| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| BBN69746.1 VIRB2-interacting protein 2 [Prunus dulcis] | 4.6e-105 | 46.51 | Show/hide |
Query: KLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSI
+L+ +K +K WNKE FG + S K+ +I LD +E L+ KERE+ + DL+ KE+ W Q+ K+ W R+G+ N+ FFH S R+ ++
Subjt: KLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSI
Query: LSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSDLV
+ L G +V+E EI EI++FF NLY + + + + + LNW +S++++ L+ PF E+E++ VF+ G KSPGPDG + ++ W+I+K DL+
Subjt: LSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSDLV
Query: RVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRKGV
+V DFF GIIN NET+I LIPKKKE+ +VSDFRPISL+TSLYK++SKVL +RL++VL S I+ Q AFV+GRQILDA L A+E V+E + G+
Subjt: RVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRKGV
Query: LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFEN
+ K+DLEKAYD V+W F+D + KGFG R R WI GCL T NFS+++NGRPRGK A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ + G N
Subjt: LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFEN
Query: LSEDLTHLQYADDTL
+++HLQ+ADDT+
Subjt: LSEDLTHLQYADDTL
|
|
| CAN75040.1 hypothetical protein VITISV_026478 [Vitis vinifera] | 2.7e-105 | 45.24 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K+ LK WN TFG + +K++++ ++ +D +E+ LN + V ER R L D+++KE+ W QKS++ W++EG+ NS FFH + R+S+
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ SL+S G+TL ++I +EI++FF NLY + + + ++W +S + L+ PFTE+E+R VF++ K+PGPDG T Y++ W+++K D
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
L+RVF +F NG+IN+ N T+I L+PKK ++ ++SD+RPISL+TSLYK+I+KVL RL+KVL I+DSQ AFVEGR ILDA+L A+E VDE G +
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD VDW FLD ++ KGF ++ R WI GCLS+++F+I+VNG +G + A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ E +GF
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
++ LQ+ADDT+ S
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
|
|
| PRQ36601.1 putative RNA-directed DNA polymerase [Rosa chinensis] | 3.5e-105 | 46.04 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K LK W++ETFG I +K+V+ +IN LD E S+ + +ERE RG L +L ++E+ W Q++KL W +EG+ N+ FFH V+ R+ +
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+++ L G + E I +EI+ F+ NLY ++ F + L+W +S++ + LE PF E+EI+ VFE +KSPGPDG + +++W ++K +
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
++ V +F NG++N+ NETYI LIPKK + +V D+RPISLITSLYK+I+KVL RL++VL I+ +Q AF++GRQILDA+L A+E VDE + ++
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD V+W+FLD AM+ KGFG R RKWI GCL + NFSI +NGRPRGK A RG+RQGDPL+ FLFT+V D L+ + R ++G
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTL
++THLQ+ADDT+
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTL
|
|
| RVW64408.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Vitis vinifera] | 2.7e-105 | 45.24 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K+ LK WN TFG + +K++++ ++ +D +E+ LN + V ER R L D+++KE+ W QKS++ W++EG+ NS FFH + R+S+
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ SL+S G+TL ++I +EI++FF NLY + + + ++W +S + L+ PFTE+E+R VF++ K+PGPDG T Y++ W+++K D
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
L+RVF +F NG+IN+ N T+I L+PKK ++ ++SD+RPISL+TSLYK+I+KVL RL+KVL I+DSQ AFVEGR ILDA+L A+E VDE G +
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD VDW FLD ++ KGF ++ R WI GCLS+++F+I+VNG +G + A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ E +GF
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
++ LQ+ADDT+ S
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
|
|
| RVW97045.1 Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein [Vitis vinifera] | 1.6e-105 | 45.48 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K+ LK WN TFG + +K++++ ++ +D +E+ LN + V ER R L D+++KE+ W QKS++ W++EG+ NS FFH + RKS+
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ SL+S G+TL ++I +EI++FF NLY + + + ++W +S + L+ PFTE+E+R VF++ K+PGPDG T Y++ W+++K D
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
L+RVF +F NG+IN+ N T+I L+PKK ++ ++SD+RPISL+TSLYK+I+KVL RL+KVL I+DSQ AFVEGR ILDA+L A+E VDE G +
