGGAAGTGATGATGATGTAATACTATTTGATATTTGTTAGGTGTATGCAATGTCAATGTCAATTATATTTTTGGACTGATATATGAAAGAACAGTGCAAAAACTCA
TACAAAAGTGCTTGCTCAGTTTGTGTTTGCTTTTCGAGATTCAGAATATGATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMTNVSSTGLSGWNGLPQEQRL
SRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPLHILIEADLPANVVDIRL
RQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR