; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G15850 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G15850
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCoiled-coil domain-containing protein 86
Genome locationChr5:16921989..16922997
RNA-Seq ExpressionCSPI05G15850
SyntenyCSPI05G15850
Gene Ontology termsGO:0005730 - nucleolus (cellular component)
InterPro domainsIPR005579 - Cgr1-like
IPR026570 - Coiled-coil domain-containing protein 86


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143761.1 protein PXR1 [Cucumis sativus]9.1e-93100Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_008465532.1 PREDICTED: protein PXR1 [Cucumis melo]8.5e-9198.43Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADT MEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_022939634.1 protein PXR1 [Cucurbita moschata]4.0e-8089.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SL  PP KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_022992739.1 protein PXR1 [Cucurbita maxima]5.2e-8089.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SL  PP KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
XP_038874831.1 protein PXR1 [Benincasa hispida]4.1e-8594.76Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSL ITESENADT MEIDDSL PPP+KRSAIPSSENPDKPT+ NPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQK IKAAF+ERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNG5 Coiled-coil domain-containing protein 864.4e-93100Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A1S3CP36 Coiled-coil domain-containing protein 864.1e-9198.43Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADT MEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A5D3BKZ5 Coiled-coil domain-containing protein 864.1e-9198.43Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADT MEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAMQV
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A6J1FHS9 Coiled-coil domain-containing protein 861.9e-8089.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SL  PP KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
A0A6J1JYC3 Coiled-coil domain-containing protein 862.5e-8089.53Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV
        MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAE SL I  SENAD  M++D+SL  PP KRSAIPSSENPDKPT+GNPTYDGVI GKVSGRKWKQ RKHRTSAM V
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQV

Query:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
        SRKGTTFEERERQKMIKAA++ERKEELKEQIR NKVEKRKK+EEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
Subjt:  SRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G31410.1 unknown protein5.4e-5162.69Show/hide
Query:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKP---TYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSA
        MACT+DFR LDEGFGGKTYKRKRE  E++    E+   +  M+ID +  PP AKRSA+ SSENPDKP       PTYDGVI GKVSGR WKQ R HR+S 
Subjt:  MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKP---TYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSA

Query:  MQVSRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKS-KQKKLLKVVPEDYI
          V  +    EE +RQ+ IK A+KER  ELKE+IR NKVEKRKK+EEREK+KKEN+LR+GTKLQKITNPKTLKKI+ S KQ+K LK +P++ +
Subjt:  MQVSRKGTTFEERERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKS-KQKKLLKVVPEDYI

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTGCACAATCGACTTCCGCCGCCTGGATGAGGGCTTTGGTGGAAAAACCTATAAGAGAAAGCGTGAAGAAGCTGAGAAAAGCCTCATCATCACTGAATCTGAAAA
TGCCGACACCGGAATGGAGATTGACGACTCACTTCCACCACCACCTGCCAAGCGATCCGCTATTCCTTCGTCAGAAAATCCTGATAAACCGACTTACGGAAACCCCACTT
ACGACGGCGTGATCGGGGGAAAAGTCTCCGGACGGAAGTGGAAACAGGCGCGGAAGCACAGGACGTCGGCTATGCAGGTGAGCCGTAAAGGCACGACGTTCGAGGAGAGG
GAGAGGCAGAAGATGATTAAGGCGGCGTTTAAGGAACGGAAGGAGGAATTGAAGGAGCAGATTAGGTTAAATAAGGTGGAGAAGAGAAAGAAGAGGGAGGAGAGAGAGAA
GAAGAAGAAGGAAAACATATTGAGATCTGGAACTAAGCTACAAAAGATTACAAATCCCAAAACGCTGAAGAAGATTGCTAAGTCTAAGCAAAAGAAGCTCCTCAAGGTTG
TTCCTGAGGATTACATCAAAAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCCTTTTTCACTCTCAGCAGCTTCAAGCTCTGAAACCCTAATCCCCAAATCTCTTCCATGGCGTGCACAATCGACTTCCGCCGCCTGGATGAGGGCTTTGGTGGAAAAAC
CTATAAGAGAAAGCGTGAAGAAGCTGAGAAAAGCCTCATCATCACTGAATCTGAAAATGCCGACACCGGAATGGAGATTGACGACTCACTTCCACCACCACCTGCCAAGC
GATCCGCTATTCCTTCGTCAGAAAATCCTGATAAACCGACTTACGGAAACCCCACTTACGACGGCGTGATCGGGGGAAAAGTCTCCGGACGGAAGTGGAAACAGGCGCGG
AAGCACAGGACGTCGGCTATGCAGGTGAGCCGTAAAGGCACGACGTTCGAGGAGAGGGAGAGGCAGAAGATGATTAAGGCGGCGTTTAAGGAACGGAAGGAGGAATTGAA
GGAGCAGATTAGGTTAAATAAGGTGGAGAAGAGAAAGAAGAGGGAGGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGGAAAACATATTGAGATCTGGAACTAAGCTACAAAAGATTACAA
ATCCCAAAACGCTGAAGAAGATTGCTAAGTCTAAGCAAAAGAAGCTCCTCAAGGTTGTTCCTGAGGATTACATCAAAAAATAGGTCCGTCGCTTTTGTTCTAAGGTTTTC
CCACCATCTTTAAATAGATTTATCAGTTTTGAATCTTGGAATTTTGCCTGTAATCATAAAAATGTTAGCATAACAATATTAAAAATTTTGATTAAACATCTTATTCCGAT
CATTTATAAGGCACAGCGATGGTACGTAATCTTAATGTTAGATGTTTCCGTAGTTCTCATTCGTTTTCTCACCATATAAAATTGTGTAGCAATTGGGTGTATAAAAGTTT
GAAGAAAACTATGAAAGAGAGTTCATTGCTCATCGCATGTAATCATTAGGAAGTTTAAATCTTCACTTTGAAAAAAACATAGATTAGACAAATAAATTTGAGCGACTGGG
TTCATCATTTAGTGGGGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MACTIDFRRLDEGFGGKTYKRKREEAEKSLIITESENADTGMEIDDSLPPPPAKRSAIPSSENPDKPTYGNPTYDGVIGGKVSGRKWKQARKHRTSAMQVSRKGTTFEER
ERQKMIKAAFKERKEELKEQIRLNKVEKRKKREEREKKKKENILRSGTKLQKITNPKTLKKIAKSKQKKLLKVVPEDYIKK