; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G09450 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G09450
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description50S ribosomal protein L23, chloroplastic
Genome locationChr5:7937324..7939008
RNA-Seq ExpressionCSPI05G09450
SyntenyCSPI05G09450
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001014 - Ribosomal protein L23/L25, conserved site
IPR005633 - Ribosomal protein L23/L25, N-terminal
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR012678 - Ribosomal protein L23/L15e core domain superfamily
IPR013025 - Ribosomal protein L25/L23
IPR019985 - Ribosomal protein L23


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147702.1 60S ribosomal protein L23a [Cucumis sativus]1.2e-74100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_004149813.1 60S ribosomal protein L23a [Cucumis sativus]1.4e-7297.39Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS+KK DPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_008463516.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L23a [Cucumis melo]1.4e-7297.39Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS+KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKK+RNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_022995723.1 60S ribosomal protein L23a [Cucurbita maxima]6.4e-7398.04Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_038891458.1 60S ribosomal protein L23a [Benincasa hispida]1.3e-7399.35Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIK AVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS61 50S ribosomal protein L23, chloroplastic5.7e-75100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A1S3CFM9 50S ribosomal protein L23, chloroplastic5.7e-75100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A5A7U4W7 50S ribosomal protein L23, chloroplastic5.7e-75100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A5D3C5W3 50S ribosomal protein L23, chloroplastic6.9e-7397.39Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS+KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKK+RNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1K8U2 50S ribosomal protein L23, chloroplastic3.1e-7398.04Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22644 60S ribosomal protein L23A3.0e-6588.31Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP A  +KK D KAQALK AKAVKSG  T +KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS  PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IK AVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALD+ANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q07761 60S ribosomal protein L23a1.6e-6688.96Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP KAD SKK+DPKAQA K AKAVKSG T KKK++KIRT VTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS   RNKLDQY ILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        +A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q8LD46 60S ribosomal protein L23a-15.1e-6587.01Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9AT35 60S ribosomal protein L23a1.9e-6790.26Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KK+D KAQALKTAKAVKSG T  KK KKIRTSVTFHRP+TL KDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RANKK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9M3C3 60S ribosomal protein L23a-25.7e-6486.36Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39460.1 ribosomal protein L23AA3.6e-6687.01Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT2G39460.2 ribosomal protein L23AA3.6e-6687.01Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.1 ribosomal protein L23AB4.0e-6586.36Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.2 ribosomal protein L23AB4.0e-6586.36Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.3 ribosomal protein L23AB9.3e-6283.77Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG        KIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCTAAAGCTGATAGTAGCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCTAAGGCAGTCAAGTCTGGCCCAACTTTCAAGAAGAAGGCTAAGAAGAT
TAGAACTTCAGTCACATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCTAGAATCAGTGTTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCAGTATCAAATTC
TGAAATATCCATTGACCACAGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAGGACAATAACACCCTCGTCTTTATTGTTGACATTCGTGCCAACAAGAAAAATATTAAAGATGCTGTG
AAGAAGATGTATGATATTCAGACCAAGAAAGTTAACACTTTAATCAGACCCGACGGAACGAAGAAGGCATATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTTGATGTGGC
GAACAAGATTGGTATCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTAATTCGGCCGCAGCCTTCCATCTCGCCATTCCTCTCTTCGCAGGTAAGTTTTTCTGGTCAAGGATCTTCAGCAATGGCACCTAAAGCTGATAGTAGCAAAAAGGCTG
ATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCTAAGGCAGTCAAGTCTGGCCCAACTTTCAAGAAGAAGGCTAAGAAGATTAGAACTTCAGTCACATTCCATAGGCCAAAGACA
TTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCTAGAATCAGTGTTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCAGTATCAAATTCTGAAATATCCATTGACCACAGAGTCTGCAATGAA
GAAGATTGAGGACAATAACACCCTCGTCTTTATTGTTGACATTCGTGCCAACAAGAAAAATATTAAAGATGCTGTGAAGAAGATGTATGATATTCAGACCAAGAAAGTTA
ACACTTTAATCAGACCCGACGGAACGAAGAAGGCATATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTTGATGTGGCGAACAAGATTGGTATCATCTAAACTTCAGAGCTT
GGAGCCAGCATTTTAATTGCAATTTGTTACATGTTTAAATTTTGGAGAGGATTTTGTAGTAGGACCCTAGTTTTGTTTTAGCTTCCTTTTTAATATGTATTGGTATTTGT
TTGCTCAGATAGACTGGGTTCACAATACTTGGAATGTTGGAACATGCATTCCAACCATTTTCATTATAGTTTGCTTCAGACTCCATTACATCATTACTGAATTTTTGGTC
TTTACATCTTCTCTTTGGTTCTTCAATATATAGTATCCATCCAATTGTTTGGTCACCAAGCACTTTATCCTAGTGTTTGGGGATTGTTCTGCGCTGTATGAATGTACTAT
AGAGTACAATGTTATTAGTGATTAACATAACAATATGCTAATTGAATTATTCAGTGGGTCTTTCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAV
KKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII