; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G23430 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G23430
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4
Genome locationChr4:21525424..21526864
RNA-Seq ExpressionCSPI04G23430
SyntenyCSPI04G23430
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039828 - VQ motif-containing protein 33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK20262.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa]9.8e-12498.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L3E4 VQ domain-containing protein6.6e-12699.59Show/hide
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A0A1S3BTW1 VQ motif-containing protein 41.6e-12499.19Show/hide
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A0A5A7VAR6 VQ motif-containing protein 41.6e-12499.19Show/hide
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A0A5D3D9L9 VQ motif-containing protein 44.7e-12498.79Show/hide
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A0A6J1IMJ9 VQ motif-containing protein 4-like5.3e-10789.88Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 134.8e-2545.79Show/hide
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Q5M750 VQ motif-containing protein 47.2e-4555.13Show/hide
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 338.3e-3348.65Show/hide
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        STS+  S  E+  NP P        + S+P   P  + P         SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS      +H   PS      P + + 
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Query:  FQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPN-----FSGSGA----AAGFSPRNVE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL
             +F IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N     F+G  +    +  FSPRN       +LSPS+LDFP L L SPVTPL
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          NDDP F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 314.7e-1233.69Show/hide
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        TTFVQ DT+ F+ +VQ LTG           PT ++   + P +              IKTA +K+ + KL+ERR  ++  L I     +F  +G     
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           N  +L+ S +  PS   S ++ +  +P  D  ++     +  EEE+AI E+ FYLHPSP + P   + P+LL+LFP TSP  SG
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 192.4e-4052.97Show/hide
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        E  TNP  S ++S +S+ IN +       ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS   SP  P+ P TPS K               NF IPP
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        IKTA PKK    KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER 
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        IA+KG+YLH SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein5.1e-4655.13Show/hide
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        S N+   S++  SN PP  P   +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E P+        S KP       DP  +  +F IPPIK  P K
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        PSP  TP   DP P+LL LFP TSPRVSGSSS+S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.1e-4354.39Show/hide
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein3.4e-2645.79Show/hide
Query:  YPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDPFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGA
        Y TTF++ D S+FK VVQ+LTG    P+ P H P P            PF S     IPPIK    K+Q  SF+L ERRN +K+ L IN   P  SG   
Subjt:  YPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDPFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGA

Query:  AAGFSPRNVEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPET
                 EIL+P+IL+FP+L LSP TPL  DP +   S S S   S      ++ER+I EKGFYL PSP  TPR  + P+LLSLFP T
Subjt:  AAGFSPRNVEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPET

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein1.7e-4152.97Show/hide
Query:  ERETNP--SPNTSPNSTTINSNPPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSS--ESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDPFQSSKNFPIPP
        E  TNP  S ++S +S+ IN +       ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS   SP  P+ P TPS K               NF IPP
Subjt:  ERETNP--SPNTSPNSTTINSNPPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSS--ESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDPFQSSKNFPIPP

Query:  IKTA-PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERA
        IKTA PKK    KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER 
Subjt:  IKTA-PKKQQSFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERA

Query:  IAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVS
        IA+KG+YLH SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
Subjt:  IAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVS

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein5.9e-3448.65Show/hide
Query:  STSTTRSSHERETNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPPKLLPRSD------SNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDP
        STS+  S  E+  NP P        + S+P   P  + P         SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS      +H   PS      P + + 
Subjt:  STSTTRSSHERETNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPPKLLPRSD------SNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDP

Query:  FQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPN-----FSGSGA----AAGFSPRNVE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL
             +F IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N     F+G  +    +  FSPRN       +LSPS+LDFP L L SPVTPL
Subjt:  FQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPN-----FSGSGA----AAGFSPRNVE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL

Query:  --NDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP
          NDDP F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
Subjt:  --NDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCACTTCATCTTCAACCTCAACAACAAGATCATCCCATGAAAGAGAAACAAACCCTTCTCCTAATACTTCCCCTAACAGTACCACCATCAACTCCAATCCTCC
TCCTCCTCCTCCTAAGCTTCTTCCTAGATCTGATTCAAATCCTTACCCCACAACTTTTGTTCAAGCTGATACTTCCAATTTCAAACATGTTGTTCAAATGCTCACTGGCT
CATCGGAATCTCCCCGGCCACCGCAACACCCACCAACCCCATCTTCAAAACCTTGTTCTGTTCCTCCTTCTCAAGACCCTTTTCAATCTTCCAAAAACTTCCCGATTCCT
CCCATCAAAACCGCCCCTAAGAAACAACAGAGTTTCAAGCTCTACGAACGAAGAAATCACCTCAAGAATAGTCTCATGATCAATACCCTAATCCCCAATTTCTCCGGTTC
TGGTGCGGCAGCGGGTTTTTCTCCTCGAAACGTTGAGATTCTCTCTCCTAGCATCCTTGATTTTCCTTCTCTTGCTCTTAGTCCTGTTACGCCGTTGAATGATGACCCGT
TGTTTGATAAATCGTCGTCGTCGCCGTCGCTTGGGAGCTCGTCGGAGGAAGAGAGAGCGATTGCTGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGATGAATACACCTAGA
GCCGCTGACCCGCCGCAGCTTCTTTCTTTGTTTCCGGAAACTTCGCCTAGGGTTTCTGGATCATCGTCTTCTTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACAACCAAAAGCCTAAACATTTTCCACTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTCCTCCATTCTCCTCCCCTTTTCCCTCATCAAAACCCTTCTTTCTCACTCTTCCCC
CCCTCTCTCTCTCTCATCCCCTCCAATCAAAACTCACCCCCTCAATTCCTCCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGAAGTGGGTTTGTTTTGTTTTGTAATTT
GTATTACATTTCTTAAGAAACCCCATCAATGGAAATCACTTCATCTTCAACCTCAACAACAAGATCATCCCATGAAAGAGAAACAAACCCTTCTCCTAATACTTCCCCTA
ACAGTACCACCATCAACTCCAATCCTCCTCCTCCTCCTCCTAAGCTTCTTCCTAGATCTGATTCAAATCCTTACCCCACAACTTTTGTTCAAGCTGATACTTCCAATTTC
AAACATGTTGTTCAAATGCTCACTGGCTCATCGGAATCTCCCCGGCCACCGCAACACCCACCAACCCCATCTTCAAAACCTTGTTCTGTTCCTCCTTCTCAAGACCCTTT
TCAATCTTCCAAAAACTTCCCGATTCCTCCCATCAAAACCGCCCCTAAGAAACAACAGAGTTTCAAGCTCTACGAACGAAGAAATCACCTCAAGAATAGTCTCATGATCA
ATACCCTAATCCCCAATTTCTCCGGTTCTGGTGCGGCAGCGGGTTTTTCTCCTCGAAACGTTGAGATTCTCTCTCCTAGCATCCTTGATTTTCCTTCTCTTGCTCTTAGT
CCTGTTACGCCGTTGAATGATGACCCGTTGTTTGATAAATCGTCGTCGTCGCCGTCGCTTGGGAGCTCGTCGGAGGAAGAGAGAGCGATTGCTGAAAAGGGGTTTTACTT
GCATCCATCGCCGATGAATACACCTAGAGCCGCTGACCCGCCGCAGCTTCTTTCTTTGTTTCCGGAAACTTCGCCTAGGGTTTCTGGATCATCGTCTTCTTCGTAACGAA
ATCGAGGGTTTGTTTGTTTGTTTGATTTGTAGAGATTTGTAACTTCTTGATTGATTTTTCTCCAACCCCAAGATGAAAAGATGATCGGTTGACGAATCAATTAACTGGGC
TTGGGTTTGATGAATTGATTGATTCTCCTGAGATTCAACAAAAGGCAAAAAAATTACAAACAAGAGAAGGGAGATGTTAGTGTTACGAATTTTCGATGTACAATTTGATG
AGAAATCCATTGGAAAATGGTAAAGCCTGAACTGAATTCAACTTAGATTTTTGTTATGAACCATTTTCCCATTTATTTTCTTTTCAATTTTCCCGGAAAGTTGGTGAGAA
ATTTTTTGTTGTGTTTGTTTTGAGTGGTAACCACAAAGGCCATTCCAAGGTGGGGGATCCAACCATTTTTGAATTGCCATAATTTTTCCTTCAATCACTTTATACCTTTG
AAATTATGGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEITSSSTSTTRSSHERETNPSPNTSPNSTTINSNPPPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPQHPPTPSSKPCSVPPSQDPFQSSKNFPIP
PIKTAPKKQQSFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAAAGFSPRNVEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPR
AADPPQLLSLFPETSPRVSGSSSSS