; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G25740 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G25740
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionF-box/LRR-repeat protein 15 isoform X1
Genome locationChr4:23028196..23030049
RNA-Seq ExpressionCSPI04G25740
SyntenyCSPI04G25740
Gene Ontology termsGO:0010252 - auxin homeostasis (biological process)
GO:1905393 - plant organ formation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR035940 - CAP superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022977104.1 uncharacterized protein LOC111477271 [Cucurbita maxima]3.9e-11190.62Show/hide
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XP_038899619.1 uncharacterized protein LOC120086877 [Benincasa hispida]3.2e-11391.52Show/hide
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        QFST+RMLLSA  SLVA+ FAF L
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L0V6 Uncharacterized protein3.9e-125100Show/hide
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A0A1S3BUP6 uncharacterized protein LOC1034937011.2e-11895.13Show/hide
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A0A5D3D935 F-box/LRR-repeat protein 15 isoform X19.7e-10896.02Show/hide
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A0A6J1F7E3 uncharacterized protein LOC1114427835.5e-11190.18Show/hide
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A0A6J1IQI3 uncharacterized protein LOC1114772711.9e-11190.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02180.1 ferredoxin-related4.4e-3640.19Show/hide
Query:  LFVSVFSA-GDSNVTDNPADKLVVVLNKNRTAHKLSPLKDNPGLACLALQYIKAYQGKCEAVGGPDGMKPPNSAFAETFAPNCGVVVSSLAPITGRLLGC
        LF+S+ S    S +  N A ++V +LN+NRTA KL  L ++PGL C+ALQY++  +G C  V      + P   F + FAPNCGV + +   ITG +LGC
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Query:  QSKYVHAPEAFSDVLMENNKSLEILYYKNNTEVGAAVTGTDGGSPYFWCVLFSNGTTSNSFAFE-GGVAKLTRPGCYSGADDQCSGTNKQFSTSRMLLSA
         SKY     AFSD+L  ++ +L +L  +++TEVG  +     G+ +FWC+LFS+G  ++SF  E  G     R GCYSG+   CS +N      R LL++
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Query:  FTSLVAITF
        F  L+  +F
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACCAAGATTCTGTGGTATCTCTTGTTTTGTGCCCTGTTCGTCTCTGTTTTTTCTGCAGGAGATTCAAATGTGACCGATAACCCTGCTGATAAACTAGTAGTTGT
GCTGAACAAGAACAGAACGGCTCATAAGTTATCTCCTCTGAAAGACAATCCTGGCTTGGCATGCCTTGCTCTTCAGTATATTAAGGCGTACCAAGGGAAATGTGAAGCGG
TTGGAGGTCCCGACGGAATGAAGCCTCCTAATTCTGCGTTTGCTGAAACTTTTGCTCCTAACTGTGGAGTTGTTGTCTCGTCTCTTGCTCCGATTACGGGGCGGTTGCTC
GGTTGCCAGTCTAAATATGTACATGCTCCCGAAGCGTTTTCTGATGTTTTAATGGAGAATAACAAGAGCTTGGAGATTCTTTACTACAAGAATAACACTGAAGTTGGAGC
TGCTGTTACTGGCACAGATGGGGGTTCTCCTTACTTTTGGTGTGTGTTGTTCAGCAACGGCACCACCTCCAACAGCTTTGCTTTTGAGGGGGGAGTGGCCAAGTTAACGC
GCCCTGGTTGCTACAGTGGTGCCGATGACCAATGCAGCGGAACCAATAAGCAGTTTTCAACCTCCCGTATGTTGCTATCAGCCTTCACATCTTTGGTTGCCATCACATTT
GCCTTTGGTTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTGCAGCCGATCTGTTTGATTTGGGCCTTGAAGAAGCCTTCTTCCAGTTCGTGGTTATTGGCTGTCACTCACTCAGCCGATTCAATGGCCGCTGCCCTTTGAACAGCTG
CAATGGCGACCAAGATTCTGTGGTATCTCTTGTTTTGTGCCCTGTTCGTCTCTGTTTTTTCTGCAGGAGATTCAAATGTGACCGATAACCCTGCTGATAAACTAGTAGTT
GTGCTGAACAAGAACAGAACGGCTCATAAGTTATCTCCTCTGAAAGACAATCCTGGCTTGGCATGCCTTGCTCTTCAGTATATTAAGGCGTACCAAGGGAAATGTGAAGC
GGTTGGAGGTCCCGACGGAATGAAGCCTCCTAATTCTGCGTTTGCTGAAACTTTTGCTCCTAACTGTGGAGTTGTTGTCTCGTCTCTTGCTCCGATTACGGGGCGGTTGC
TCGGTTGCCAGTCTAAATATGTACATGCTCCCGAAGCGTTTTCTGATGTTTTAATGGAGAATAACAAGAGCTTGGAGATTCTTTACTACAAGAATAACACTGAAGTTGGA
GCTGCTGTTACTGGCACAGATGGGGGTTCTCCTTACTTTTGGTGTGTGTTGTTCAGCAACGGCACCACCTCCAACAGCTTTGCTTTTGAGGGGGGAGTGGCCAAGTTAAC
GCGCCCTGGTTGCTACAGTGGTGCCGATGACCAATGCAGCGGAACCAATAAGCAGTTTTCAACCTCCCGTATGTTGCTATCAGCCTTCACATCTTTGGTTGCCATCACAT
TTGCCTTTGGTTTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATKILWYLLFCALFVSVFSAGDSNVTDNPADKLVVVLNKNRTAHKLSPLKDNPGLACLALQYIKAYQGKCEAVGGPDGMKPPNSAFAETFAPNCGVVVSSLAPITGRLL
GCQSKYVHAPEAFSDVLMENNKSLEILYYKNNTEVGAAVTGTDGGSPYFWCVLFSNGTTSNSFAFEGGVAKLTRPGCYSGADDQCSGTNKQFSTSRMLLSAFTSLVAITF
AFGL