; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G18330 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G18330
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionGlutaredoxin
Genome locationChr5:19385818..19388039
RNA-Seq ExpressionCSPI05G18330
SyntenyCSPI05G18330
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004362 - glutathione-disulfide reductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011767 - Glutaredoxin active site
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
MBS2599907.1 glutaredoxin [Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium]8.5e-48100Show/hide
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XP_008458784.1 PREDICTED: glutaredoxin-C6 [Cucumis melo]3.1e-5098.13Show/hide
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XP_011655411.1 glutaredoxin-C6 [Cucumis sativus]8.3e-51100Show/hide
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XP_022993774.1 glutaredoxin isoform X1 [Cucurbita maxima]4.1e-4285.05Show/hide
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XP_038889541.1 glutaredoxin-like [Benincasa hispida]5.2e-4586.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KR45 Glutaredoxin4.0e-51100Show/hide
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A0A1S3C8S5 glutaredoxin-C61.5e-5098.13Show/hide
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A0A5A7T277 Glutaredoxin-C61.5e-5098.13Show/hide
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A0A6J1FDX0 glutaredoxin2.0e-4285.05Show/hide
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A0A6J1K114 glutaredoxin isoform X12.0e-4285.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P55142 Glutaredoxin-C64.0e-4075.47Show/hide
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        MAL KAKE VAS PV V+SKSYCPFCV+VK+L  +LG +FKAIELD ESDG E+Q+ALA++TGQRTVPNVFI GKHIGGCDDT+ALN+ G+LVPLL EAG
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P55143 Glutaredoxin7.1e-3769.61Show/hide
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        MA+ K KE+V+SN V VFSK+YCP+C  VK+LL +LG  +K +ELDTESDG EIQ ALA++TGQRTVPNVFIGGKHIGGCD T A +S G+LVPLL EAG
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        A+
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Q6K953 Glutaredoxin-C4, chloroplastic7.5e-3974.76Show/hide
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        MAL+KAKEIVAS+PV VFSK+YCPFC +VKRLL +L  S+KA+ELD ESDG E+Q+ALA +TGQRTVP VFI GKHIGGCDDTMA++  G LVPLL EAG
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C21.2e-3670.87Show/hide
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        MA++KAKEIV S  V VFSK+YCP+CV+VK LL +LG  FKA+ELDTESDG +IQ+ LA++TGQRTVPNVFIGG HIGGCD T  L+  G+LVPLL EAG
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Q9ZR41 Glutaredoxin1.2e-3974.53Show/hide
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        M+L KAKEIV+ NPVAVFSK+YCPFCV VK LL+KLG +FKA+ELD+E DG EIQAALA++TGQRTVPNVFIG KHIGGCD T AL+  G+L+PLL EAG
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        AIAK +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G77370.1 Glutaredoxin family protein2.8e-2050Show/hide
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        + SN + +FSKSYCP+C++ KR+ ++L      +ELD   DG +IQ  L +F G+RTVP VF+ GKHIGG DD  A   SG+L  LLA
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AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein8.6e-2252.58Show/hide
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        E  K  VA NPV V+SK++C +  QVK L   L V    +ELD   S+G ++Q  L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC DT+ L++ G L  +LAEA
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein8.5e-3870.87Show/hide
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        MA++KAKEIV S  V VFSK+YCP+CV+VK LL +LG  FKA+ELDTESDG +IQ+ LA++TGQRTVPNVFIGG HIGGCD T  L+  G+LVPLL EAG
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein1.6e-3170.11Show/hide
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        + SK+YCP+CV+VK LL +LG  FKA+ELDTESDG +IQ+ LA++TGQRTVPNVFIGG HIGGCD T  L+  G+LVPLL EAGAIA
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein2.8e-3364.08Show/hide
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        + + KAKEIV++ PV VFSK+YC +C +VK+LLT+LG +FK +ELD  SDG EIQ+AL+++TGQ TVPNVFI G HIGGCD  M  N  G+LVPLL EAG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTGGAGAAGGCTAAAGAGATTGTGGCTTCTAATCCCGTCGCCGTCTTCAGCAAGAGTTACTGTCCATTCTGCGTCCAGGTGAAGAGATTGTTGACTAAGCTAGG
AGTCAGTTTCAAGGCTATTGAATTGGACACTGAGAGTGATGGAAGGGAGATACAAGCTGCACTTGCTCAGTTTACTGGACAACGGACCGTGCCCAATGTTTTCATAGGTG
GGAAGCACATTGGTGGCTGCGATGATACGATGGCACTGAACAGCAGCGGAAGGTTGGTTCCTCTGTTGGCTGAAGCAGGAGCAATTGCCAAAGTCGCTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTCATACCATCTTCTAAACACAAAAGAAAAACTAAAAGAAGTTAAGAAAAAAAGATTTTGAATGGAATATAAAATAAAAGGAGAAGAAAAAATAAGGTTTCCCTACCA
ATTGGCAATTGCATCCAAACGGTTCAACGTGACATATTAAAAATAGTTCTCACACCATCTACACGTGCCGTCTCTTATGTATATATATATAGCCTCTTCATTTTTCATTT
CCAATTTGAGTTTCTTCCTTTCATCTCTTTCTCATTTCATCGTTAGGGTTTTCTAATCGAGGAAAAAAAGTAAATTAATTAACTCCATCATGGCGTTGGAGAAGGCTAAA
GAGATTGTGGCTTCTAATCCCGTCGCCGTCTTCAGCAAGAGTTACTGTCCATTCTGCGTCCAGGTGAAGAGATTGTTGACTAAGCTAGGAGTCAGTTTCAAGGCTATTGA
ATTGGACACTGAGAGTGATGGAAGGGAGATACAAGCTGCACTTGCTCAGTTTACTGGACAACGGACCGTGCCCAATGTTTTCATAGGTGGGAAGCACATTGGTGGCTGCG
ATGATACGATGGCACTGAACAGCAGCGGAAGGTTGGTTCCTCTGTTGGCTGAAGCAGGAGCAATTGCCAAAGTCGCTGCTTAGCGGAGGAGTGTGAGTATGCTATTACAT
AGGGTACAAATAGATAAATAAACCTAACTTTCTACTACTTGTGTTTTCTTTCTCTGCTGTTTTCATTTCTAATGAAGAAAGAAAGTGCTTTCAAAGTGGATTCTAGAAAT
AACTTTAAGGAACCTATGCTTCCTTTGGATCTAATGATAAATTTATGGGGCTTCCTTTGAACCTGTTTGGATCACATCGATTGTTTGGTTGGTTTTGTTTCATGTATGTA
TATTGAATATTCAAGATTTAAATGTCTGGACTCTAAGAGTTATAAATGTCTGGACTCTAGAGTTATTAATGTATGCATGTATATGTCTATCTCGATCTATCAATTTACTA
AAATTTTCATCAATTATACTTTGACATGTGGAATAACTTATTGTAATTAAAATAAGAGGGATTAGTAATCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALEKAKEIVASNPVAVFSKSYCPFCVQVKRLLTKLGVSFKAIELDTESDGREIQAALAQFTGQRTVPNVFIGGKHIGGCDDTMALNSSGRLVPLLAEAGAIAKVAA