; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G10290 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G10290
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description17.3 kDa class I heat shock protein-like
Genome locationChr5:8744344..8745127
RNA-Seq ExpressionCSPI05G10290
SyntenyCSPI05G10290
Gene Ontology termsGO:0006457 - protein folding (biological process)
GO:0009408 - response to heat (biological process)
GO:0009651 - response to salt stress (biological process)
GO:0042542 - response to hydrogen peroxide (biological process)
GO:0051259 - protein complex oligomerization (biological process)
GO:0043621 - protein self-association (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002068 - Alpha crystallin/Hsp20 domain
IPR008978 - HSP20-like chaperone
IPR031107 - Small heat shock protein HSP20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150237.2 18.1 kDa class I heat shock protein [Cucumis sativus]7.7e-10098.95Show/hide
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XP_022139109.1 18.1 kDa class I heat shock protein-like [Momordica charantia]5.2e-4057.41Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEVK++V E ++L++SGER KE
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         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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XP_023529998.1 17.8 kDa class I heat shock protein-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-3957.5Show/hide
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        M+LI  + GG  RR+  FDPF L+ WD               SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEVK++V E ++L++SGER KE +
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        E++++WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPE+KSI IS
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XP_031490427.1 17.8 kDa class I heat shock protein-like [Nymphaea colorata]6.8e-4056.25Show/hide
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        +R    PMS+I    G   RR+  FDPF L+ WD         +    SAF   Q+DWKETP AH+FKADLPGLK EEVK+++ E ++L++SGER +ET+
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        E+ E+WHRVER SGKFLRRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPE++SI IS
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XP_038892902.1 17.8 kDa class I heat shock protein-like [Benincasa hispida]2.3e-5678.62Show/hide
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        MSLIRRMTGGRRR N+++DPF LE+W+  EET SAFM T+IDWKETPNAHIFKADLPG+K  EVKM+V E +ILELSGER KE +EESE+W+RVERRSGK
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        FLRRFRLPENVKVED+N SMEDG+LTV +PKIE +KPEIKSIAIS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP16 SHSP domain-containing protein3.7e-10098.95Show/hide
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        DLPGLKIEEV MDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
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A0A5D3DH18 17.6 kDa class I heat shock protein 3-like7.4e-4058.13Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF L+ WD               SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEVK++V E ++L++SGER KE +
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        E++++WHRVER SGKF RRFRLPEN KVE++  +ME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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A0A6J1CB17 17.8 kDa class I heat shock protein-like isoform X17.4e-4056.17Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AH+FKADLPG+K EEVK++V E ++L++SGER +E
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         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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A0A6J1CC00 18.1 kDa class I heat shock protein-like2.5e-4057.41Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEVK++V E ++L++SGER KE
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         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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A0A6J1CEM2 17.3 kDa class I heat shock protein-like5.6e-4056.17Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AH+FKADLPG+K EEVK++V E ++L++SGER +E
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Query:  TKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82011 17.7 kDa class I heat shock protein7.9e-3955.19Show/hide
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        MSLI R+ G RR  +M FDPF ++ +D   E           SAF  T+IDWKETP AH+FKADLPGLK+EEVK++V E ++L++SGER  E ++++++W
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         RVER SGKF+RRFRLPEN K++ +  SME+G+LTV VPK E  KP++KSI IS
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P05478 18.5 kDa class I heat shock protein6.0e-3952.47Show/hide
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        MSLI    GG  RRN  FDPF L+ WD  ++                   SAF+ T++DWKETP AH+FKAD+PGLK EEVK+ + + K+L++SGER  E
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Query:  TKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
         +++++ WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE +  SME+G+LTV VPK E  KP++K+I IS
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P19036 17.4 kDa class I heat shock protein2.7e-3952.87Show/hide
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        MSL+    GGRR     FDPF L+ WD  E            +  +AF   ++DW+ETP AH+FKAD+PGLK EEVK++V +  IL++SGER  E +E+S
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Query:  EEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        + WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+L+V VPK++  KPE+KS+ IS
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P19037 18.1 kDa class I heat shock protein6.0e-3951.88Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF  + WD               S+    +AF   ++DWKETP AH+FKADLPGLK EEVK++V +  +L++SGER KE +
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Query:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        E++++WHRVER SGKF+RRFRLPEN K+E++  +ME+G+LTV+VPK    KP++KSI IS
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P27396 17.8 kDa class I heat shock protein4.2e-4055.35Show/hide
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        MS+I    GG  RR+  FDPF L+ WD                +ETA AF+ T IDWKETP AH+FKADLPGLK EEVK+++ E K+L++SGER KE +E
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        ++++WHRVER SGKFLRRFRLPEN KV+++  +M +G++TV VPK+E  KPE+K+I IS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07400.1 HSP20-like chaperones superfamily protein2.2e-3650Show/hide
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        MSLI    G  RR N  FDPF L+ WD  +E           SA    ++DWKET  AH+FKADLPG+K EEVK+++ +  +L++SGER  E +E+ + W
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Query:  HRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGV--KPEIKSIAIS
        HRVER SG+F R+F+LPENVK++ +  SME+G+LTV VPK+E    K ++KSI IS
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AT1G53540.1 HSP20-like chaperones superfamily protein4.0e-3852.53Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSE-------------ETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVKMDVNEAKILELSGERMKETKEE
        MSLI  + GGRR     FDPF L+ +D  E                +AF   ++DW+ETP AH+FKADLPGL+ EEVK++V +  IL++SGER  E +E+
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Query:  SEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        +++WHRVER SGKF RRFRLPEN K+E+I  SME+G+L+V VPK+   KPE+KSI IS
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AT2G29500.1 HSP20-like chaperones superfamily protein5.8e-3750.98Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEETA--------SAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVKMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWH
        MS+I       RR N+ FDPF L+ WD  +E          SA +  ++DW+ETP AH+FKADLPGLK EEVK+++ E  +L++SGER  E +++++ WH
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Query:  RVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        RVER SG+F RRFRLPENVK++ +  +ME+G+LTV VPK E  K ++KSI IS
Subjt:  RVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS

AT3G46230.1 heat shock protein 17.41.9e-4052.87Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSE------------ETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVKMDVNEAKILELSGERMKETKEES
        MSL+    GGRR     FDPF L+ WD  E            +  +AF   ++DW+ETP AH+FKAD+PGLK EEVK++V +  IL++SGER  E +E+S
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Query:  EEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        + WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+L+V VPK++  KPE+KS+ IS
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AT5G59720.1 heat shock protein 18.24.3e-4051.88Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWD---------------SSEETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVKMDVNEAKILELSGERMKETK
        MSLI  + GG  RR+  FDPF  + WD               S+    +AF   ++DWKETP AH+FKADLPGLK EEVK++V +  +L++SGER KE +
Subjt:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWD---------------SSEETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVKMDVNEAKILELSGERMKETK

Query:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        E++++WHRVER SGKF+RRFRLPEN K+E++  +ME+G+LTV+VPK    KP++KSI IS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACAACGACGGTATCCATTACCAAGATAAACACGGAGGCACAGAGACATTTAAAACAACAGTACCAACCCAACTCATTCCATTTCCACCAAATTTACTCCAAAGCAG
TGTACGAAGGAGGTTTAAAGAAAGACCCATGTCACTGATTCGGCGAATGACCGGCGGGAGGCGGCGAAGAAACATGTTCTTCGACCCCTTCGTATTGGAGAATTGGGATT
CATCTGAAGAAACAGCCTCTGCTTTCATGGTCACTCAAATCGACTGGAAAGAGACGCCAAATGCTCACATCTTCAAGGCGGATCTTCCTGGTTTGAAAATAGAAGAAGTG
AAAATGGATGTTAATGAAGCCAAAATTCTGGAGTTGAGTGGTGAGAGAATGAAAGAGACAAAGGAGGAGAGCGAAGAGTGGCACAGAGTGGAGCGGAGGAGTGGTAAGTT
TTTGAGGAGATTCAGATTGCCGGAGAATGTCAAAGTGGAGGACATAAATGTAAGCATGGAGGATGGGATTTTGACGGTGATTGTGCCCAAAATTGAAGGCGTAAAGCCTG
AAATCAAATCCATTGCAATCTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTAAAATCAGATTGGATATTTCTATCTGCCAGAAAATGAGATCCGTTCATGTCCATCACACATTATGGACAACGACGGTATCCATTACCAAGATAAACACGGAGGCACAG
AGACATTTAAAACAACAGTACCAACCCAACTCATTCCATTTCCACCAAATTTACTCCAAAGCAGTGTACGAAGGAGGTTTAAAGAAAGACCCATGTCACTGATTCGGCGA
ATGACCGGCGGGAGGCGGCGAAGAAACATGTTCTTCGACCCCTTCGTATTGGAGAATTGGGATTCATCTGAAGAAACAGCCTCTGCTTTCATGGTCACTCAAATCGACTG
GAAAGAGACGCCAAATGCTCACATCTTCAAGGCGGATCTTCCTGGTTTGAAAATAGAAGAAGTGAAAATGGATGTTAATGAAGCCAAAATTCTGGAGTTGAGTGGTGAGA
GAATGAAAGAGACAAAGGAGGAGAGCGAAGAGTGGCACAGAGTGGAGCGGAGGAGTGGTAAGTTTTTGAGGAGATTCAGATTGCCGGAGAATGTCAAAGTGGAGGACATA
AATGTAAGCATGGAGGATGGGATTTTGACGGTGATTGTGCCCAAAATTGAAGGCGTAAAGCCTGAAATCAAATCCATTGCAATCTCTTAATACATATGTAACAATCGTGT
TATGTTCTGTTCTGTTGAATGAAAAACTCTTTATCCCATAACTCTATGCGATTCAGATTGCCGGAGACTTCAAATTTTTGTATTTAATACTCTGGTATGGATATCAAAGT
CAATGTGTTTATTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDNDGIHYQDKHGGTETFKTTVPTQLIPFPPNLLQSSVRRRFKERPMSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEV
KMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS