; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G26120 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G26120
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description5'-nucleotidase
Genome locationChr5:25105973..25108523
RNA-Seq ExpressionCSPI05G26120
SyntenyCSPI05G26120
Gene Ontology termsGO:0009117 - nucleotide metabolic process (biological process)
GO:0016311 - dephosphorylation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0000287 - magnesium ion binding (molecular function)
GO:0008253 - 5'-nucleotidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006434 - Pyrimidine 5'-nucleotidase, eukaryotic
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601237.1 Cytosolic 5'-nucleotidase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-16687.79Show/hide
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XP_004135048.1 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Cucumis sativus]2.9e-19098.84Show/hide
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XP_008446729.1 PREDICTED: 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Cucumis melo]8.7e-18796.8Show/hide
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XP_022150560.1 cytosolic 5'-nucleotidase 3 [Momordica charantia]4.5e-16788.3Show/hide
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XP_038893141.1 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Benincasa hispida]5.1e-17189.53Show/hide
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A0A0A0KRD5 5'-nucleotidase1.4e-19098.84Show/hide
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A0A1S3BGK8 5'-nucleotidase4.2e-18796.8Show/hide
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A0A5A7SXP5 5'-nucleotidase4.2e-18796.8Show/hide
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A0A6J1D8T4 5'-nucleotidase2.2e-16788.3Show/hide
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A0A6J1J014 5'-nucleotidase2.4e-16687.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TAG6 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase B2.9e-4436.92Show/hide
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         +  D + Q V       R+G    F  L ++ +P+ IFSAG+ D++EE++RQ    H    N ++VSN M FDDNG L  FKG  IH+ NKN   L   
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Q3UFY7 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase1.9e-4333.89Show/hide
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         +WW K+HSLL +  +    I Q V  +T   REG    F+ L +  +P+ IFSAG+ DI+EE++RQ +     NI IVSN M F ++G L  FKG+ IH
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        + NKN    + ++                  ++ +TN++LLGD IGDL M+DG+      + +GFLND +E   + Y +++D+V   D ++  V  L+R 
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Query:  L
        +
Subjt:  L

Q5ZKF6 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase1.3e-4435.14Show/hide
Query:  LQPSETVVADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQG---NPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWG
        LQ S   +   + +   + A++  G  KLQVI+DFD TL+R+  +G R  TSH +L      + +   K  +L  +Y+P+E  P  + EEK  LM EWW 
Subjt:  LQPSETVVADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQG---NPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWG

Query:  KSHSLLIEGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKN
        ++H LL +  +    I Q V  + +  R+G  ELF+ L +  VP+ IFSAG+ D++EE++RQ  +  + N+ +VSN M FDD+G L  FK   IH+ NKN
Subjt:  KSHSLLIEGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKN

Query:  EHALDMAAPLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASMLGVVKLVRQL
           L   A                  +  RT+++LLGD +GDL M+DG+ + +  + +GFLND +E     Y +A+D+V  +D ++  V  ++R +
Subjt:  EHALDMAAPLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASMLGVVKLVRQL

Q7SYN4 Cytosolic 5'-nucleotidase 35.0e-4435.84Show/hide
Query:  VADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDELY---KYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSLLI
        + D + +++ +  L   G  KLQ+I DFD TL+R+ ++G R  + H ++       D  R +L    + Y+P+E  P ++ EEK   M EW+ KSH+LL+
Subjt:  VADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDELY---KYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSLLI

Query:  EGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA
        E  L  D + ++V  + ++ +EG  + F+ L +  VPV IFSAGL D++EE++RQ       N+++VSN M FDDNG L  FKG+ IH  NK++ AL   
Subjt:  EGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA

Query:  APLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASM
             QL D               N++LLGD +GDL M+DG+ N +  + +G+LND +E  L+ Y +++++V   D ++
Subjt:  APLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASM

Q7ZWS2 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A1.3e-4436.92Show/hide
Query:  DSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDE---LYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSLLIEG
        D + L+ K+  ++  G +KLQ+I+DFD TL+R+  +G R  T + ++   N   D  R +   L+  Y+PLE  P  S EEK  LM EWW K+H L  E 
Subjt:  DSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDE---LYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSLLIEG

Query:  GLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQK--LHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA
         +  D + Q V  +    R+G    F  L ++ +P+ IFSAG+ D++EE++RQ    H    N ++VSN M FDDNG L  FKG  IH+ NKN   L   
Subjt:  GLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQK--LHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA

Query:  APLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLN-YDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASM
            +              +  RTN+LLLGD +GDL M+DG++  +  I +GFLND +E   + +  ++D+V L D ++
Subjt:  APLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLN-YDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38680.1 5'-nucleotidases;magnesium ion binding2.9e-11167.81Show/hide
Query:  SETVVADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRG-QTSHGLLKQGNPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSL
        + TV+A    L  K+  +R +GP K QVIADFDATLTRY ++G RG QTSHGLL+QG+  YD KR  LY +YHPLE SP I  +EKTKLMEEWWGK+H L
Subjt:  SETVVADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRG-QTSHGLLKQGNPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSL

Query:  LIEGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALD
        LIEGGLT+DAIK+SV  ++IAFREGV ELFE LE+K +PVLIFSAGLAD+IEEVLRQ L R+FKN++IVSNRMVF+D+G LVSFKGK IH LNKNEHALD
Subjt:  LIEGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALD

Query:  MAAPLHDQLG-DVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASMLGVVKLVRQLF
        MAAPLHD+LG D+     +  ++++R NVLL+GDH+GDL MSDGL+Y+TRIS+GFLNDNIE SL+SYR +FD+VYLNDA M G ++LV +LF
Subjt:  MAAPLHDQLG-DVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDASMLGVVKLVRQLF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTGTTCGAGTCCAATTCATTTCAACCACTCCTCTTCGTTTCGCCTCCATCTTCAATCTCAATCTCCGTTCTTCTCCATTTTCCACTTCCAGGCTCTTGTTTTGCGG
ACGCCGAAACGTGATTGGAATGGACGAAAAAGGATTCTTACAGCCTTCTGAGACAGTTGTTGCCGATTCCGATTTGCTGAAGAAGAAGCTCGATGCTTTGCGTTTTTCCG
GTCCGCAGAAGCTCCAGGTTATTGCTGATTTTGATGCTACGCTAACGAGGTACTGGATTGATGGCTGCCGTGGTCAAACTAGTCATGGTCTTCTAAAGCAGGGGAATCCT
GAATATGATACTAAGAGGGATGAACTTTATAAATATTACCATCCTTTGGAATATTCTCCTACAATTTCGAGAGAAGAGAAAACCAAGCTCATGGAAGAATGGTGGGGCAA
AAGCCATTCACTTCTGATTGAAGGAGGACTTACGTTTGATGCAATAAAGCAATCAGTTACTGCTGCCACTATTGCTTTTAGGGAGGGAGTGGTTGAGCTGTTTGAACTTC
TAGAGGAAAAGGGTGTTCCTGTTCTAATATTTTCAGCAGGCCTTGCTGACATTATAGAGGAGGTCCTGAGGCAGAAACTTCACAGATCTTTTAAAAATATTAGGATCGTT
TCAAATAGAATGGTGTTTGATGATAATGGTTGCCTTGTATCATTTAAGGGCAAGACGATTCATAGTCTAAATAAAAATGAGCATGCTCTTGATATGGCTGCTCCTCTGCA
TGACCAATTGGGTGATGTAGATGGCACAATTAATGACGGCGCCTCTGTAAGAAAACGGACAAATGTACTTCTTCTTGGTGACCACATTGGGGATTTGGGGATGTCAGACG
GTTTAAACTATGACACTCGGATATCCGTGGGGTTTTTGAATGACAACATCGAGAACTCTCTTGATAGCTATCGTAATGCTTTTGATGTTGTTTACCTGAATGATGCATCC
ATGCTGGGAGTAGTTAAACTTGTACGTCAGCTCTTTCCCGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATAATTTTCCTTTATTTTTCCTAAAAACAATATTTTTCGGACGCTCCATACCAAAAACGAAGGATGAGTGTTCATTAGATTTCAGGCGAACGCCCAAATGACTGTTCG
AGTCCAATTCATTTCAACCACTCCTCTTCGTTTCGCCTCCATCTTCAATCTCAATCTCCGTTCTTCTCCATTTTCCACTTCCAGGCTCTTGTTTTGCGGACGCCGAAACG
TGATTGGAATGGACGAAAAAGGATTCTTACAGCCTTCTGAGACAGTTGTTGCCGATTCCGATTTGCTGAAGAAGAAGCTCGATGCTTTGCGTTTTTCCGGTCCGCAGAAG
CTCCAGGTTATTGCTGATTTTGATGCTACGCTAACGAGGTACTGGATTGATGGCTGCCGTGGTCAAACTAGTCATGGTCTTCTAAAGCAGGGGAATCCTGAATATGATAC
TAAGAGGGATGAACTTTATAAATATTACCATCCTTTGGAATATTCTCCTACAATTTCGAGAGAAGAGAAAACCAAGCTCATGGAAGAATGGTGGGGCAAAAGCCATTCAC
TTCTGATTGAAGGAGGACTTACGTTTGATGCAATAAAGCAATCAGTTACTGCTGCCACTATTGCTTTTAGGGAGGGAGTGGTTGAGCTGTTTGAACTTCTAGAGGAAAAG
GGTGTTCCTGTTCTAATATTTTCAGCAGGCCTTGCTGACATTATAGAGGAGGTCCTGAGGCAGAAACTTCACAGATCTTTTAAAAATATTAGGATCGTTTCAAATAGAAT
GGTGTTTGATGATAATGGTTGCCTTGTATCATTTAAGGGCAAGACGATTCATAGTCTAAATAAAAATGAGCATGCTCTTGATATGGCTGCTCCTCTGCATGACCAATTGG
GTGATGTAGATGGCACAATTAATGACGGCGCCTCTGTAAGAAAACGGACAAATGTACTTCTTCTTGGTGACCACATTGGGGATTTGGGGATGTCAGACGGTTTAAACTAT
GACACTCGGATATCCGTGGGGTTTTTGAATGACAACATCGAGAACTCTCTTGATAGCTATCGTAATGCTTTTGATGTTGTTTACCTGAATGATGCATCCATGCTGGGAGT
AGTTAAACTTGTACGTCAGCTCTTTCCCGTTTGAGGTGTCTGATGGACAGATCTCTTTTGTATAGTTAATGAAGGTGATCACTTACAATTCTGAACATGAATATCGTTCT
CCTTTCTGGTAGCTGAGTGACAATACTCATTGCTTTTACTTAGCATTCTTTAGTAGAGTAGTTGAATAAGGAGCCAGGCATTTGAATGTGAACCTGAGAAATTAATTTCT
TGACGTAGGGTTTCTCTGCTGACAATGGATGCTTTTTGGTGGTCACTCATCATTATTGGTTAATCATTTAAAGTTCCTTGTTTCATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTVRVQFISTTPLRFASIFNLNLRSSPFSTSRLLFCGRRNVIGMDEKGFLQPSETVVADSDLLKKKLDALRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGCRGQTSHGLLKQGNP
EYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISREEKTKLMEEWWGKSHSLLIEGGLTFDAIKQSVTAATIAFREGVVELFELLEEKGVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIV
SNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMAAPLHDQLGDVDGTINDGASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDVVYLNDAS
MLGVVKLVRQLFPV