; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G23590 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G23590
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1A
Genome locationChr5:23638672..23639691
RNA-Seq ExpressionCSPI05G23590
SyntenyCSPI05G23590
Gene Ontology termsGO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032206.1 hypothetical protein SDJN02_06249, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-3761.11Show/hide
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XP_008446332.1 PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Cucumis melo]4.0e-7193.26Show/hide
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XP_011655674.1 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Cucumis sativus]9.5e-81100Show/hide
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XP_022151083.1 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Momordica charantia]2.9e-3764.25Show/hide
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        S K        E+E ERE+VMRHLLEASDDE    LGIPNGEF V + GV   +LCDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
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XP_038891727.1 uncharacterized protein LOC120081124 [Benincasa hispida]3.9e-5883.91Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BFM2 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A1.9e-7193.26Show/hide
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A0A5D3D3N5 Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A1.9e-7193.26Show/hide
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A0A6J1DB83 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A1.4e-3764.25Show/hide
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A0A6J1H1H5 uncharacterized protein LOC1114587171.5e-3659.89Show/hide
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        SV +   C  +       EE GERE+VMRHLLEASDDELGIPN EF VG+ G+DGVALCDALWELEDEAANYYTLF SQLF+
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A0A6J1JJY7 uncharacterized protein LOC1114851174.5e-3658.29Show/hide
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Query:  SSSSSSSSSVANSPKCIINKEELEEEGEREKVMRHLLEASDDELGIPNGEFFVGDNGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26920.1 unknown protein2.4e-2143.98Show/hide
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        KR R    + EE    E  KRQK        SYNQIL LL + +EQ +   DL+S I  LQQEISS                    Y+  S +S+   S 
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        S      C+ +KEE  E+  +EKVM+HLLEASDDELGIPN +F              GD+ +DG    DA WELEDEAANYYTL QS+LFM
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AT1G69760.1 unknown protein8.2e-2245.03Show/hide
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        KRQR + E  E ++  EE KRQK      SYNQ+L+LL+++ E      D++S+ITTLQQEIS+              + ++ + + S SSS SSSSSS 
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Query:  ANSPKCIINKEELEEEGEREKVMRHLLEASDDELGIPNGEF----------FVGDNGVDGVALCD----ALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
         +        +E E +G++EKVM+HLLEA+DDELGIPN EF              + V+G +L D     LWELEDEAANYYTL QS+LFM
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCAAAACGCCAGAGAAGCGATGCAGAAATAACCGAGGAGCTGAGGGAGGGAGAAGAACTCAAACGCCAAAAATCATACAATCAAATCCTATCCCTTTTAGAAGA
ACAAGAAGAACAAGAAGAAGAAATTGAAGATTTATCCTCAATTATCACCACCCTCCAACAAGAAATCTCTTCTCCAATCATCCAAACACAAACAACACAGACTGGACTTA
CACACTCTCTTTCTCTACAAGATTATTCTTCTTCATCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTAGCTAATTCTCCTAAATGTATTATCAACAAGGAGGAGTTA
GAAGAAGAGGGTGAAAGAGAAAAAGTCATGAGACACCTTCTGGAAGCTTCAGATGATGAACTTGGGATTCCAAATGGAGAGTTTTTTGTGGGTGATAATGGAGTTGATGG
AGTGGCTTTGTGTGATGCTTTGTGGGAATTGGAAGATGAAGCTGCTAATTACTATACTCTTTTTCAATCTCAGCTTTTTATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTGACCTAAAATTCTTGGGGTCTATTTAACCCTTCTCATCCTCCACTCTCTCTCCTCATCTTTTTTTTCTCTATTCAAATCCTCTCTCTCTCTTTTACAAGACCAATA
ACAAAAACAAAACAATGGCATCAAAACGCCAGAGAAGCGATGCAGAAATAACCGAGGAGCTGAGGGAGGGAGAAGAACTCAAACGCCAAAAATCATACAATCAAATCCTA
TCCCTTTTAGAAGAACAAGAAGAACAAGAAGAAGAAATTGAAGATTTATCCTCAATTATCACCACCCTCCAACAAGAAATCTCTTCTCCAATCATCCAAACACAAACAAC
ACAGACTGGACTTACACACTCTCTTTCTCTACAAGATTATTCTTCTTCATCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTAGCTAATTCTCCTAAATGTATTATCA
ACAAGGAGGAGTTAGAAGAAGAGGGTGAAAGAGAAAAAGTCATGAGACACCTTCTGGAAGCTTCAGATGATGAACTTGGGATTCCAAATGGAGAGTTTTTTGTGGGTGAT
AATGGAGTTGATGGAGTGGCTTTGTGTGATGCTTTGTGGGAATTGGAAGATGAAGCTGCTAATTACTATACTCTTTTTCAATCTCAGCTTTTTATGTAGCCTTCTTCTTC
TTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTATTAATTATGGAATCATATTGTAGGAGTAAATTATTCAGTGTTAGAAGAACAATTCAAAAGAACAAAAAGAAAAAGAAAAAGAGA
GGATTATTATATTGATTGAAAGAAGGGTTAAAAAAGCTCATCATCTCTGTTCTTCTAAGCAAATGGGAAGAGTAGTCTGAATTTCAATCATCTTAGAATGAAACCAACAG
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TTAAAAGAGAAATATAATATAAGATAGGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASKRQRSDAEITEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEQEEQEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTQTTQTGLTHSLSLQDYSSSSSSSSSSSSSSVANSPKCIINKEEL
EEEGEREKVMRHLLEASDDELGIPNGEFFVGDNGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM