; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G25930 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G25930
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionThreonyl-tRNA synthetase
Genome locationChr4:23165946..23166925
RNA-Seq ExpressionCSPI04G25930
SyntenyCSPI04G25930
Gene Ontology termsGO:0006435 - threonyl-tRNA aminoacylation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0004829 - threonine-tRNA ligase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002320 - Threonine-tRNA ligase, class IIa
IPR018163 - Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059181.1 threonine--tRNA ligase [Cucumis melo var. makuwa]6.7e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

KAG6572245.1 Threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.7e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

KAG7011877.1 Threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.7e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

XP_004144536.1 threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 [Cucumis sativus]6.7e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

XP_022989354.1 threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2-like [Cucurbita maxima]6.7e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K179 Threonyl-tRNA synthetase3.2e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

A0A0A0L0Y5 Uncharacterized protein4.6e-6799.19Show/hide
Query:  MAQNEIHPSNDNPCKFVEKFLTCTNKYGILVMYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKI
        MAQNEIHPSNDNPCKFVEKFLTCTNKYGILVMYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKI
Subjt:  MAQNEIHPSNDNPCKFVEKFLTCTNKYGILVMYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKI

Query:  KKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        KKEMERIIS NLPLVREEVSRDKA
Subjt:  KKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

A0A5A7V0A9 Threonyl-tRNA synthetase3.2e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

A0A6J1GM45 Threonyl-tRNA synthetase3.2e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

A0A6J1JP39 Threonyl-tRNA synthetase3.2e-2892.75Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGF YDFD+EPLGDKDL KIKKEMERIIS NLPLVREEVSRD+A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4IFC5 Threonine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 25.3e-2884.06Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWI+NGF YDFD+EPL DKDL +IKKEM+RIIS NLPL+REEVSR++A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

Q31JY3 Threonine--tRNA ligase7.7e-1968.12Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        +HVMAMAVQKLFP A+VTIGPW E GF YDFD  EP  + DL  IKKEM +II   LP+VREEVSR++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

Q55806 Threonine--tRNA ligase3.4e-1965.22Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        +HVMAMAVQKLFP A+VTIGPW E GF YDFD+ EP  + DL  IKKEM +II+  LP++REE+SR++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

Q5N1X6 Threonine--tRNA ligase7.7e-1968.12Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        +HVMAMAVQKLFP A+VTIGPW E GF YDFD  EP  + DL  IKKEM +II   LP+VREEVSR++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDI-EPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

Q8DGW0 Threonine--tRNA ligase2.6e-1965.22Show/hide
Query:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFD-IEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        +H++AMAVQKLFP A+VTIGPWIENGF YDFD  EP  +KDL  I+KEM +II   LP++REEV+R++A
Subjt:  AHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFD-IEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04842.1 threonyl-tRNA synthetase, putative / threonine--tRNA ligase, putative3.8e-2984.06Show/hide
Query:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA
        CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWI+NGF YDFD+EPL DKDL +IKKEM+RIIS NLPL+REEVSR++A
Subjt:  CAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISINLPLVREEVSRDKA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACAAAATGAAATTCACCCCTCCAACGACAACCCGTGCAAATTCGTGGAGAAATTCTTAACCTGCACCAACAAATACGGCATCTTGGTGATGTACCATAAATTACA
CTCTCTTACCTCACCATTCTTTCGAACTACTTTCCCAGGTTTCCAGCCTCTTCAGTGTGCTCATGTAATGGCCATGGCTGTTCAGAAGCTCTTTCCAGATGCTAAAGTGA
CAATTGGACCATGGATTGAAAATGGGTTTTGCTATGATTTTGATATAGAGCCCTTGGGAGATAAAGATTTGATGAAAATCAAGAAGGAGATGGAACGCATTATCAGCATA
AACTTACCACTTGTAAGAGAAGAAGTTTCAAGGGATAAAGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACAAAATGAAATTCACCCCTCCAACGACAACCCGTGCAAATTCGTGGAGAAATTCTTAACCTGCACCAACAAATACGGCATCTTGGTGATGTACCATAAATTACA
CTCTCTTACCTCACCATTCTTTCGAACTACTTTCCCAGGTTTCCAGCCTCTTCAGTGTGCTCATGTAATGGCCATGGCTGTTCAGAAGCTCTTTCCAGATGCTAAAGTGA
CAATTGGACCATGGATTGAAAATGGGTTTTGCTATGATTTTGATATAGAGCCCTTGGGAGATAAAGATTTGATGAAAATCAAGAAGGAGATGGAACGCATTATCAGCATA
AACTTACCACTTGTAAGAGAAGAAGTTTCAAGGGATAAAGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQNEIHPSNDNPCKFVEKFLTCTNKYGILVMYHKLHSLTSPFFRTTFPGFQPLQCAHVMAMAVQKLFPDAKVTIGPWIENGFCYDFDIEPLGDKDLMKIKKEMERIISI
NLPLVREEVSRDKA