; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G16840 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G16840
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionActin cytoskeleton-regulatory complex protein pan1
Genome locationChr4:14210988..14214160
RNA-Seq ExpressionCSPI04G16840
SyntenyCSPI04G16840
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011653736.2 uncharacterized protein LOC101205031 isoform X2 [Cucumis sativus]2.3e-19699.74Show/hide
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XP_038882986.1 uncharacterized protein LOC120074073 [Benincasa hispida]1.3e-15475.34Show/hide
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        H K SD HP+ +T F  EEEEEEEGT K PLPSSTSSS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXX4 Uncharacterized protein6.5e-18987.53Show/hide
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A0A1S3CJA7 uncharacterized protein LOC103501490 isoform X17.7e-18285.22Show/hide
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A0A1S3CKH3 uncharacterized protein LOC103501490 isoform X23.8e-18996.85Show/hide
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A0A5D3C4F3 Actin cytoskeleton-regulatory complex protein pan17.7e-18285.22Show/hide
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A0A6J1IM16 uncharacterized protein LOC1114782449.9e-13769.27Show/hide
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        DK+  E   S TT S    EEEEGT+ +PLPSSTSS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30050.1 unknown protein6.6e-7756.62Show/hide
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        MAYRRRQ ITRASTFKE+I++   + DH  +           S S SS SSLAAQAIRAS+         D S S  F G  +  +   L  +E  Q   
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Query:  CDSK----KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSP--EPNMQTH-HETQ
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Query:  LKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNR-ADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQL
        LKASRDVAMATAAKAKLLLRELKT+KADLAFAKERC+QLEEENK LR+NR+KG+N  ADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQL
Subjt:  LKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNR-ADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQL

Query:  TMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLS---------NSVSPRSPTSPSSP
        TMQDVVY+DEG+EEV EV     +P IT+ LS          S+SP SP+SP+SP
Subjt:  TMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLS---------NSVSPRSPTSPSSP

AT2G30530.1 unknown protein4.2e-6349.44Show/hide
Query:  KEEIHYPSDELDHNSISS------SSSSSSSLAAQAIRASATQRDSSHSSAFAGASSNFSP--------------------------GHLRSK-------
        KE +  P+  + ++S SS      SSS++SSLAA+AIRAS+  RDSS SSA++  SS   P                          G L SK       
Subjt:  KEEIHYPSDELDHNSISS------SSSSSSSLAAQAIRASATQRDSSHSSAFAGASSNFSP--------------------------GHLRSK-------

Query:  -EPCQ--------------STNCDSK-------KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVN
         +P Q              +T   +K       K++NP++++ LDAI++SLN +G T     EEG T VEN+TA IIQETRK +I+KK        P++ 
Subjt:  -EPCQ--------------STNCDSK-------KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVN

Query:  NQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAH
           Q P IQ+         E QLKASRDVAMA AAKAKLLLRELK +K+DLAFAK+RCAQLEEENK+LRENR       DDDL+RLQLETLLAEKARLAH
Subjt:  NQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAH

Query:  ENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLSNSVSP
        ENSIY REN +LR +VEYHQLTMQDVVY DE  EEVTEVYPI+ S  ++    NS +P
Subjt:  ENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLSNSVSP

AT4G02800.1 unknown protein1.3e-2738.29Show/hide
Query:  KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVE----------NKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQL
        K D+  + KG D++S +L+ L    + A +  R + +          N  AD IQ  +K +  ++   ++G      +  +Q    S E   +      +
Subjt:  KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVE----------NKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQL

Query:  KASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTM
        K ++++A++ AAKA  L RELKTIK+DL+F +ERC  LEEENK LR+   KG    +DDL+RLQLE LLAEKARLA+EN+   REN+ L ++VEYHQ+T 
Subjt:  KASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTM

Query:  QDVVYLDEGMEEVTEVYPISTS
        QD   L    E+V + + +  S
Subjt:  QDVVYLDEGMEEVTEVYPISTS

AT5G01970.1 unknown protein4.6e-7855.39Show/hide
Query:  MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDELDHNSISS-SSSSSSSLAAQAIRASATQRDSSHSSAFAGASSNFSPGHLR-SKEPCQSTNCDS-----------K
        MAYRRRQ I + +TFKEE+    D L   SI++    S  + ++ A     ++  ++      G  +  +   +   K   +ST               K
Subjt:  MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDELDHNSISS-SSSSSSSLAAQAIRASATQRDSSHSSAFAGASSNFSPGHLR-SKEPCQSTNCDS-----------K

Query:  KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKG----NNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTH---HETQLKAS
        K DNP +R+GLD +++SLNQ+GDTFEKA+E+GRT+VENKTADIIQETRKLQ R++G    +  +     V++ W+    +SPE  MQ +   HETQLKAS
Subjt:  KTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYEEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKG----NNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTH---HETQLKAS

Query:  RDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRE-NREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQD
        RDVAMATAAKAKLLLRELKT+KADLAFAKERCAQLEEENK LRE +REKG N AD+DLIRLQLE+LLAEKARLAHENS+YARENRFLREIVEYHQLTMQD
Subjt:  RDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRE-NREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQD

Query:  VVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLSNSVSPRSPTSPSSPM
        VVY+DEG EEVT+V     SP ++ ++++S + RS + PS  M
Subjt:  VVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLSNSVSPRSPTSPSSPM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTATAGGAGGAGACAAGCAATCACCAGAGCTTCTACTTTCAAAGAAGAGATCCATTATCCTTCTGACGAACTTGATCACAATTCCATCTCTTCTTCCTCCTCTTC
CTCTTCTTCTCTTGCTGCTCAAGCGATCCGAGCTTCTGCTACTCAACGTGATTCTTCTCATTCCTCTGCCTTTGCCGGTGCTTCCTCCAATTTTTCCCCTGGCCATCTGC
GATCCAAGGAGCCATGTCAGTCAACAAATTGCGACTCAAAGAAAACGGACAATCCGGCAATACGGAAGGGTTTGGATGCAATCTCAACTTCGCTTAATCAACTTGGGGAC
ACATTTGAAAAGGCATATGAGGAAGGTCGCACAATTGTGGAAAATAAGACTGCAGACATAATTCAAGAAACTCGCAAACTGCAGATTAGGAAAAAGGGCAATAATACTGA
AGGGTTATACCCTGCTGTGAATAATCAATGGCAGCAACCGAATATACAGTCTCCAGAACCAAATATGCAAACACATCATGAAACTCAACTGAAGGCATCTCGAGACGTGG
CGATGGCAACAGCTGCCAAAGCCAAACTGTTACTTCGGGAGCTGAAAACCATTAAAGCAGATCTGGCTTTCGCTAAAGAAAGATGTGCACAACTAGAGGAAGAAAACAAA
ATTCTCAGGGAAAACCGGGAGAAGGGAGATAATCGTGCAGATGATGATTTGATTCGGCTTCAACTAGAGACTCTTTTGGCTGAGAAAGCACGTTTGGCGCATGAGAATTC
AATATATGCCAGGGAGAACCGTTTCTTGAGGGAAATTGTGGAGTACCATCAACTGACAATGCAAGATGTGGTTTATTTAGATGAAGGAATGGAAGAAGTTACAGAAGTTT
ATCCCATATCCACCTCTCCAGAGATCACCAAAATGCTTTCTAATTCTGTTTCCCCACGCTCCCCAACCTCACCTTCTTCACCCATGGAAGTTCTTCCTGTTGTTCCTCCT
CCTCCTCCTATTCAATCTAAACAAGATAAGGATCATCATGACAAAGACAGTGATGAACACCCAACTTCCAGTACTACATTTTCTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGG
TACTAAAAAAAACCCATTGCCTTCTAGTACTTCTTCTTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTATAGGAGGAGACAAGCAATCACCAGAGCTTCTACTTTCAAAGAAGAGATCCATTATCCTTCTGACGAACTTGATCACAATTCCATCTCTTCTTCCTCCTCTTC
CTCTTCTTCTCTTGCTGCTCAAGCGATCCGAGCTTCTGCTACTCAACGTGATTCTTCTCATTCCTCTGCCTTTGCCGGTGCTTCCTCCAATTTTTCCCCTGGCCATCTGC
GATCCAAGGAGCCATGTCAGTCAACAAATTGCGACTCAAAGAAAACGGACAATCCGGCAATACGGAAGGGTTTGGATGCAATCTCAACTTCGCTTAATCAACTTGGGGAC
ACATTTGAAAAGGCATATGAGGAAGGTCGCACAATTGTGGAAAATAAGACTGCAGACATAATTCAAGAAACTCGCAAACTGCAGATTAGGAAAAAGGGCAATAATACTGA
AGGGTTATACCCTGCTGTGAATAATCAATGGCAGCAACCGAATATACAGTCTCCAGAACCAAATATGCAAACACATCATGAAACTCAACTGAAGGCATCTCGAGACGTGG
CGATGGCAACAGCTGCCAAAGCCAAACTGTTACTTCGGGAGCTGAAAACCATTAAAGCAGATCTGGCTTTCGCTAAAGAAAGATGTGCACAACTAGAGGAAGAAAACAAA
ATTCTCAGGGAAAACCGGGAGAAGGGAGATAATCGTGCAGATGATGATTTGATTCGGCTTCAACTAGAGACTCTTTTGGCTGAGAAAGCACGTTTGGCGCATGAGAATTC
AATATATGCCAGGGAGAACCGTTTCTTGAGGGAAATTGTGGAGTACCATCAACTGACAATGCAAGATGTGGTTTATTTAGATGAAGGAATGGAAGAAGTTACAGAAGTTT
ATCCCATATCCACCTCTCCAGAGATCACCAAAATGCTTTCTAATTCTGTTTCCCCACGCTCCCCAACCTCACCTTCTTCACCCATGGAAGTTCTTCCTGTTGTTCCTCCT
CCTCCTCCTATTCAATCTAAACAAGATAAGGATCATCATGACAAAGACAGTGATGAACACCCAACTTCCAGTACTACATTTTCTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGG
TACTAAAAAAAACCCATTGCCTTCTAGTACTTCTTCTTCCTAAGGAATTTGATTTTTCTGTTCAAGCTGAAAAAGAAAACTGTGGAAAAGGGGGGGAAAATTTGTTATTT
TTTATTGCATTATTTATATTCTTTGTTCTTTGATGTGTGAGGGAGTGAAATTACAGAAGAATTGCGTGGGAGGGGAGGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDELDHNSISSSSSSSSSLAAQAIRASATQRDSSHSSAFAGASSNFSPGHLRSKEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGD
TFEKAYEEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENK
ILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKMLSNSVSPRSPTSPSSPMEVLPVVPP
PPPIQSKQDKDHHDKDSDEHPTSSTTFSEEEEEEEEGTKKNPLPSSTSSS