; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G22730 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G22730
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGLYCINE RICH PROTEIN 9
Genome locationChr4:21000212..21001494
RNA-Seq ExpressionCSPI04G22730
SyntenyCSPI04G22730
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB5590809.1 hypothetical protein CTheo_5741 [Ceratobasidium theobromae]3.1e-0949.33Show/hide
Query:  FGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGG--HYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKE
        F L   +LF+ +           V +  L   GG +GGG H GGGH+GGGGH+ GGGH+GGGGH+GGG  H GGGH+GGGGH+GGGH+G        T+ 
Subjt:  FGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGG--HYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKE

Query:  SNDQGLDKHGGGH---GGHH-GGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHH
         +  G   HGGGH   GGHH GGGHHG          HGGG HH  G HH
Subjt:  SNDQGLDKHGGGH---GGHH-GGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHH

XP_008463760.1 PREDICTED: cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo]1.3e-4776.51Show/hide
Query:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH
        MTYPKTLIG GLLLALLFISSQVSARLLEEDKVK+DGLDYHGG YGGGGHY GGGHYGGGGHY GGGHYGGGGHYGGGH        GGHYGGGHYGGGH
Subjt:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH

Query:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
        GLDA+TK+ NDQGLD     HGGHHGGGH            HGG      GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

XP_010488629.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein-like [Camelina sativa]2.0e-0854.55Show/hide
Query:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSA-------RLLEEDKVKSDGL---DYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHY---GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGG
        K LI  G L A+L + S+VSA       +   E+KV+ +G     + GG YGGGGHYGGG  GGGGHY   GGGHYGGGG  GGGHYGGG  GGGGHYGG
Subjt:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSA-------RLLEEDKVKSDGL---DYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHY---GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGG

Query:  ----GHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGG--GHGGHHGGGHHGLDADVKNLDS
            GH GGGHGLD         G   HGG  GHGG HGGG HGL+  V+   S
Subjt:  ----GHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGG--GHGGHHGGGHHGLDADVKNLDS

XP_011654035.2 cold and drought-regulated protein CORA [Cucumis sativus]1.7e-7694.77Show/hide
Query:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGL
        MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDY GGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGL
Subjt:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGL

Query:  DANTKESNDQGLDK--------HGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
        DANTKESNDQGLDK        HGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  DANTKESNDQGLDK--------HGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

XP_038900076.1 histidine-rich glycoprotein-like [Benincasa hispida]4.9e-1042.77Show/hide
Query:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDK--VKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH
        M Y KTL+  GLLLALLF+SS VSARLLEEDK  V+SD                                   H+G  H+  GH+    H+  GH+   H
Subjt:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDK--VKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH

Query:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHG--GGHHGLDADVKNLDSH----GGGHHHDHGHHHCHHPH-CPESVKN
        G   +  ++N  GLD H G HGG HG  GGHHG DA+V +LD H        HHDHGH H HH H   +SVKN
Subjt:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHG--GGHHGLDADVKNLDSH----GGGHHHDHGHHHCHHPH-CPESVKN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4K0 Uncharacterized protein3.5e-6294.04Show/hide
Query:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGL
        MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDY GGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGL
Subjt:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGL

Query:  DANTKESNDQGLDK--------HGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGG
        DANTKESNDQGLDK        HGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGG
Subjt:  DANTKESNDQGLDK--------HGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGG

A0A1S3CJZ6 cold and drought-regulated protein CORA-like6.3e-4876.51Show/hide
Query:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH
        MTYPKTLIG GLLLALLFISSQVSARLLEEDKVK+DGLDYHGG YGGGGHY GGGHYGGGGHY GGGHYGGGGHYGGGH        GGHYGGGHYGGGH
Subjt:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH

Query:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
        GLDA+TK+ NDQGLD     HGGHHGGGH            HGG      GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

A0A5D3DWK2 Cold and drought-regulated protein CORA-like6.3e-4876.51Show/hide
Query:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH
        MTYPKTLIG GLLLALLFISSQVSARLLEEDKVK+DGLDYHGG YGGGGHY GGGHYGGGGHY GGGHYGGGGHYGGGH        GGHYGGGHYGGGH
Subjt:  MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGH

Query:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
        GLDA+TK+ NDQGLD     HGGHHGGGH            HGG      GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

A0A5N5QGQ4 Uncharacterized protein1.5e-0949.33Show/hide
Query:  FGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGG--HYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKE
        F L   +LF+ +           V +  L   GG +GGG H GGGH+GGGGH+ GGGH+GGGGH+GGG  H GGGH+GGGGH+GGGH+G        T+ 
Subjt:  FGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGG--HYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKE

Query:  SNDQGLDKHGGGH---GGHH-GGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHH
         +  G   HGGGH   GGHH GGGHHG          HGGG HH  G HH
Subjt:  SNDQGLDKHGGGH---GGHH-GGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHH

A0A5N5QPH9 Uncharacterized protein4.9e-0858.4Show/hide
Query:  GGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGG--HYGGGHYGGGGHY-GGGHYGGG----HGLDANTKESNDQGLDKH-GGGH---GGHH-GGGH
        GG +GGGGH+ GGGH+GGGGH+ GGGH+GGGGH+GGG  H GGGH+GGGGH+ GGGH+GGG    H  D +  E +  G   H GGGH   GGHH GGGH
Subjt:  GGRYGGGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGG--HYGGGHYGGGGHY-GGGHYGGG----HGLDANTKESNDQGLDKH-GGGH---GGHH-GGGH

Query:  HGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHH
        HG          HGGG HH  G HH
Subjt:  HGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05440.3 GLYCINE RICH PROTEIN 94.8e-0848.61Show/hide
Query:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHY-GGGGHY--GG
        K LI  GL   LL +S   +AR     K +S+          G   HGG  GGGGH  GGH GGGGH   G+ GGGGHYGG   GGGHY GGGGHY  GG
Subjt:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHY-GGGGHY--GG

Query:  GHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK
        GHYGGG+                  GG GGHHGGG HGL+  V+
Subjt:  GHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK

AT2G05440.4 GLYCINE RICH PROTEIN 99.8e-0950.65Show/hide
Query:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGH------YGGGHY-GGGGHY--GGGHY--GGGHY
        K LI  GL   LL +S   +AR     K +S+          G   HGG  GGGGH  GGH GGGGH       GGGHY GGGGHY  GGGHY  GGGHY
Subjt:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGH------YGGGHY-GGGGHY--GGGHY--GGGHY

Query:  --GGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK
          GGGGH GGGHYGGG G               +GGG GGHHGGG HGL+  V+
Subjt:  --GGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK

AT2G05440.5 GLYCINE RICH PROTEIN 92.8e-0850.34Show/hide
Query:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHY--GGGHY--GGGHY--GGGGH
        K LI  GL   LL +S   +AR     K +S+          G   HGG  GGGGH  GGH GGGGH   G+ GGGGHY  GGGHY  GGGHY  GGGGH
Subjt:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHY--GGGHY--GGGHY--GGGGH

Query:  YGGGHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK
         GGGHYGGG G               +GGG GGHHGGG HGL+  V+
Subjt:  YGGGHYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK

AT2G05440.7 GLYCINE RICH PROTEIN 96.3e-0849.65Show/hide
Query:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHY--GGGGHYGGG
        K LI  GL   LL +S   +AR     K +S+          G   HGG  GGGGH  GGH GGGGH   G+ GGGGHYGG   GGGHY  GGGGH GGG
Subjt:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSD----------GLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHY--GGGGHYGGG

Query:  HYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK
        HYGGG G               +GGG GGHHGGG HGL+  V+
Subjt:  HYGGGHGLDANTKESNDQGLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVK

AT2G05510.1 Glycine-rich protein family4.4e-0952.14Show/hide
Query:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGG-GGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGH----YGGGHYGGGHY-GGGGHYGGGHYGGGH
        K LI  GL   LL +S   +AR     K +S+      G +GG GGH GGGHYGGGGH  GGH GGGGH    YGGGH  GGHY GGGGHYGG   GGGH
Subjt:  KTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGG-GGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGH----YGGGHYGGGHY-GGGGHYGGGHYGGGH

Query:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGH---GGHHGGGHHGLDADVK
        G                GGGH   GGHHGGG HGL+  V+
Subjt:  GLDANTKESNDQGLDKHGGGH---GGHHGGGHHGLDADVK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTACCCTAAAACCCTTATCGGTTTCGGTCTCCTCCTCGCTCTTCTTTTCATCTCCTCACAGGTCTCCGCTCGTCTACTCGAGGAAGACAAAGTTAAGTCCGATGG
CTTAGATTATCACGGAGGACGCTACGGCGGAGGAGGACACTACGGCGGAGGTCACTACGGCGGAGGAGGTCACTATGGTGGGGGTCACTATGGCGGAGGAGGTCACTATG
GCGGAGGTCACTACGGTGGAGGTCACTATGGTGGAGGAGGTCACTACGGCGGGGGACACTATGGTGGAGGACATGGCCTTGATGCTAACACCAAAGAGTCAAATGACCAA
GGTCTAGATAAACATGGCGGAGGACACGGTGGACACCACGGTGGAGGACATCATGGCCTTGATGCTGACGTGAAAAACTTGGACAGTCATGGCGGTGGCCACCACCACGA
CCACGGCCACCACCACTGCCACCACCCCCACTGCCCCGAGAGTGTTAAGAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAACCCAAAACTCCAACTCTCTATAAATTGATAGTGATAATGCAATGTTTAAGCACCAAAAAATAGCAAAGTAACTTAGCAAAAACACTTGGCATTTCCAACTTAGCTT
TGTTAACCCAAAAATGACTTACCCTAAAACCCTTATCGGTTTCGGTCTCCTCCTCGCTCTTCTTTTCATCTCCTCACAGGTCTCCGCTCGTCTACTCGAGGAAGACAAAG
TTAAGTCCGATGGCTTAGATTATCACGGAGGACGCTACGGCGGAGGAGGACACTACGGCGGAGGTCACTACGGCGGAGGAGGTCACTATGGTGGGGGTCACTATGGCGGA
GGAGGTCACTATGGCGGAGGTCACTACGGTGGAGGTCACTATGGTGGAGGAGGTCACTACGGCGGGGGACACTATGGTGGAGGACATGGCCTTGATGCTAACACCAAAGA
GTCAAATGACCAAGGTCTAGATAAACATGGCGGAGGACACGGTGGACACCACGGTGGAGGACATCATGGCCTTGATGCTGACGTGAAAAACTTGGACAGTCATGGCGGTG
GCCACCACCACGACCACGGCCACCACCACTGCCACCACCCCCACTGCCCCGAGAGTGTTAAGAATTAGAACACTAAAACCTACTCCCCATCTGCAACCATGTTTGGTTCA
AAATAAAAGCATCGTTGAAATAAAGTTTGTTTAATGTGTGTGTTGTGTTTTAAATTTAAATAAAGCATAAGATATGTTGTATGAAATGAGGATGATGCTAAATTATTATA
CTTCGGTTTATTACAACCTATGATCTTTCTAGTTTTCATATTATATATATGTGTAATGTCAAACTATATATAAACTCGATTTTACTTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTYPKTLIGFGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKSDGLDYHGGRYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGHGLDANTKESNDQ
GLDKHGGGHGGHHGGGHHGLDADVKNLDSHGGGHHHDHGHHHCHHPHCPESVKN