CuGenDBv2

Gene ID	CSPI05G08300
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	DNA polymerase delta subunit 4
Genome location	Chr5:7050789..7052501
RNA-Seq Expression	CSPI05G08300
Synteny	CSPI05G08300
Gene Ontology terms	GO:0000731 - DNA synthesis involved in DNA repair (biological process) GO:0006261 - DNA-dependent DNA replication (biological process) GO:0043625 - delta DNA polymerase complex (cellular component) GO:0003887 - DNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR007218 - DNA polymerase delta, subunit 4

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6605696.1 DNA polymerase delta subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

6.5e-47

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XP_008467236.1 PREDICTED: DNA polymerase delta subunit 4 [Cucumis melo]

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XP_022957680.1 uncharacterized protein LOC111459143 [Cucurbita moschata]

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XP_038875328.1 DNA polymerase delta subunit 4 [Benincasa hispida]

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A0A0A0KND6 Uncharacterized protein

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A0A1S3CT23 DNA polymerase delta subunit 4

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A0A5A7UNL0 DNA polymerase delta subunit 4

3.2e-60

96.8

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A0A6J1H180 uncharacterized protein LOC111459143

3.1e-47

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A0A6J1K4T3 uncharacterized protein LOC111491182

7.7e-46

78.4

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O59835 DNA polymerase delta subunit 4

1.2e-06

53.49

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        E  L  FD    YGP LGMTRM RW+RA +  LNPP+ +G +L
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Q3T0X9 DNA polymerase delta subunit 4

1.4e-07

46.3

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        LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +L++  G  + +C LW
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Q9CWP8 DNA polymerase delta subunit 4

3.0e-07

54.76

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Q9HCU8 DNA polymerase delta subunit 4

1.0e-07

42.19

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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G09815.1 polymerase delta 4

1.1e-36

60.8

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        MA+T   LK FYKQ KS+       SKPSSRK  +P ++A+ GSD  QPAAL+SHGS+DL +DY   E  LRQFDMN  YGPCLGMTR+ RWERA  LG+
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        NPP +I  LLK GKVQ +CLW  RV
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCATCAACGCGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAGGCAAAGGCTTCAAAGCCCTCTTCTAGGAAAACTAAATCTCCGGC
CAACTCTGCATCTTTGGGCTCCGATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGTGTCTGAGAATACGCTGAGGCAAT
TTGATATGAACACGGCATATGGACCTTGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGGTGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGGACACTCTTA
AAGGCTGGAAAAGTGCAGTTGGAGTGCTTATGGGATTCTCGAGTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AGAATAAAAAAATTGCTTTCTCTTTATTAATTATTCTTTTAGGTAATTTAGAATTAAAAAAGAAAAGAATGGGCCGGATCTCAATCGGATCCTGGCCCAGATATTATTAG
GGTCCATATAAGGAGAAAGGCCACATCGAATTAGACCTCCAAAATGCAAAAGAACAAATTTGAAATTTGAAATTCCGAAGTCGATCGATCGCAGAGAAGGAGCAAAATCA
AAAATGGCATCAACGCGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAGGCAAAGGCTTCAAAGCCCTCTTCTAGGAAAACTAAATCTCC
GGCCAACTCTGCATCTTTGGGCTCCGATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGTGTCTGAGAATACGCTGAGGC
AATTTGATATGAACACGGCATATGGACCTTGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGGTGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGGACACTC
TTAAAGGCTGGAAAAGTGCAGTTGGAGTGCTTATGGGATTCTCGAGTTTAAACTTGTATGCTTGGTGTGTTATTTTTGTTTAACGTATGAAGTGCATGCTGTGCTTTTGC
TTTTGGACAAAATGTTCAGCCCCTAGCTGAAACAATATAATCACTTTTCCTGTGATGTGAATGGGGTTAGAATGTTTGCTGATGACAGCTCCCCTAGTTATTTACATCTT
ACTTATGTTGAAAACTTATAACAAGTAGTTGTATAGTTAAATTTGGTGATATTTTCCTTTCCTAGTGTAGTTACACTTGAACTTGATATGATGTGTGAATCCGTGATTAA
CGACACCTTTTGATTCCCAATAATTGAAAAGGGAGGGATATTTGT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASTRGGLKDFYKQRKSSGISKAKASKPSSRKTKSPANSASLGSDAVQPAALVSHGSLDLQDDYGVSENTLRQFDMNTAYGPCLGMTRMARWERACSLGLNPPKDIGTLL
KAGKVQLECLWDSRV

CSPI05G08300 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome