; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G06460 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G06460
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr5:5794055..5796808
RNA-Seq ExpressionCSPI05G06460
SyntenyCSPI05G06460
Gene Ontology termsGO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039677.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold558G00080 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-11896.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKI9 Uncharacterized protein7.9e-124100Show/hide
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A0A5A7TDT6 Uncharacterized protein1.3e-11896.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62780.1 unknown protein1.3e-7865.42Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTCTTAGCTTCGGCTTTACCCCCACCACCATCCACCTACCATCAACTTCCATTCGCTCTCGTCGCATTCCCCAGACCATAACCTGCGTCGGATGGGACCCAGA
AGGCCTCTTCGGAAAGCCTCAGACCGGTCACATCGCTCGAAATGAGTTCAAGAGGCGGCTGGAGAAAGACGCCGAAGCTCGCGAGGCTTTCGAGCGCCACGTTAGGGAAG
AGAAAGAGCGCCGTAAAACGCTTCGAGAGTCTCGTGTAATTCCGGGCAATGTGACTGGTCTTATCGAATATTTTCTTGATACTGAAGCTCAGGATATTGAATTTGAAATC
GCAAGGTTGAGACCCAGGCTGAATGAGGAGTTTTTTTCACGTGTAAAACTTGAGCTGGGTGAGCTTAGATTTGCCGTTAACAAAACCGAGGCCATGGAAGATAGAGTGAT
TGAGTTGGAAGCATTACAGAAAGCCCTTGAAGAAGGAATAGAAGCCTATGATAAAATGCAAAGGGAACTAGTAAAGGCAAGGGAAGGTTTAACCAAAATTTTAACATCAA
AGGATGTAAAAGCTACTTTGCTAGACATGTTAGAGCGAAATGAGCTCAATAGATCGTTACTCGCCCTTCTGGACGAAAACATAGCCAATGCACAAATGGGTAACCAGAAA
CAAGCTGCTGCTTTCATGGAAAAGGTTCGAGGGGCAGTTCTCAAGTACATGACAGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGATTCCCGCCACGGCGAGCGAACGGATAATGCTGCAGATTACAGATTGAGACGACGGACCAAAAACCAGTGGCTCACACTTCCCACCTTTCATCAATGGCTGCTCTTAG
CTTCGGCTTTACCCCCACCACCATCCACCTACCATCAACTTCCATTCGCTCTCGTCGCATTCCCCAGACCATAACCTGCGTCGGATGGGACCCAGAAGGCCTCTTCGGAA
AGCCTCAGACCGGTCACATCGCTCGAAATGAGTTCAAGAGGCGGCTGGAGAAAGACGCCGAAGCTCGCGAGGCTTTCGAGCGCCACGTTAGGGAAGAGAAAGAGCGCCGT
AAAACGCTTCGAGAGTCTCGTGTAATTCCGGGCAATGTGACTGGTCTTATCGAATATTTTCTTGATACTGAAGCTCAGGATATTGAATTTGAAATCGCAAGGTTGAGACC
CAGGCTGAATGAGGAGTTTTTTTCACGTGTAAAACTTGAGCTGGGTGAGCTTAGATTTGCCGTTAACAAAACCGAGGCCATGGAAGATAGAGTGATTGAGTTGGAAGCAT
TACAGAAAGCCCTTGAAGAAGGAATAGAAGCCTATGATAAAATGCAAAGGGAACTAGTAAAGGCAAGGGAAGGTTTAACCAAAATTTTAACATCAAAGGATGTAAAAGCT
ACTTTGCTAGACATGTTAGAGCGAAATGAGCTCAATAGATCGTTACTCGCCCTTCTGGACGAAAACATAGCCAATGCACAAATGGGTAACCAGAAACAAGCTGCTGCTTT
CATGGAAAAGGTTCGAGGGGCAGTTCTCAAGTACATGACAGCTTAGTCTTATTGAGGTACAGATTGTGAATTTTTTTTCAGTTTCTTCTCAACAATCACATGTAGGGAAC
ACGTTTACTAATATCTTATATAATAATAAATTACATAATTTTGGTTGAATTAACCCATGTTCATTCGATAATGATCCCAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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