; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G11580 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G11580
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationChr5:10199595..10200599
RNA-Seq ExpressionCSPI05G11580
SyntenyCSPI05G11580
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048661.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-11793.39Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NSVIGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEK VY+VLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWAS ISGLAS IIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKK SNWK+S+V FKNIRGTSTTNVAVLLECS+L PCEGVELRDINL+YGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGVQ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

XP_031741281.1 exopolygalacturonase [Cucumis sativus]1.4e-12499.12Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDG HLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWAS ISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

XP_031745093.1 polygalacturonase-like [Cucumis sativus]1.1e-12498.24Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWASP+SGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGV+ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

XP_031745094.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis sativus]3.7e-12598.68Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWASP+SGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGVQ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

XP_031745103.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis sativus]2.2e-12296.04Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANS+IGTGDDCVSIGHSTENIT+TNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMY VKNPIIIDQTY TKK +ESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG+NL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RN+TIVSSCSNAKIATFGVQ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMA6 Uncharacterized protein1.1e-12297.36Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANS+IGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGL   SLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWASP+SGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

A0A5A7TQ89 Exopolygalacturonase-like8.0e-11893.39Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NSVIGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEK VY+VLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWAS ISGLAS IIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKK SNWK+S+V FKNIRGTSTTNVAVLLECS+L PCEGVELRDINL+YGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGVQ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

A0A5A7U0D6 Exopolygalacturonase-like2.3e-11792.95Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NSVIGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEK VY+VLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWAS ISGLAS IIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKK SNWK+S+V FKNIRGTSTTNVAVLLECS+L PCEGVELRDINL+YGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKI TFGVQ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

A0A5A7U4W1 Exopolygalacturonase-like8.0e-11893.39Show/hide
Query:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI
        MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTI NSVIGTGDDCVSIGHSTENI VTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEK VY+VLVKNCTI
Subjt:  MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTI

Query:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL
        FNATNGARIKTWAS ISGLAS IIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY TKKKK SNWK+S+V FKNIRGTSTTNVAVLLECS+L PCEGVELRDINL+YGGTNL
Subjt:  FNATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNL

Query:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        RNTTIVSSCSNAKIATFGVQ PPPCVV
Subjt:  RNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

A0A5D3C9J8 Exopolygalacturonase-like9.1e-10684.96Show/hide
Query:  GFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIF
        GFH S+F CYNFTATN+ IIAPH+SPNTDG+HLSTSKLV IANS+IGTGDDCVSIGHSTE ITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKY +EK VYDVLVKNCTIF
Subjt:  GFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIF

Query:  NATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNLR
        NATNGARIKT+ASPISG AS IIFEDIVMYNVK PIIIDQTY T + KES WKVS+V FKNIRGTS TNVAVLL+CSKL PCEGVELRDI+L+YGGT+L+
Subjt:  NATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNLR

Query:  NTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV
        NTTIVSSCSNAKI TFGVQ PPPC V
Subjt:  NTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPCVV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P24548 Exopolygalacturonase (Fragment)1.7e-5349.34Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +V  C N T    KI A   S NTDG+H+  S  V I N+ I TGDDC+S+G  ++NI +TN+TCGPGHG+SVGSLG+Y  E+ V  + VKNCTI  
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT
        + NG RIKTW     G AS + F+DI M +V  PI+IDQ Y        +  S+ K+S + FKNI+GTSTT  AV L CSK FPC GVEL DI+L+Y G 
Subjt:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT

Query:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
          +     S C N K    G Q P  C
Subjt:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

Q05967 Polygalacturonase7.8e-5448.46Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +V  C N T     + AP NSPNTDG+H+S S  V I +S   TGDDC+S+G  TE + +T VTCGPGHG+SVGSLG    EK V  V V+NCT  N
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT
          NG RIKTW +   G+ + + FEDI++ NV NP++IDQ Y       K   S  K+S V F+NI+GTS T  AV L  SK  PCEG+E+ DI+++Y G 
Subjt:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT

Query:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
          +     SSC N K +  G Q PP C
Subjt:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

Q39766 Polygalacturonase1.1e-5549.34Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +VF C N T   +KI AP  SPNTDG+H+  S+ V I  S I TGDDC+SIG  T+N+ +  +TCGPGHG+S+GSLGK+  E+ V  + + NCTI N
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT
         +NGARIKTW     G  S I FEDI M NV +PI+IDQ Y      KK +ES  K+SN+ FKNIRGTS    A+   CS   PC+ VEL DI++ + G 
Subjt:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT

Query:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
                S C N K  T G   P PC
Subjt:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

Q39786 Polygalacturonase1.9e-5549.34Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +VF C N T   +KI AP  SPNTDG+H+  S+ V I  S I TGDDC+SIG  T+N+ +  +TCGPGHG+S+GSLGK+  E+ V  + + NCTI N
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT
         +NGARIKTW     G  S I FEDI M NV +PI+IDQ Y      KK +ES  K+SN+ FKNIRGTS    A+   CS   PC+ VEL DI++ + G 
Subjt:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT

Query:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
                S C N K  T G   P PC
Subjt:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)1.1e-5246.43Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +V  C + T  ++ + AP  S NTDG+H+  SK VTI N+ I TGDDC+SIG  ++N+T+T V CGPGHG+S+GSLG+Y+ EK V  + VK CT   
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT
          NG R+KTW +   G A+ + F+D+ M NV+NP+I+DQ Y       ++  S  K+SN+ F NIRGTST  VAV++ CS   PC  +++ +INLSY G 
Subjt:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT

Query:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKP
            T   S+CSN K    G Q P
Subjt:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07820.1 Pectin lyase-like superfamily protein8.0e-5449.56Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +V    N T  N+KI+AP +SPNTDG+HL  S  V I NS I TGDDC+S+G   +N+ V  VTCGPGHG+SVGSLG+Y  E+ V  + V NCT+  
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWAS-PISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG
          NG RIKTW S   S  AS I FEDI++ +V NPI+IDQ Y       K+K S  K+ N+ FKNIRGTS    AV L CSK +PC+ VE+ DI++ Y G
Subjt:  ATNGARIKTWAS-PISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG

Query:  TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
         +   T     CSN      G Q P  C
Subjt:  TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

AT3G07830.1 Pectin lyase-like superfamily protein4.0e-5349.56Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +V    N T  N+KI+AP  SPNTDG+HL  S  V+I NS I TGDDCVS+G    N+ V NV CGPGHG+SVGSLG+Y  E+ V  + V NCT+  
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWAS-PISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG
          NG RIKTW S   S  AS I FE+I++ NV NPI+IDQ Y       K+K S+ K++N+ F+ IRGTS    AV L CSK +PCE V++ DIN+ Y G
Subjt:  ATNGARIKTWAS-PISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG

Query:  TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
         +   T +   CSN +    G Q P  C
Subjt:  TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

AT3G07840.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.6e-5249.12Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH +V    N T  N+K+IAP  SPNTDG+HL  S+ V I NS I TGDDC+S+G   +N+ V NV CGPGHG+SVGSLG+Y  E+ V  + V NCT+  
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWAS-PISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG
          NG RIKTW S   +  AS I FE+I++ NV NPI+IDQ Y       K+K S  K+ ++ FKNIRGTS    AV L CSK  PC  VE+ +INL Y G
Subjt:  ATNGARIKTWAS-PISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGG

Query:  TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
         +   T +   CSN      G Q P  C
Subjt:  TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.4e-5248.9Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH ++  C N T T++ I AP  S NTDG+H+  S  V +  + I TGDDCVSIG  TEN+ V NV CGPGHG+S+GSLG+Y  E+ V  V V+ C I N
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT
          NG RIKTW     G+AS I+FEDI M NV  P++IDQ Y      K    S  K+S+V  KNI+GTS T VAV L CSK  PC  + L DINL + G 
Subjt:  ATNGARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGT

Query:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
          +    VS+CSN K    G   P  C
Subjt:  NLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC

AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.6e-5448.31Show/hide
Query:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN
        FH ++  C +F  T + I AP +SPNTDG+H+  S  V  + S I TGDDCVSIG     IT+T++ CGPGHG+SVGSLG+Y  EK V  ++VK+C I  
Subjt:  FHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFN

Query:  ATNGARIKTWA-SPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINL----
         TNG RIKTWA SP    A+ + FE+I+M NV NPIIIDQ+Y    S      S  ++S + FKNIRGTS++ VAV L CS+  PC+ V L +++L    
Subjt:  ATNGARIKTWA-SPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTY----STKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINL----

Query:  SYGG----TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC
        S GG    +N  N  + SSC N +    G Q PPPC
Subjt:  SYGG----TNLRNTTIVSSCSNAKIATFGVQKPPPC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGTTTCACACTTCTGTATTCTATTGCTACAATTTCACTGCTACTAACATGAAAATTATAGCTCCACATAATAGTCCCAACACCGATGGAATGCACCTTAGC
ACCTCAAAATTGGTCACCATTGCCAACAGTGTCATTGGCACCGGTGATGATTGTGTCTCCATTGGCCATAGTACTGAAAATATCACCGTCACCAATGTCACTTGC
GGCCCTGGACATGGCCTTAGTGTGGGCAGCTTGGGCAAGTACTCGAAAGAAAAGGGTGTCTATGACGTTCTAGTAAAGAACTGCACCATTTTCAATGCCACCAAT
GGTGCCAGAATCAAGACTTGGGCTAGCCCTATCTCGGGGTTAGCCTCGAGAATTATCTTTGAAGACATTGTAATGTACAACGTAAAAAATCCTATAATTATCGAT
CAAACCTACAGCACTAAAAAGAAGAAGGAATCAAATTGGAAGGTTAGCAACGTACAGTTCAAGAACATTCGGGGAACATCGACAACGAATGTGGCAGTGTTGTTG
GAGTGCAGCAAGTTGTTTCCATGCGAGGGGGTGGAGTTGAGGGACATTAACTTGAGTTATGGAGGCACCAACTTGAGAAATACGACCATTGTTTCTTCATGTTCA
AATGCAAAGATTGCTACTTTTGGGGTTCAAAAGCCACCACCTTGTGTTGTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGTTTCACACTTCTGTATTCTATTGCTACAATTTCACTGCTACTAACATGAAAATTATAGCTCCACATAATAGTCCCAACACCGATGGAATGCACCTTAGC
ACCTCAAAATTGGTCACCATTGCCAACAGTGTCATTGGCACCGGTGATGATTGTGTCTCCATTGGCCATAGTACTGAAAATATCACCGTCACCAATGTCACTTGC
GGCCCTGGACATGGCCTTAGTGTGGGCAGCTTGGGCAAGTACTCGAAAGAAAAGGGTGTCTATGACGTTCTAGTAAAGAACTGCACCATTTTCAATGCCACCAAT
GGTGCCAGAATCAAGACTTGGGCTAGCCCTATCTCGGGGTTAGCCTCGAGAATTATCTTTGAAGACATTGTAATGTACAACGTAAAAAATCCTATAATTATCGAT
CAAACCTACAGCACTAAAAAGAAGAAGGAATCAAATTGGAAGGTTAGCAACGTACAGTTCAAGAACATTCGGGGAACATCGACAACGAATGTGGCAGTGTTGTTG
GAGTGCAGCAAGTTGTTTCCATGCGAGGGGGTGGAGTTGAGGGACATTAACTTGAGTTATGGAGGCACCAACTTGAGAAATACGACCATTGTTTCTTCATGTTCA
AATGCAAAGATTGCTACTTTTGGGGTTCAAAAGCCACCACCTTGTGTTGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFHTSVFYCYNFTATNMKIIAPHNSPNTDGMHLSTSKLVTIANSVIGTGDDCVSIGHSTENITVTNVTCGPGHGLSVGSLGKYSKEKGVYDVLVKNCTIFNATN
GARIKTWASPISGLASRIIFEDIVMYNVKNPIIIDQTYSTKKKKESNWKVSNVQFKNIRGTSTTNVAVLLECSKLFPCEGVELRDINLSYGGTNLRNTTIVSSCS
NAKIATFGVQKPPPCVV