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD VDW FLD ++ KGF ++ R WI GCLS+++F+I+VNG +G + A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ E +GF
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
++ LQ+ADDT+ S
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A2P6QQZ3 Putative RNA-directed DNA polymerase | 1.7e-105 | 46.04 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K LK W++ETFG I +K+V+ +IN LD E S+ + +ERE RG L +L ++E+ W Q++KL W +EG+ N+ FFH V+ R+ +
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+++ L G + E I +EI+ F+ NLY ++ F + L+W +S++ + LE PF E+EI+ VFE +KSPGPDG + +++W ++K +
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
++ V +F NG++N+ NETYI LIPKK + +V D+RPISLITSLYK+I+KVL RL++VL I+ +Q AF++GRQILDA+L A+E VDE + ++
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD V+W+FLD AM+ KGFG R RKWI GCL + NFSI +NGRPRGK A RG+RQGDPL+ FLFT+V D L+ + R ++G
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTL
++THLQ+ADDT+
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTL
|
|
| A0A438FWU5 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 1.3e-105 | 45.24 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K+ LK WN TFG + +K++++ ++ +D +E+ LN + V ER R L D+++KE+ W QKS++ W++EG+ NS FFH + R+S+
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ SL+S G+TL ++I +EI++FF NLY + + + ++W +S + L+ PFTE+E+R VF++ K+PGPDG T Y++ W+++K D
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
L+RVF +F NG+IN+ N T+I L+PKK ++ ++SD+RPISL+TSLYK+I+KVL RL+KVL I+DSQ AFVEGR ILDA+L A+E VDE G +
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD VDW FLD ++ KGF ++ R WI GCLS+++F+I+VNG +G + A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ E +GF
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
++ LQ+ADDT+ S
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
|
|
| A0A438IK87 Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein | 7.6e-106 | 45.48 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K+ LK WN TFG + +K++++ ++ +D +E+ LN + V ER R L D+++KE+ W QKS++ W++EG+ NS FFH + RKS+
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ SL+S G+TL ++I +EI++FF NLY + + + ++W +S + L+ PFTE+E+R VF++ K+PGPDG T Y++ W+++K D
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
L+RVF +F NG+IN+ N T+I L+PKK ++ ++SD+RPISL+TSLYK+I+KVL RL+KVL I+DSQ AFVEGR ILDA+L A+E VDE G +
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD VDW FLD ++ KGF ++ R WI GCLS+++F+I+VNG +G + A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ E +GF
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
++ LQ+ADDT+ S
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
|
|
| A0A5E4GN72 PREDICTED: RNA-directed DNA polymerase (Fragment) | 2.2e-105 | 46.51 | Show/hide |
Query: KLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSI
+L+ +K +K WNKE FG + S K+ +I LD +E L+ KERE+ + DL+ KE+ W Q+ K+ W R+G+ N+ FFH S R+ ++
Subjt: KLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSI
Query: LSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSDLV
+ L G +V+E EI EI++FF NLY + + + + + LNW +S++++ L+ PF E+E++ VF+ G KSPGPDG + ++ W+I+K DL+
Subjt: LSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSDLV
Query: RVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRKGV
+V DFF GIIN NET+I LIPKKKE+ +VSDFRPISL+TSLYK++SKVL +RL++VL S I+ Q AFV+GRQILDA L A+E V+E + G+
Subjt: RVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRKGV
Query: LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFEN
+ K+DLEKAYD V+W F+D + KGFG R R WI GCL T NFS+++NGRPRGK A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ + G N
Subjt: LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFEN
Query: LSEDLTHLQYADDTL
+++HLQ+ADDT+
Subjt: LSEDLTHLQYADDTL
|
|
| A5BV95 Reverse transcriptase domain-containing protein | 1.3e-105 | 45.24 | Show/hide |
Query: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
M KLK +K+ LK WN TFG + +K++++ ++ +D +E+ LN + V ER R L D+++KE+ W QKS++ W++EG+ NS FFH + R+S+
Subjt: MEKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSK
Query: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ SL+S G+TL ++I +EI++FF NLY + + + ++W +S + L+ PFTE+E+R VF++ K+PGPDG T Y++ W+++K D
Subjt: SILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
L+RVF +F NG+IN+ N T+I L+PKK ++ ++SD+RPISL+TSLYK+I+KVL RL+KVL I+DSQ AFVEGR ILDA+L A+E VDE G +
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
G++ K+D EKAYD VDW FLD ++ KGF ++ R WI GCLS+++F+I+VNG +G + A RG+RQGDPL+PFLFT+V D S ++ E +GF
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
++ LQ+ADDT+ S
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLLSS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O00370 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 1.7e-30 | 26.59 | Show/hide |
Query: VSARKSKSILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISS----PFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEF
+ ++ K+ + ++ + +G EI I ++ +LY ++ + D L+ ++ L P T EI ++ + KSPGPDG T EF
Subjt: VSARKSKSILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISS----PFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEF
Query: YKKSWNILKSDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKK-KEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTAS
Y++ L L+++FQ K GI+ E I LIPK ++ + +FRPISL+ K+++K+L R+++ + +I+ Q+ F+ G Q I +
Subjt: YKKSWNILKSDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKK-KEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTAS
Query: EAVDEWS-LRGRKGVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIH
+ + + + V++ +D EKA+DK+ F+ + G K I +II+NG+ K G RQG PL+P LF IV + L
Subjt: EAVDEWS-LRGRKGVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIH
Query: YCNEKRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
+++ +KG E++ +ADD ++
Subjt: YCNEKRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
|
|
| P08548 LINE-1 reverse transcriptase homolog | 7.0e-32 | 26.78 | Show/hide |
Query: KLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSI
K L+A LK +E + + L EE S KE R L ++ K I KSK + + + ++ KS+
Subjt: KLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSI
Query: LSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISS----PFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILK
+SS+ + + EI + ++ LY + + + + LS ++ +L P + EI + + KSPGPDG T EFY+ L
Subjt: LSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISS----PFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILK
Query: SDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKK-KEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWS-L
L+ +FQ+ K GI+ E I LIPK K+ R ++RPISL+ K+++K+L R+++ + II+ Q+ F+ G Q I + + + L
Subjt: SDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKK-KEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWS-L
Query: RGRKGVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLK
+ + ++L +D EKA+D + F+ +K G K I S +II+NG + G RQG PL+P LF IV + + I E++++K
Subjt: RGRKGVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLK
Query: GFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
G H SE++ +ADD ++
Subjt: GFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
|
|
| P11369 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 2.5e-29 | 28.13 | Show/hide |
Query: KSKSILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISS----PFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKS
+ K +++ + + +G +EI + I SF+ LY T++ + D L+ L P + KEI V+ + KSPGPDG + EFY+
Subjt: KSKSILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISS----PFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKS
Query: WNILKSDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPK-KKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVD
L L ++F G + E I LIPK +K+ ++ +FRPISL+ K+++K+L R+++ + +II+ Q+ F+ G Q I + +
Subjt: WNILKSDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPK-KKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVD
Query: EWS-LRGRKGVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNE
+ L+ + +++ LD EKA+DK+ F+ ++ G I S +I VNG I K G RQG PL+P+LF IV + L +
