; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G17130 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G17130
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationChr5:18411219..18411998
RNA-Seq ExpressionCSPI05G17130
SyntenyCSPI05G17130
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648529.1 hypothetical protein Csa_008197 [Cucumis sativus]5.2e-85100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK

TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-8494.05Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]7.5e-92100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]3.4e-8493.51Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAV AVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]8.0e-7889.19Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLP      KPKLLTF+TRAADPESPA DSE  GSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST A SSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein3.6e-92100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016671.6e-8493.51Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAV AVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein5.6e-8594.05Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061191.4e-7584.49Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAA--SSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKP K K LTF+TRAADPE+PA D E PGSDGDDFE+RLAKVR++YRSGTGKKAEIRKARKS +GST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAA--SSVYLPPV

Query:  SLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
         LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  SLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

A0A6J1FK14 uncharacterized protein LOC1114447342.6e-7486.56Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTT-AASSVYLPPVS
        MAAIPSSSLQFPNSL L  NSKP KPK LTF+TRAADPESPA DSE P SDGDDFEDRLA  R++ R GTGKKAEIRKARKS++GSTT AASSVYLPPV 
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTT-AASSVYLPPVS

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS
        LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAA AA+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein3.2e-4857.54Show/hide
Query:  FPNSLTLPSNSKPPKPKLL-TFLTRAADPES-------PAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSLKE
        FP+   +P+     KP  L  F   A D ES       P     + G+D D FE RL+ +R+RYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPVSLKE
Subjt:  FPNSLTLPSNSKPPKPKLL-TFLTRAADPES-------PAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSD
        AVSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL+LVELATGKSV++YHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP D
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTCTCTCACACTTCCTTCCAATTCAAAGCCTCCCAAGCCCAAGCTTCTCACCTTCCTAACCAGGGCAGCAGA
TCCGGAATCTCCCGCCGGCGATTCTGAACAACCTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGAATCCGATACCGAAGCGGAACAGGAAAGAAGG
CAGAGATACGGAAGGCTCGCAAGTCCAAGCAAGGTTCTACCACTGCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGTCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGGGGACTTAAAGTG
GAATTCGGATTTAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATATCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCTACCGGAAAAAGCGTCATCAGTTA
TCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTGGCGGCGGTTGCTGCGGTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGTCGGATGAAATCA
AAAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAGTAATTTAAAAGAAAACGAAAGAAAGAGAAAAAAAGTATAAGGCCCAAACGGTTACAGCGAGTTTATCCTGAGCTCAGATTTCTGCTTCCATGGCGGCCATTC
CATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTCTCTCACACTTCCTTCCAATTCAAAGCCTCCCAAGCCCAAGCTTCTCACCTTCCTAACCAGGGCAGCAGATCCGGAATCTCCC
GCCGGCGATTCTGAACAACCTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGAATCCGATACCGAAGCGGAACAGGAAAGAAGGCAGAGATACGGAA
GGCTCGCAAGTCCAAGCAAGGTTCTACCACTGCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGTCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGGGGACTTAAAGTGGAATTCGGATTTA
GTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATATCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCTACCGGAAAAAGCGTCATCAGTTATCATACGCCGGCG
ATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTGGCGGCGGTTGCTGCGGTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGTCGGATGAAATCAAAAGTTAGAATGA
AGCTTTGTTTAATAAATTCAGTAATTTTTTGGGTTGATTTTCATTTTCTGTTTCTGAATTTCTACATTAATTTTGAGTTATGTATGAATGAACACTAGAACTAGAAATAA
TGTGCAGTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPPKPKLLTFLTRAADPESPAGDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRIRYRSGTGKKAEIRKARKSKQGSTTAASSVYLPPVSLKEAVSGGLKV
EFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPSDEIKS