; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G25900 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G25900
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDNA repair REX1-B protein
Genome locationChr5:25003453..25005931
RNA-Seq ExpressionCSPI05G25900
SyntenyCSPI05G25900
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039491 - Required for excision 1-B domain-containing protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023541138.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-8987.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUN3 Uncharacterized protein2.9e-103100Show/hide
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A0A1S3BGI9 uncharacterized protein LOC1034893473.0e-10097.54Show/hide
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A0A5D3CFT2 Uncharacterized protein3.0e-10097.54Show/hide
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A0A6J1G147 uncharacterized protein C19orf60 homolog1.1e-8987.5Show/hide
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A0A6J1HYI6 uncharacterized protein C19orf60 homolog1.1e-8987.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G04910.1 unknown protein2.4e-6561.29Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTCGATGAACAAATGGAGGAAGATCGGAAAACCGATTCCTCTAACACTCTCTCTTTGCTCCGCCAGTTTCTCGAAATCCAGCA
GCGTAGAGCTGAAGCTTATTCCAAGCTTAAAAGGGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTACGGAATTCA
GTAATTGCTCTAAACAAGTCATTGACATCGAATCGAATTTCCGGAGTTCAGATCATAACAGGCTCGAGTTAGCCAACCAGCTTAGATCTGTTCAAGAACAAGAAAAGCAG
AAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAAGCTGGCCGCCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGTAGATTCAATGCACCTCGAGAGCACGAGTG
TGTGCATGTCCATGAGATAACCGAAGCTTCAGGTACCGAGGAAGCAGAAGCAGATGCGGAATACGACAATGCTCTAAAGGAAGCAATCAAAGGTGTGCAAGATGCTGTGA
CGACCATAAATGAGCACATGGAGGAGGTGAGATACGAGATCGAAGCTCTCGAAGATAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTCACGGAGTTGTATATATAGAGAGAGAAGTGTGAGACAATTGAGGTTTCATAACATCGCTGAACTAAACTAAAGAATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTCGAT
GAACAAATGGAGGAAGATCGGAAAACCGATTCCTCTAACACTCTCTCTTTGCTCCGCCAGTTTCTCGAAATCCAGCAGCGTAGAGCTGAAGCTTATTCCAAGCTTAAAAG
GGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTACGGAATTCAGTAATTGCTCTAAACAAGTCATTGACATCGAAT
CGAATTTCCGGAGTTCAGATCATAACAGGCTCGAGTTAGCCAACCAGCTTAGATCTGTTCAAGAACAAGAAAAGCAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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