; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G17620 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G17620
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationChr5:18850408..18851064
RNA-Seq ExpressionCSPI05G17620
SyntenyCSPI05G17620
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142832.1 CASP-like protein 4D1 [Cucumis sativus]2.4e-75100Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

XP_008458890.1 PREDICTED: CASP-like protein 4D1 [Cucumis melo]1.1e-7296.77Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSR+TSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFN YHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKK DPDDLFR FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

XP_022992767.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita maxima]6.3e-6081.82Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSG+R+T LILRILTFVFLFISFF+L+TTSQTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F  FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

XP_023549516.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-5981.17Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSG+R+T LILRILTFVFLFISFF+L+TTSQTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F  FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSI+SSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

XP_038877616.1 CASP-like protein 4D1 [Benincasa hispida]1.3e-6589.03Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSR+TSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTV+  KLHFN YH FRYMLATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVKNG+ TILFDFFGDKFLSYLL TG 
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFG+ VDLKK+DPDD F  FFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU83 CASP-like protein1.2e-75100Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

A0A1S3C9H1 CASP-like protein5.4e-7396.77Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSR+TSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFN YHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKK DPDDLFR FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

A0A6J1FG26 CASP-like protein2.9e-5881.29Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        ME SS SR+T L+LRILTFVFLFISFFILITTSQTV+  K HFND+H +RY+LATII+ +VFNLLQIAFSLFNIVKN +GTILFDFFGDKFLSYLLAT  
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKV-DPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFGV VDL++  DP+DLF  FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKV-DPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

A0A6J1FGY1 CASP-like protein1.3e-5879.87Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        ME+SSG+R+T LILRILTFVFLFISFF+L+TTSQTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F  FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSI+SSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

A0A6J1JQU5 CASP-like protein3.1e-6081.82Show/hide
Query:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSG+R+T LILRILTFVFLFISFF+L+TTSQTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F  FFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1XGB4 CASP-like protein PIMP11.5e-2746.71Show/hide
Query:  SLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK----NGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAAA
        SLI+RILT + L ISF ++ T +QTV       K+ F D++ +RY++AT+IIG+ + LLQIAFS+  +       G+G +LFDF+GDKF+SY L TGAAA
Subjt:  SLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK----NGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAAA

Query:  GFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
         FG+  DLK+++  D +  F + + AA++L L  FF + A SI SS+ L KR
Subjt:  GFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

B9NBE5 CASP-like protein 4D19.6e-2744.94Show/hide
Query:  SRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK------NGDGTILFDFFGDKFLSYLL
        SR+T+L LR+LTF FL +S  I+ T + T+      +K+   D++ +RYMLA I  GL + +LQIA +L +I K      +GDG ++FDF+GDK +SY+L
Subjt:  SRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK------NGDGTILFDFFGDKFLSYLL

Query:  ATGAAAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        ATGAAA FG   +LK          FF+K YA+++LLL  F C+A +S+ SS+AL K+
Subjt:  ATGAAAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

B9SXY8 CASP-like protein 4D18.4e-3149.07Show/hide
Query:  SSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLF-----NIVKNGDGTILFDFFGDKFLSY
        S  SR+ +LILRILTF+FL  S  IL T + T+       K+HF D + +RYMLATI+IGL + +LQIAF+L+     N + +GDG + FDFFGDK +SY
Subjt:  SSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLF-----NIVKNGDGTILFDFFGDKFLSY

Query:  LLATGAAAGFGVGVDLKKV-DPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        +L TGAAAGF    D+K V      F  F +K YA+++LLL  F C+A +S+ SS+AL K+
Subjt:  LLATGAAAGFGVGVDLKKV-DPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

C6T1Z6 CASP-like protein 4D12.1e-2948.43Show/hide
Query:  NSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQT--VRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK-----NGDGTILFDFFGDKFLSYL
        +S+GSR   L+LR+LTFVFL I+  ++    QT      ++ FND + +RYM++TIIIG  +NLLQ+A S+F +V      +GDG  LFDFFGDK +SYL
Subjt:  NSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQT--VRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK-----NGDGTILFDFFGDKFLSYL

Query:  LATGAAAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        L +G+AAGFGV V+L +  P +    F DKA A+++LLL AF  +A  S  +SFAL K+
Subjt:  LATGAAAGFGVGVDLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

