; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G09890 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G09890
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionZinc finger, C2H2-like protein
Genome locationChr5:8353162..8353557
RNA-Seq ExpressionCSPI05G09890
SyntenyCSPI05G09890
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600035.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-3161.87Show/hide
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XP_008461701.1 PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucumis melo]2.0e-5992.42Show/hide
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XP_022988302.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita maxima]1.6e-3263.31Show/hide
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XP_023542190.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-3364.03Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLQ3 C2H2-type domain-containing protein1.7e-6799.24Show/hide
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A0A1S3CGM6 transcriptional regulator SUPERMAN-like9.8e-6092.42Show/hide
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A0A5A7UA35 Transcriptional regulator SUPERMAN-like9.8e-6092.42Show/hide
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A0A6J1JCP1 zinc finger protein 10-like7.8e-3363.31Show/hide
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Q0DJG4 Os05g0286100 protein3.9e-1649.5Show/hide
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        +TSY++  +E+AFA+D A      +WPPRSYSC+FC R+FRSAQALGGHMNVHRRDRA+L            ++H   PN+ + I+P  P    L H +S
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Query:  P
        P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 103.2e-1559.7Show/hide
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        S W +E AFA+D AA  +WPPRSY+C+FC R+F+SAQALGGHMNVHRRDRA+L+   ++  F K ++
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN5.1e-1352.94Show/hide
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS7.9e-1452Show/hide
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Q9SLB8 Zinc finger protein 117.9e-1448.94Show/hide
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        WPP++Y+C+FC R+FRSAQALGGHMNVHRRDRAKL+  P+  +  +P         HH +P  N +P F        SSSSSSS+++++ E  L
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC12.9e-0875.76Show/hide
Query:  RSYSCTFCMRQFRSAQALGGHMNVHRRDRAKLQ
        RSY C+FC+R F +AQALGGHMN+HRRDRAKL+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 102.3e-1659.7Show/hide
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AT2G42410.1 zinc finger protein 115.6e-1548.94Show/hide
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein3.6e-1452.94Show/hide
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein8.1e-1464.15Show/hide
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        KAF  D         WPPRSY+C FC R+FRSAQALGGHMNVHRRDRA  + H
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AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.6e-1552Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACAAACCCATCAATTATGGAGACAAATCCTCAAAACTACGTCTTATTGGGATCAAGAGAAAGCCTTTGCCGACGACGTTGCCGCCGTGTGGCCACCCAGATCCTA
CTCCTGCACCTTCTGTATGAGACAGTTCCGTTCAGCTCAAGCTTTAGGTGGCCACATGAATGTCCATCGAAGAGACCGTGCTAAGCTTCAAAACCATCCTAACCGTCCAT
TCTTCATCAAACCAACAACTCCCACCTTTGATCTTCTCACTCACCATTTTTCTCCCAAAAACAACGACTCTCCTCCTTTCTCTCTCAAAAAACCTAAACTTGCTTCCTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAATTCTGAGCACCACCTTGACCTCGAGCTCAAACTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACAAACCCATCAATTATGGAGACAAATCCTCAAAACTACGTCTTATTGGGATCAAGAGAAAGCCTTTGCCGACGACGTTGCCGCCGTGTGGCCACCCAGATCCTA
CTCCTGCACCTTCTGTATGAGACAGTTCCGTTCAGCTCAAGCTTTAGGTGGCCACATGAATGTCCATCGAAGAGACCGTGCTAAGCTTCAAAACCATCCTAACCGTCCAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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