CuGenDBv2

Gene ID	CSPI04G23230
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	ARM repeat superfamily protein
Genome location	Chr4:21354833..21364493
RNA-Seq Expression	CSPI04G23230
Synteny	CSPI04G23230
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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XP_008463698.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1 [Cucumis melo]

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XP_022940916.1 uncharacterized protein LOC111446360 [Cucurbita moschata]

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A0A0A0L246 Uncharacterized protein

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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC111446360

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        SVASAVYN+NLL+LLESEI+NS DTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTSFLQLL SIISN SAESILRSRAMVI GRLLSKENIFSLVDESC+R LI
Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLI

Query:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA
        SA+D ILGSSEG+DVNV E+A EALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+VI AAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE+RSENDIMLNDNAEENLRDLIYQ A
Subjt:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS KMTPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQDI+NIV DAS+ETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AV+NGPYL+RR +ETQPAIMTAERF
Subjt:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

2.3e-253

86.48

Show/hide

Query:  MEEFSVNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLAC
        MEEF+V+DPT+LL+AAA+FANYPGVRTD SVKEF  RFPLP +INALQ KAE PGLE+ LVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQ VR+LAC
Subjt:  MEEFSVNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLAC

Query:  KTVTRLLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTVTRLL+E+D T     QLI+DY IYPLL++CLLNGNEQVANSSMD++K LAAFP+GMEII P+NKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
Subjt:  KTVTRLLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS

Query:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLI
        SVASAVYN+NLL+LLESEI+NS DTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTSFLQLL SIISN SAESILRSRAMVI GRLLSKENIFSLVDESC+R LI
Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLI

Query:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA
        S++D ILGSSEG+DVNV E+A EALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+VI AAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE+RSENDIMLNDNAEENL DLIYQ A
Subjt:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS K+TPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQDI+NIV DAS+ETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AV+NGPYL+RR +ETQPAIMTAERF
Subjt:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

1.4e-165

56.54

Show/hide

Query:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR
        + D  +L  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+ LV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   +S +QL+++ GIYPLLLD ++N +++VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLISAVDG
        V  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E+ ++ LISA+DG
Subjt:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLISAVDG

Query:  ILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK
         L S E  D +  EAAI+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI GE+R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K
Subjt:  ILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK

Query:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG
        +TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL EI +K++I+NIV DA++ET KI MEARYNCC AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+G
Subjt:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG

Query:  PYLNRRNVETQPAIMTAERF
        PY+++++   +P +MT E F
Subjt:  PYLNRRNVETQPAIMTAERF

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

9.2e-162

53.44

Show/hide

Query:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR
        + D  +L  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+ LV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   +S +QL+++ GIYPLLLD ++N +++VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDES-----------
        V  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E+           
Subjt:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDES-----------

Query:  ---------------------CLRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF
                             C++ LISA+DG L S E  D +  EAAI+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI 
Subjt:  ---------------------CLRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF

Query:  GESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCL
        GE+R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K+TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL EI +K++I+NIV DA++ET KI MEARYNCC 
Subjt:  GESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCL

Query:  AIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+++++   +P +MT E F
Subjt:  AIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTTTCTGTTAATGATCCGACTCGGCTACTCCAAGCAGCTGCAAACTTCGCTAATTATCCCGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCG
CTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAATTTCCTGGTCTAGAGGATGCTTTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGAG
CTTCTCTTATACCGCATTACATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACAGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAACCTTAGCTTGTAAAACGGTTACTCGCCTCTTGCAGGAGTCT
GATGAAACTGCTCTTTCGCCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCCACTTTTGCTAGACTGCCTTCTGAATGGTAACGAACAAGTTGCTAACTCATCGATGGA
TTCAATTAAGACATTAGCTGCATTTCCACAGGGGATGGAAATCATCATCCCATCAAATAAAACAGAAGCAACACACCTAGGAACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGG
GAAGAGTTCGAGTCATGGCATTGGTAGTGAAGCTATTTTCAGTTTCTAGCTCTGTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAAT
AATTCAAAGGACACACTTGTAACTTTAAGTGTTTTGGAACTCTTGTATGAGCTAGTGGAGATTGAACACGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTACT
AGGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCCATGGTCATTTGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACATCTTCTCGCTTGTAGATGAAT
CATGTCTGCGGAATTTGATATCTGCTGTAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGAGAGGATGTAAATGTATCTGAAGCTGCAATTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCC
AGCACATGGGGAGCCACCTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACCTGTGTGAAGCATGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAACATGGTAAACAGCTGGCAGCCATGCA
TGCTCTTGGTAACATCTTCGGGGAAAGTCGATCAGAGAATGATATTATGCTAAATGATAATGCAGAAGAAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTT
CAAAAATGACACCCTCAGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGTCTA
ACAGAGATCTGCTCGAAACAAGACATAGTAAATATAGTTGGTGATGCAAGTTCTGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGGCTATCCATAA
GGCCTTCATGTCTTCACCTAGGCTTACTGGCGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCAAAGCTGCAGGAAGCGGTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATGTTG
AAACTCAACCAGCTATAATGACAGCTGAAAGATTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTTATTATCTTCCATAAGCGTTTTCTTGAGGCGGTGGTATTCGTCTTCCATCGGATGTGACCAAACAAGAAGAATCGAAATCGACTGAAAAAATTATTCTCACAGCACC
ACTCTCCCATTCTTTTCCCATTTTCGCACTCATACAAAGCCTCCGTGAAGCGAAGAAATGGAGGAATTTTCTGTTAATGATCCGACTCGGCTACTCCAAGCAGCTGCAAA
CTTCGCTAATTATCCCGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCGCTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAATTTCCTG
GTCTAGAGGATGCTTTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGAGCTTCTCTTATACCGCATTACATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACAGGCAGAT
TCTCAAACAGTTAGAACCTTAGCTTGTAAAACGGTTACTCGCCTCTTGCAGGAGTCTGATGAAACTGCTCTTTCGCCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCC
ACTTTTGCTAGACTGCCTTCTGAATGGTAACGAACAAGTTGCTAACTCATCGATGGATTCAATTAAGACATTAGCTGCATTTCCACAGGGGATGGAAATCATCATCCCAT
CAAATAAAACAGAAGCAACACACCTAGGAACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGGGAAGAGTTCGAGTCATGGCATTGGTAGTGAAGCTATTTTCAGTTTCTAGCTCT
GTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAATAATTCAAAGGACACACTTGTAACTTTAAGTGTTTTGGAACTCTTGTATGAGCT
AGTGGAGATTGAACACGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTACTAGGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCCA
TGGTCATTTGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACATCTTCTCGCTTGTAGATGAATCATGTCTGCGGAATTTGATATCTGCTGTAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAA
GGAGAGGATGTAAATGTATCTGAAGCTGCAATTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCCAGCACATGGGGAGCCACCTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACCTGTGTGAAGCA
TGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAACATGGTAAACAGCTGGCAGCCATGCATGCTCTTGGTAACATCTTCGGGGAAAGTCGATCAGAGAATGATATTATGCTAA
ATGATAATGCAGAAGAAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTTCAAAAATGACACCCTCAGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGACTCTGAG
ATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGTCTAACAGAGATCTGCTCGAAACAAGACATAGTAAATATAGTTGGTGATGCAAGTTC
TGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGGCTATCCATAAGGCCTTCATGTCTTCACCTAGGCTTACTGGCGATCCTGCTCTTGCTGGAATAG
CTTCAAAGCTGCAGGAAGCGGTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATGTTGAAACTCAACCAGCTATAATGACAGCTGAAAGATTTTAAAGAACATACCATGGT
TCAGAAGTAGGCAAGCCTTATGTACAAATGGTTTGCGTGATGTAATATATTTCTCAACCAGCAGCTGTAATGACATCAGACTTTTCTTTCACACTAGCAGTTGAAAATAG
ATTTTGTTTCTTCCATGGTTTGTGTACTAATATTTCTCTACTCTTTGGATCTGTTCGTGAATGTGTAATTTCTTTTTTATCATTCAACAAGAAACTCGTAATGTTTTAGC
TGTGAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEFSVNDPTRLLQAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGLEDALVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLQADSQTVRTLACKTVTRLLQES
DETALSPIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGTVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEIN
NSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLGSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCLRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGS
STWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIMLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL
TEICSKQDIVNIVGDASSETTKIGMEARYNCCLAIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

CSPI04G23230 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome