; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G05990 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G05990
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationChr5:5439724..5444414
RNA-Seq ExpressionCSPI05G05990
SyntenyCSPI05G05990
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-8886.38Show/hide
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XP_011654776.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Cucumis sativus]2.3e-111100Show/hide
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XP_022156217.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Momordica charantia]3.2e-8986.79Show/hide
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]4.3e-10295.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL191.4e-10696.86Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL191.5e-8986.79Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X26.1e-8684.98Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X15.0e-8885.92Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.1e-8785.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC13.8e-5358.77Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL191.1e-5760.28Show/hide
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        ET LFIGPPE R +
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL141.5e-5458.88Show/hide
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        +K+EHLE+  RK++G+GLD  SI+ELQQLE QL+RSL KIR++KYQ+L++E  KLKE+E+ L+ EN  L  K   +      +   S+  SE    +  M
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        +V T+LFIGPPE R
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL421.3e-4854.55Show/hide
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        MVRGK +MK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDA+++LIIFS RG+LYEFS+  M KTI+RY+  TKD  +SN  +   +Q  K+  S  +T 
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        K+E LE  KRKLLG G+  CS++ELQ+++ QL+RSL K+R RK Q+ K+++ KLK +EK LLEEN  L  K +    +   ++Q+ E     ++ ++VET
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        +LFIG P R
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 503.9e-5056.74Show/hide
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        MVRGKTQMKRIEN TSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVALI+FSPRGKLYEF++ S  KTI+RY+  TK+ +  N T  +D++  K  D+  + K
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        KLE LE  KRKLLG+ LD CSI+EL  LE +LERSL  IR RK ++L++++ KL+E+E  L ++N  L+ K  ++         R+E  N +       +
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         MDVETELFIG P R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 202.7e-5458.77Show/hide
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        K+E LE  KRKLLG+G+  CSI+ELQQ+E+QLE+S+  IR+RK Q+ K++I +LK++EK L  EN  L  K  S      S+K QES  R +  +     
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        +VET+LFIG P
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 141.1e-5558.88Show/hide
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        +V T+LFIGPPE R
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 198.1e-5960.28Show/hide
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