; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G21650 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G21650
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationChr4:20118094..20121950
RNA-Seq ExpressionCSPI04G21650
SyntenyCSPI04G21650
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000630 - Ribosomal protein S8
IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF7133456.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim09G0164200 [Rhododendron simsii]1.2e-6792.36Show/hide
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KAF7148267.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim03G0129000 [Rhododendron simsii]2.1e-67100Show/hide
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KAG5557696.1 hypothetical protein RHGRI_007820 [Rhododendron griersonianum]2.1e-67100Show/hide
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TYG88070.1 hypothetical protein ES288_A13G265900v1 [Gossypium darwinii]5.5e-6873.68Show/hide
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XP_004144630.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucumis sativus]2.1e-67100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZP3 Uncharacterized protein9.4e-82100Show/hide
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A0A1S3CPB7 40S ribosomal protein S15a-11.0e-67100Show/hide
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A0A5A7SSH5 40S ribosomal protein S15a-11.0e-67100Show/hide
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A0A5D2E487 Uncharacterized protein2.6e-6873.68Show/hide
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K3XLU5 30S ribosomal protein S8, chloroplastic7.7e-6891.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-36.5e-6490Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-13.0e-6996.92Show/hide
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Q00332 40S ribosomal protein S15a8.8e-6996.15Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a7.4e-6895.38Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-43.9e-6996.92Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A2.1e-7096.92Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A2.1e-7096.92Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein2.1e-6588.06Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D2.8e-7096.92Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein2.1e-7096.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCGTTAAAGGTGGATGGTCGGAGTATATGCCTCTAGAGTTCGTCATCAAAGGTGCCGTTGAAGAAGCAGAAGCCCTAATTCCCATTCGAACTCTGCAATTTTCGTC
TTCTGGCCTCCCTTCTCTCTCGGTAATAATGGTGCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCGCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGAGGGAAGCGTCAGGTCATGATAA
GACCGTCTTCTAAAGTTATCATCAAGTTTCTTCTCGTTATGCAGAAGCACGGATACATTGGGGAGTTTGAGTTCGTTGATGACCATAGATCAGGGAAAATTGTTGTTGAG
CTGAATGGGAGACTTAACAAATGTGGTGTCATAAGTCCCCGTTTTGATGTCGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCTAGGTTGCTACCCTCTAGACAGTTTGGATT
CATCGTCTTGACTACATCTGCGGGAATCATGGATCACGAAGAGGCCAGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAAGTGCTTGGTTTCTTTTACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCGTTAAAGGTGGATGGTCGGAGTATATGCCTCTAGAGTTCGTCATCAAAGGTGCCGTTGAAGAAGCAGAAGCCCTAATTCCCATTCGAACTCTGCAATTTTCGTC
TTCTGGCCTCCCTTCTCTCTCGGTAATAATGGTGCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCGCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGAGGGAAGCGTCAGGTCATGATAA
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TCATTGCAATTTTCTCAGACAGCAATTATGTTCCCTCACCCACCCATCAATTTGTGTGTTCTATATCATATTTATGTATGATTCCTTCTCCATCTTTTGATGATTCTTTT
CAATTCTTCTATCTTACAATTACATGATCCTTTTGGGCAACTTTAATAGATAATTCTAGAAGTGAAAATTGGAGACTTAGTTTTGGTAGAATGAACCACCATGGTTTTTG
ATCACTGTTCCAAATGATTTGTTCAGTCTAGACAACTATATGTGCTATGGTTGAGATATGAATGGCGAGCTTTGCGTGTATAGGATTTCTTCTAACTTGGGTTTGAACAA
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AATTACATACTTCAAATCCAGAAATTGAGACACAGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVVKGGWSEYMPLEFVIKGAVEEAEALIPIRTLQFSSSGLPSLSVIMVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLLVMQKHGYIGEFEFVDDHRSGKIVVE
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