Subjt: EWS-LRGRKGVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNE
Query: KRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
++ +KG E++ ADD ++
Subjt: KRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
|
|
| P14381 Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein | 2.3e-38 | 27.27 | Show/hide |
Query: LKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLD---SLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSIL
LK + + + K G+ ++ + L ++ L+ S E L E ++ +E AL ++ ++ + +S++ L + + S FF+ + ++ +
Subjt: LKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLD---SLEESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSARKSKSIL
Query: SSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGL---SLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
+ L + +G L + I D SF+ NL+ SP C+ L W GL S + LE P T E+ + + M KSPG DGLT EF++ W+ L D
Subjt: SSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYGTRISSPFICDILNWRGL---SLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFYKKSWNILKSD
Query: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
RV + FK G + C + L+PKK + + ++RP+SL+++ YK+++K + RLK VL +I+ Q V GR I D + + + G
Subjt: LVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRK
Query: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
L LD EKA+D+VD +L ++ FG + ++ ++ + +N + RG+RQG PL+ L+++ + CL+ ++ L G
Subjt: GVLLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHF
Query: ENLSEDLTHLQYADDTLL
+ + YADD +L
Subjt: ENLSEDLTHLQYADDTLL
|
|
| Q03274 Retrovirus-related Pol polyprotein from type-1 retrotransposable element R2 (Fragment) | 2.1e-15 | 29.27 | Show/hide |
Query: SPGPDGLTGEFYKKSWNILKSDLVRVF-QDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEG
+PG DGLT + I ++ L R F Q G + LIPK + S++RPI++ ++L +++ ++L RL+ + ++ +Q +
Subjt: SPGPDGLTGEFYKKSWNILKSDLVRVF-QDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVISKVLPTRLKKVLPSIINDSQMAFVEG
Query: RQILDAILTASEAVDEW--SLRGRKGV--LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVN-GRPRGKIIAKRGIRQGDPLAP
+D L S +D + S R ++ ++ LD+ KA+D V S + A++ G + +I G LS + +I V G KI +RG++QGDPL+P
Subjt: RQILDAILTASEAVDEW--SLRGRKGV--LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGFGKRCRKWIWGCLSTTNFSIIVN-GRPRGKIIAKRGIRQGDPLAP
Query: FLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
FLF V D C + +S G E + L +ADD LL
Subjt: FLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDTLL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G43760.1 DNAse I-like superfamily protein | 2.2e-25 | 29.77 | Show/hide |
Query: EKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSL-----EESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSA
E LK K K N++ FG I + + +D + + S +S E +++ N A L + + QKS++ WL++G+ N+ FFH + A
Subjt: EKLKGLKAILKSWNKETFGKIFSQKQVLIDKINYLDSL-----EESSCLNEENVKERENCRGALLDLIVKEQKLWIQKSKLHWLREGEENSSFFHIWVSA
Query: RKSKSILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYG------TRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFY
++K+++ L + + ++ + I++++++L G T S I DI +R S L +P ++KEI VF M K+PGPD T EF+
Subjt: RKSKSILSSLVSIEGKTLVTEKEIVDEILSFFSNLYG------TRISSPFICDILNWRGLSLQDSSLLEVPFTEKEIREVVFEMGCLKSPGPDGLTGEFY
Query: KKSWNILKSDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVIS
+SW ++K + ++FF+ G + +R N T I LIPK ++S FRP+S T +YK+I+
Subjt: KKSWNILKSDLVRVFQDFFKNGIINRRCNETYIYLIPKKKEAARVSDFRPISLITSLYKVIS
|
|
| AT4G20520.1 RNA binding;RNA-directed DNA polymerases | 8.6e-09 | 43.42 | Show/hide |
Query: RLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRKGV----LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGF
RLK ++ ++I +Q +F+ GR D I+ EAV S+R +KGV LLKLDLEKAYD++ W +L+ + GF
Subjt: RLKKVLPSIINDSQMAFVEGRQILDAILTASEAVDEWSLRGRKGV----LLKLDLEKAYDKVDWSFLDMAMKLKGF
|
|
| ATMG01250.1 RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase) | 9.2e-11 | 42.65 | Show/hide |
Query: IVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDT
I+NG P+G + RG+RQGDPL+P+LF + + S L E+ L G N S + HL +ADDT
Subjt: IVNGRPRGKIIAKRGIRQGDPLAPFLFTIVGDAPSCLIHYCNEKRSLKGFHFENLSEDLTHLQYADDT
|
|
