; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G18160 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G18160
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRibosomal RNA-processing protein 8
Genome locationChr5:19255902..19259270
RNA-Seq ExpressionCSPI05G18160
SyntenyCSPI05G18160
Gene Ontology termsGO:0006364 - rRNA processing (biological process)
GO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007823 - Ribosomal RNA processing protein 8
IPR029063 - S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
IPR042036 - Ribosomal RNA-processing protein 8, N-terminal domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142786.1 ribosomal RNA-processing protein 8 [Cucumis sativus]5.9e-15798.94Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD GSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEP+SQDIVVSA SDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

XP_008458812.1 PREDICTED: ribosomal RNA-processing protein 8 isoform X1 [Cucumis melo]5.4e-15094.7Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRGT+K+K ST NLPDATE SSQDIVVS+ SDGKKT RVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDK+LFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        +YHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP+KFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

XP_022938486.1 ribosomal RNA-processing protein 8-like [Cucurbita moschata]3.7e-14389.4Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S++KRKRAKRR ++K+K  TN++PDATEPS QDIVVS  SDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYL EA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP +F++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEK S GKDIDWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

XP_022993338.1 ribosomal RNA-processing protein 8-like [Cucurbita maxima]4.9e-14389.79Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S+RKRKRAKRRG++K+K  TN++PD TEPS +DIVVS  SDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDI-DWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP KF++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEK S GKDI DWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDI-DWPQLKPCMYKRR

XP_038889651.1 ribosomal RNA-processing protein 8 [Benincasa hispida]3.9e-14893.64Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRG+NK+K STNNLPD T PS QDIVVS  SDG K+ +VSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGF+SALKDFSNKMFILLYFKKKD+KTSEGKDIDWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUD5 Ribosomal RNA-processing protein 82.9e-15798.94Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD GSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEP+SQDIVVSA SDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

A0A1S3C8U7 Ribosomal RNA-processing protein 82.6e-15094.7Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRGT+K+K ST NLPDATE SSQDIVVS+ SDGKKT RVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDK+LFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        +YHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP+KFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

A0A5A7T472 Ribosomal RNA-processing protein 82.6e-15094.7Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G SS+KRKRAKRRGT+K+K ST NLPDATE SSQDIVVS+ SDGKKT RVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDK+LFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        +YHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP+KFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

A0A6J1FDA4 Ribosomal RNA-processing protein 81.8e-14389.4Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S++KRKRAKRR ++K+K  TN++PDATEPS QDIVVS  SDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYL EA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP +F++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEK S GKDIDWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

A0A6J1K1X6 Ribosomal RNA-processing protein 82.4e-14389.79Show/hide
Query:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD
        MAD G S+RKRKRAKRRG++K+K  TN++PD TEPS +DIVVS  SDGKK+ R SGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYF ED+VLFD
Subjt:  MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFD

Query:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
        VYHTGYQEQM HWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDS+SVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA
Subjt:  VYHTGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEA

Query:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDI-DWPQLKPCMYKRR
        RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADP KF++AVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEK S GKDI DWPQLKPC+YKRR
Subjt:  RRVLKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDI-DWPQLKPCMYKRR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O43159 Ribosomal RNA-processing protein 85.6e-4940.14Show/hide
Query:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG
        S  + R R K +   K+K     +PD     +           +     + + +   +M  RL G  FR LNE+LY+     A   F+ED   F +YH G
Subjt:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG

Query:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK
        +Q Q+  WP  PV+ I + L++   S +VADFGCGD RL+ +++N V  FDL S DP V  CDM+  PL+  SVDVAVFCLSLMG N   +L EA RVLK
Subjt:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK

Query:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGK-DIDWPQLKPCMYKRR
        P G L ++EV SRF+      D + F++AV +LGF    KD +N  F L  F+K        K  +   QL+PC+YKRR
Subjt:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGK-DIDWPQLKPCMYKRR

O44410 Ribosomal RNA-processing protein 82.0e-4637.86Show/hide
Query:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG
        SS    K+ ++RG  K K        A E  + D+  +              +  + + + RL  G FR LNEKLYTCTG EA ++FKED   FD+YH G
Subjt:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG

Query:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNV--KNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV
        + +Q+  WP  P+  II+WL+       V D GCG+A++++ V  K+K+ SFDLV+ +  V +CDMS  P + +S D+ ++CLSLMG N   ++ EARRV
Subjt:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNV--KNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV

Query:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        LK  G L I+EV SRF         K+F +A+ ++GF  + +      F+++ FKK ++   E K     +LKPC+YK+R
Subjt:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

Q5U4F0 Ribosomal RNA-processing protein 83.6e-4840.65Show/hide
Query:  RKRKRAKRRGTNKSK--VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTGY
        R R++ KRR  NK +   + + +P        ++  +  SD ++T     + +   +M  RL G  FR LNE+LY+     A   F+ED   F +YH G+
Subjt:  RKRKRAKRRGTNKSK--VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTGY

Query:  QEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLKP
        Q Q+  WP  PV+ I K L++   S +VADFGCGD RL+ +V+N V  FDL + DP V  CDM+  PL+  SVDVAVFCLSLMG N   +L EA RVLKP
Subjt:  QEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLKP

Query:  RGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK-DEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
         G L ++EV SRF+      D + F+ AV +LGF    KD +N  F L  F+K    +      +   +L+PC+YK R
Subjt:  RGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK-DEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

Q84JC0 Ribosomal RNA-processing protein 81.0e-9863.21Show/hide
Query:  SSRKRKRAKRRGTNKSK---VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYH
        +SR RKR ++R    SK   + T       + + +D     +       +    S+FLD +R RLSGG FRMLNEKLYTC+G+EAL+YFKED  +FD+YH
Subjt:  SSRKRKRAKRRGTNKSK---VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYH

Query:  TGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV
        TGYQ+QM++WPELPVN II WL  +  S +VADFGCGDAR++K+VKNKVFSFDLVSK+PSVIACDMSNT L+S+SVDVAVFCLSLMG NY+SY+ EA RV
Subjt:  TGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV

Query:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        L+P G LLI+EVKSRFDP+NGGADPK F+KAVC+LGF S LKDFSNKMFIL +FKKK++  S  K I WP+LK C+YKRR
Subjt:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

Q9DB85 Ribosomal RNA-processing protein 81.6e-4840.5Show/hide
Query:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG
        S  + R R K +  +K+K      P+   P +           K   + S + +   +M  RL G  FR LNE+LY+     A   F+ED   F +YH G
Subjt:  SSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTG

Query:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK
        +Q Q+  WP  PV+ I K L++   S +VADFGCGD RL+ +V+N V  FDL S DP V  CDM+  PL+  SVDVAVFCLSLMG N   +L EA RVLK
Subjt:  YQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLK

Query:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK-DEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
          G L ++EV SRF+      D + F+ AV +LGF    KD +N  F L  F+K    +      +   +L+PC+YKRR
Subjt:  PRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKK-DEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40530.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein7.1e-10063.21Show/hide
Query:  SSRKRKRAKRRGTNKSK---VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYH
        +SR RKR ++R    SK   + T       + + +D     +       +    S+FLD +R RLSGG FRMLNEKLYTC+G+EAL+YFKED  +FD+YH
Subjt:  SSRKRKRAKRRGTNKSK---VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYH

Query:  TGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV
        TGYQ+QM++WPELPVN II WL  +  S +VADFGCGDAR++K+VKNKVFSFDLVSK+PSVIACDMSNT L+S+SVDVAVFCLSLMG NY+SY+ EA RV
Subjt:  TGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV

Query:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR
        L+P G LLI+EVKSRFDP+NGGADPK F+KAVC+LGF S LKDFSNKMFIL +FKKK++  S  K I WP+LK C+YKRR
Subjt:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR

AT5G40530.2 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein1.1e-8758.45Show/hide
Query:  SSRKRKRAKRRGTNKSK---VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYH
        +SR RKR ++R    SK   + T       + + +D     +       +    S+FLD +R RLSGG FRMLNEKLYTC+G+EAL+YFKED  +FD+YH
Subjt:  SSRKRKRAKRRGTNKSK---VSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYH

Query:  TGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV
        TGYQ+QM++WPELPVN II WL  +  S +VADFGCGDAR++K+VKNKVFSFDLVSK+PSVIACDMSNT L+S+SVDVAVFCLSLMG NY+SY+ EA RV
Subjt:  TGYQEQMTHWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRV

Query:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALK-----------------------DFSNKMFILLYFKKKDEKT
        L+P G LLI+EVKSRFDP+NGGADPK F+KAVC+LGF S LK                       DFSNKMFIL +FKKK  +T
Subjt:  LKPRGWLLISEVKSRFDPSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALK-----------------------DFSNKMFILLYFKKKDEKT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGATATGGGCAGCTCAAGCAGAAAGCGGAAGAGAGCGAAGCGTCGGGGAACTAACAAAAGCAAAGTTTCTACCAATAATTTACCGGATGCTACTGAGCCCAGTAG
CCAAGATATCGTTGTTTCTGCTTATTCCGACGGCAAAAAAACTCTGAGGGTTTCCGGCTCGTCTAGTTTCCTCGATAAGATGCGTGCTCGTTTGTCAGGAGGGCATTTCA
GGATGCTTAACGAGAAGTTGTATACTTGCACAGGGGAAGAGGCGCTTAATTATTTCAAGGAAGACAAGGTTTTGTTTGATGTGTATCATACAGGATATCAAGAGCAAATG
ACACATTGGCCTGAGCTTCCTGTGAATTTAATCATAAAATGGCTGAAGGAGCACGATCCCTCATTTATCGTGGCTGATTTTGGCTGTGGGGATGCACGCCTTTCGAAGAA
TGTGAAGAATAAAGTTTTCTCATTTGATCTCGTTTCAAAAGATCCTTCTGTCATTGCTTGTGATATGTCAAATACACCTCTCGACTCTGCATCTGTGGATGTTGCTGTCT
TTTGCCTTTCACTTATGGGAGTCAATTATGCAAGTTACTTGGCAGAAGCGCGACGAGTACTTAAACCACGTGGATGGCTTTTAATATCAGAAGTTAAAAGCAGGTTTGAC
CCTAGCAATGGAGGAGCCGACCCCAAAAAGTTCATAAAGGCTGTTTGTGAGCTAGGTTTCGTCTCAGCTTTGAAGGACTTCTCAAATAAGATGTTTATTTTGTTATACTT
CAAGAAAAAGGATGAGAAAACTTCTGAGGGGAAAGATATTGATTGGCCTCAGCTAAAACCTTGTATGTACAAACGTAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTAAAACCCCAATCCCTAACTCAATAATCGCCCTAGTTGTTTCATCAAGGTTTCAACAATGGCGGATATGGGCAGCTCAAGCAGAAAGCGGAAGAGAGCGAAGCGTCGG
GGAACTAACAAAAGCAAAGTTTCTACCAATAATTTACCGGATGCTACTGAGCCCAGTAGCCAAGATATCGTTGTTTCTGCTTATTCCGACGGCAAAAAAACTCTGAGGGT
TTCCGGCTCGTCTAGTTTCCTCGATAAGATGCGTGCTCGTTTGTCAGGAGGGCATTTCAGGATGCTTAACGAGAAGTTGTATACTTGCACAGGGGAAGAGGCGCTTAATT
ATTTCAAGGAAGACAAGGTTTTGTTTGATGTGTATCATACAGGATATCAAGAGCAAATGACACATTGGCCTGAGCTTCCTGTGAATTTAATCATAAAATGGCTGAAGGAG
CACGATCCCTCATTTATCGTGGCTGATTTTGGCTGTGGGGATGCACGCCTTTCGAAGAATGTGAAGAATAAAGTTTTCTCATTTGATCTCGTTTCAAAAGATCCTTCTGT
CATTGCTTGTGATATGTCAAATACACCTCTCGACTCTGCATCTGTGGATGTTGCTGTCTTTTGCCTTTCACTTATGGGAGTCAATTATGCAAGTTACTTGGCAGAAGCGC
GACGAGTACTTAAACCACGTGGATGGCTTTTAATATCAGAAGTTAAAAGCAGGTTTGACCCTAGCAATGGAGGAGCCGACCCCAAAAAGTTCATAAAGGCTGTTTGTGAG
CTAGGTTTCGTCTCAGCTTTGAAGGACTTCTCAAATAAGATGTTTATTTTGTTATACTTCAAGAAAAAGGATGAGAAAACTTCTGAGGGGAAAGATATTGATTGGCCTCA
GCTAAAACCTTGTATGTACAAACGTAGATGAATTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGTTATGTTAAAAAAAAACTCAAATAACTTCTGCATTTCTACAATCTTATCGTAA
ATTATTTTGTATTTCATTGATGTCGTCAAATGAAATGTGGGTTGGGCAGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADMGSSSRKRKRAKRRGTNKSKVSTNNLPDATEPSSQDIVVSAYSDGKKTLRVSGSSSFLDKMRARLSGGHFRMLNEKLYTCTGEEALNYFKEDKVLFDVYHTGYQEQM
THWPELPVNLIIKWLKEHDPSFIVADFGCGDARLSKNVKNKVFSFDLVSKDPSVIACDMSNTPLDSASVDVAVFCLSLMGVNYASYLAEARRVLKPRGWLLISEVKSRFD
PSNGGADPKKFIKAVCELGFVSALKDFSNKMFILLYFKKKDEKTSEGKDIDWPQLKPCMYKRR