Q56X75 CASP-like protein 4D24.0e-2545.68Show/hide
Query:  RITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        ++  L+LR+LT VFL I+  IL T S T+       K HF D + +RYML+  +IGLV+ ++Q+ F++      VKN     L DF+GDK +SYL+ATG+
Subjt:  RITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLK-------KVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGV  DLK        +D  D    FF K YA+++LLLFAF C A +S+ SSFA++KR+
Subjt:  AAGFGVGVDLK-------KVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38480.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)3.0e-0731.29Show/hide
Query:  SLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGD--GTILFDFFGDKFLSYLLATGAAAGFGVGV
        S I R +  +F  I+F I+++       Y  +FNDY  +RY+LA  II  ++   Q  F+ F+  +  D   +IL DF GD+ ++YLL + A++     +
Subjt:  SLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGD--GTILFDFFGDKFLSYLLATGAAAGFGVGV

Query:  DLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
         L  +  +    IF D A +A ++ +FAF   A  ++ S + LS  S
Subjt:  DLKKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

AT2G39518.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)2.9e-2645.68Show/hide
Query:  RITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        ++  L+LR+LT VFL I+  IL T S T+       K HF D + +RYML+  +IGLV+ ++Q+ F++      VKN     L DF+GDK +SYL+ATG+
Subjt:  RITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLK-------KVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGV  DLK        +D  D    FF K YA+++LLLFAF C A +S+ SSFA++KR+
Subjt:  AAGFGVGVDLK-------KVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

AT2G39530.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.6e-2445.62Show/hide
Query:  RITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQ--IAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAA
        R   L+LR+LT  FL I+  ++ T + T+       KL FND + +RYML+  +IGLV+ ++Q  +  S F   K    T  FDF+GDK +SYLLATG+A
Subjt:  RITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQ--IAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAA

Query:  AGFGVGVDLK-------KVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AGFGV  DLK       + D  D    FF K YA+++LLLFAF   A +S+ SS ALSKR
Subjt:  AGFGVGVDLK-------KVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAATTCAAGTGGTTCAAGGATAACTTCTCTTATATTGAGAATACTAACATTTGTTTTTCTTTTCATCTCCTTCTTCATTCTTATCACCACTTCTCAAACTGTTCG
ACCATATAAGCTTCATTTCAATGATTATCATGGTTTTAGGTATATGCTTGCTACGATCATCATTGGACTTGTATTTAACCTTCTGCAAATCGCATTCTCCCTCTTTAACA
TAGTTAAGAATGGAGACGGTACTATATTATTCGATTTCTTTGGCGACAAGTTTTTGTCATACCTTCTAGCAACAGGAGCAGCAGCTGGATTTGGAGTTGGAGTTGATTTG
AAAAAAGTAGATCCAGATGATTTGTTTAGAATATTCTTTGATAAGGCCTATGCAGCTTCAACTCTTCTTTTGTTTGCTTTCTTTTGTTCTGCAGCTGTCTCCATTCTCTC
TTCATTTGCACTTTCCAAGAGATCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAAATTCAAGTGGTTCAAGGATAACTTCTCTTATATTGAGAATACTAACATTTGTTTTTCTTTTCATCTCCTTCTTCATTCTTATCACCACTTCTCAAACTGTTCG
ACCATATAAGCTTCATTTCAATGATTATCATGGTTTTAGGTATATGCTTGCTACGATCATCATTGGACTTGTATTTAACCTTCTGCAAATCGCATTCTCCCTCTTTAACA
TAGTTAAGAATGGAGACGGTACTATATTATTCGATTTCTTTGGCGACAAGTTTTTGTCATACCTTCTAGCAACAGGAGCAGCAGCTGGATTTGGAGTTGGAGTTGATTTG
AAAAAAGTAGATCCAGATGATTTGTTTAGAATATTCTTTGATAAGGCCTATGCAGCTTCAACTCTTCTTTTGTTTGCTTTCTTTTGTTCTGCAGCTGTCTCCATTCTCTC
TTCATTTGCACTTTCCAAGAGATCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENSSGSRITSLILRILTFVFLFISFFILITTSQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAAAGFGVGVDL
KKVDPDDLFRIFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS