; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G03650 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G03650
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionWRKY domain-containing protein
Genome locationChr5:3777428..3778098
RNA-Seq ExpressionCSPI05G03650
SyntenyCSPI05G03650
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003657 - WRKY domain
IPR036576 - WRKY domain superfamily
IPR044810 - WRKY transcription factor, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN33775.1 WRKY transcription factor [Cucumis melo subsp. melo]6.0e-7287.35Show/hide
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KAA0042590.1 WRKY transcription factor [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-7387.5Show/hide
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KGN49587.2 hypothetical protein Csa_000588 [Cucumis sativus]1.7e-8799.4Show/hide
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XP_004145903.1 probable WRKY transcription factor 27 [Cucumis sativus]1.7e-8799.4Show/hide
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XP_008437536.1 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 27 isoform X1 [Cucumis melo]6.0e-7287.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQD1 WRKY domain-containing protein8.4e-8899.4Show/hide
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A0A1S3AU96 probable WRKY transcription factor 27 isoform X12.9e-7287.35Show/hide
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A0A1S3AUW0 probable WRKY transcription factor 27 isoform X21.6e-5985.81Show/hide
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          GEKDGEMFEDMPIDSD+E+DD+DILIPNLTVRDEI+VGF+ VGRGR
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A0A5A7TGX7 WRKY transcription factor2.6e-7387.5Show/hide
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E5GBD4 WRKY transcription factor2.9e-7287.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04609 WRKY transcription factor 222.1e-2751.72Show/hide
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         SSSP  S    + P+ D+   +G+ DGE  ED+   SD    DD
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O64747 Probable WRKY transcription factor 352.6e-2550.68Show/hide
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        +S   P++S+  +S   P  D  +   E   E  E M  D +D ++
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Q9FLX8 Probable WRKY transcription factor 276.1e-3551.79Show/hide
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        +WAWRKYGQKPIKGSPYPRNYYRCSSSKGC ARKQVERSN DP  F +TYTG+H+HPRPTHRNSLAGS+RN+S   +   +  T   SD  +     L P
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        ++       +   N  +  +G       E++ E  E+   + +D+DD DD+LIPNL VRD   + F G
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Q9SA80 Probable WRKY transcription factor 141.4e-2650.34Show/hide
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        +WAWRKYGQKPIKGSP+PR YYRCSSSKGC ARKQVERS  DP    ITYT +H+HP P  RN+LAGS+R+ +SSSS+ +       +     I S   +
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         LPSS++P      P     S I ++ G   +DM +++ D+DDD+ I
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Q9SUS1 Probable WRKY transcription factor 296.7e-2655.56Show/hide
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        WAWRKYGQKPIKGSPYPR+YYRCSSSKGC ARKQVER+  +PE FTITYT +H+H  PT RNSLAGS+R ++S        PT+       ++       
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         SSP ++P+ P  D  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30650.1 WRKY DNA-binding protein 149.6e-2850.34Show/hide
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         LPSS++P      P     S I ++ G   +DM +++ D+DDD+ I
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AT2G34830.1 WRKY DNA-binding protein 351.8e-2650.68Show/hide
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        +WAWRKYGQKPIKGSPYPR YYRCSSSKGC ARKQVERS  DP    ITYT +H+HP PT RN+LAGS+R+ SSSS + SS+  T   +  P        
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Query:  ASVLLPSSSSPAASPITPLNDYDSTIGEKDGEMFEDMPIDSDDEDD
        +S   P++S+  +S   P  D  +   E   E  E M  D +D ++
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AT4G01250.1 WRKY family transcription factor1.5e-2851.72Show/hide
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        +WAWRKYGQKPIKGSPYPR YYRCS+SKGC ARKQVER+  DP+ F +TYT +H+HP PTHRNSLAGS+R +  S   +S+ PT           + +  
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Query:  SSSSPAASP---ITPLNDYDSTIGEKDGEMFEDMPIDSDDEDDDD
         SSSP  S    + P+ D+   +G+ DGE  ED+   SD    DD
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AT4G23550.1 WRKY family transcription factor4.8e-2755.56Show/hide
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        WAWRKYGQKPIKGSPYPR+YYRCSSSKGC ARKQVER+  +PE FTITYT +H+H  PT RNSLAGS+R ++S        PT+       ++       
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Query:  SSSPAASPITPLNDYDS
         SSP ++P+ P  D  S
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AT5G52830.1 WRKY DNA-binding protein 274.3e-3651.79Show/hide
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Query:  SSSSPAASPITPLNDYDSTIG-------EKDGEMFEDMPIDSDDEDDDDDILIPNLTVRDEIYVGFDG
        ++       +   N  +  +G       E++ E  E+   + +D+DD DD+LIPNL VRD   + F G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGGCTTGGCGTAAATATGGGCAAAAGCCCATTAAAGGATCTCCGTATCCAAGAAACTATTACCGTTGCAGCAGCTCAAAAGGGTGTGGAGCAAGAAAGCAAGTTGA
ACGCAGCAACGACGATCCCGAAACTTTCACCATCACATACACCGGCGATCACTCTCATCCCCGTCCAACTCACCGTAATTCCCTCGCCGGAAGTTCCCGCAACAGGTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCGACACCCCACCATGGGAGATTCCGATCCCCCGATGATGATCGCCTCCGTTCTCCTACCCTCCTCCTCTTCCCCTGCAGCTTCTCCCATC
ACACCGCTGAACGACTACGATTCCACCATCGGCGAGAAAGATGGAGAGATGTTTGAAGATATGCCGATTGATAGTGACGATGAAGACGATGATGACGATATTCTGATCCC
GAACCTGACGGTGAGAGATGAAATCTATGTTGGGTTTGATGGGGTTGGGAGGGGACGGTCATCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGGGCTTGGCGTAAATATGGGCAAAAGCCCATTAAAGGATCTCCGTATCCAAGAAACTATTACCGTTGCAGCAGCTCAAAAGGGTGTGGAGCAAGAAAGCAAGTTGA
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CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCGACACCCCACCATGGGAGATTCCGATCCCCCGATGATGATCGCCTCCGTTCTCCTACCCTCCTCCTCTTCCCCTGCAGCTTCTCCCATC
ACACCGCTGAACGACTACGATTCCACCATCGGCGAGAAAGATGGAGAGATGTTTGAAGATATGCCGATTGATAGTGACGATGAAGACGATGATGACGATATTCTGATCCC
GAACCTGACGGTGAGAGATGAAATCTATGTTGGGTTTGATGGGGTTGGGAGGGGACGGTCATCGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWAWRKYGQKPIKGSPYPRNYYRCSSSKGCGARKQVERSNDDPETFTITYTGDHSHPRPTHRNSLAGSSRNRSSSSSSSSRHPTMGDSDPPMMIASVLLPSSSSPAASPI
TPLNDYDSTIGEKDGEMFEDMPIDSDDEDDDDDILIPNLTVRDEIYVGFDGVGRGRSS