; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G27400 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G27400
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDUF4228 domain-containing protein
Genome locationChr4:24068768..24070249
RNA-Seq ExpressionCSPI04G27400
SyntenyCSPI04G27400
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025322 - Protein of unknown function DUF4228, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064682.1 DUF4228 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-7892.66Show/hide
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XP_022981858.1 uncharacterized protein LOC111480876 [Cucurbita maxima]4.9e-6067.46Show/hide
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XP_038896630.1 uncharacterized protein LOC120084892 [Benincasa hispida]5.0e-6573.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5Z9 Uncharacterized protein3.7e-10699.51Show/hide
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A0A1S3BUP5 uncharacterized protein LOC1034938641.4e-9793.3Show/hide
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A0A5D3D8Q9 DUF4228 domain-containing protein5.1e-7992.66Show/hide
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A0A6J1FIQ7 uncharacterized protein LOC1114461015.3e-6066.99Show/hide
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A0A6J1J381 uncharacterized protein LOC1114808762.4e-6067.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21010.1 unknown protein6.0e-3243.72Show/hide
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AT1G76600.1 unknown protein2.2e-3447Show/hide
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        TAK++++ G LREY VP+  S+VL++E++SSS+S S    FLCNSD L+YDDFIP++  D  L  NQIYF+LP S   +RL+A DMAALAVKA++A++ A
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        +       + + R  RISP+  L+  ND +    N     E  + +       N TT          S SV+KL+R TS RAK+AVRSF+LRLSTIYEG+
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AT2G23690.1 unknown protein1.5e-1136.22Show/hide
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AT3G50800.1 unknown protein8.1e-1340.59Show/hide
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        TAK+I   G L+E+  P+ V ++LQ          SF+CNSD + +DD + ++P    L P ++YF+LP + L+H L A +MAALAVKA+ AL  +    
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Query:  L
        L
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AT5G66580.1 unknown protein5.3e-1241.94Show/hide
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        +AK+I L G L+E+  P+ V ++LQ          SF+CNSD + +DD + ++  +  L   Q+YF+LP + L+H L A +MAALAVKA+ AL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATACCCTGTTCCTATATCCGTCTCCCGCGTTCTTCAGACCGAAAATTCATCTTCTTCCACTTCCGACTCTTTTCTATGCAACTCCGACCGCTTATTCTACGATGATTTCA
TTCCGTCTTTGCCTCTCGACCACCACCTCCACCCCAATCAGATCTATTTCATCCTTCCTTCCTCCAACCTCCACCACCGATTGACCGCCCCTGATATGGCCGCCTTAGCC
GTCAAAGCCACCCTCGCCCTCCAGAATGCCTCCACCAACAACCTCCATCTCCCTCATAACAAGGGTCGTCGTCGTCGTATTTCTCCCCTCTTTGATCTTGATAGCCCCAA
CGACCAACAAAACGAACACGAACACGAACATGCCCTCTCCACTAACTCTAACTCCAAGAACAACACCACCTCCTCCTCCGTTAAAAAATTGCAGAGATTGACATCCAGAA
GGGCAAAAATGGCAGTTCGTTCCTTTAAACTCAGGTTGAGCACCATCTACGAAGGCACCGTTCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTATCGTAAATTAAAATTGTTTGTTGGAGCAACACAATATAATCCCTAGGCCTCTCACTCTCATTCCCCCAAACGTATACTACCCTGACACCTCTCCTCCTTCCACTTCT
ATTATCCCTCCTCGTCATATCCCCAAATTAATTAAATTTCCCTGGAAAACGCCGATCGAGACAATCGGTCCTGATGGGCGGGTGTTTCTCAAACTGCCTAATTATTCCCA
AAGTCTCTTCGTCTGTTCCTCCACCTCCTCCTCCTACCGCCAAAGTTATCTCTTTACAAGGACATCTCCGGGAATACCCTGTTCCTATATCCGTCTCCCGCGTTCTTCAG
ACCGAAAATTCATCTTCTTCCACTTCCGACTCTTTTCTATGCAACTCCGACCGCTTATTCTACGATGATTTCATTCCGTCTTTGCCTCTCGACCACCACCTCCACCCCAA
TCAGATCTATTTCATCCTTCCTTCCTCCAACCTCCACCACCGATTGACCGCCCCTGATATGGCCGCCTTAGCCGTCAAAGCCACCCTCGCCCTCCAGAATGCCTCCACCA
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TGGTCCATATGATTCCAACTTCCAATTGATCACATTGGGACCTGCTTTATGTGCGTTCGGATATACACATAACATACGCAGGGCCGGATCTATTCAGGGTTCGAGGCACG
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TGCCTTTTCTTTTGATTAAACTAATTACATATGCAAACCAGAATAGTATTGATTAGTAGGGGAGAGTGGAGCCCATTAAAAATTCAAAATACAATGTGAATGTGGCGAAG
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CTCTTCTTTCTTCTCCTTTCTGTTCCGTTTGGGTCCAACCCGTTTCCAATTCCTAATTGCATCTGTGTAATCTTTCAGACAATTACTAAATATTATCATTTCTGTTTCTT
TTTTACGCGGAAAATGCAAATAATGTACTAATCCTTATAATTTTGCAGCCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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