; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G27930 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G27930
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH10-like
Genome locationChr5:26384605..26385699
RNA-Seq ExpressionCSPI05G27930
SyntenyCSPI05G27930
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR026960 - Reverse transcriptase zinc-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062879.1 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH10-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-0449.12Show/hide
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TYK31299.1 protein FAM91A1 [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-1041.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3C7R2 DUF21 domain-containing protein6.9e-0846.34Show/hide
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A0A5D3DFZ0 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH10-like7.1e-0549.12Show/hide
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A0A5D3E632 Protein FAM91A12.5e-1041.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGATTGGAGGCTTTCTGGCAGTTTTCAACCAAGTGTTCCTTAAGTTGACTACAGGGTCCCCAAAATTTAATCTCCCTATGTCCAATCTTATTTGCAAACCAAAAAT
TCCTAAAAACACGAAGTTTTTCCTTTGGTCCCTTCTGACCGAAGCCTCAACACTCATGACAGCCTCCAAACGAGGTTTCGTAATTGGTTTCTTTCCCTTTCCATGTTTCT
TCTTTTGCCAGAAGGAGGTCGAGACCTTAGACCATTTATTCTTACACTGCGAGTTCACTTCAAAGGGTGAAGTAGGATTTTTTATACTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCAAAGCTTACCGTGCTACTTCTTCTCCTTATTGAAGGCTTCAAAGTGTTATATTTCTCACTTGGGGAAGCTTGTTCGTGACTTTGGACCAGAGGAATTGGTAATTCGGC
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CAAGTGTTCCTTAAGTTGACTACAGGGTCCCCAAAATTTAATCTCCCTATGTCCAATCTTATTTGCAAACCAAAAATTCCTAAAAACACGAAGTTTTTCCTTTGGTCCCT
TCTGACCGAAGCCTCAACACTCATGACAGCCTCCAAACGAGGTTTCGTAATTGGTTTCTTTCCCTTTCCATGTTTCTTCTTTTGCCAGAAGGAGGTCGAGACCTTAGACC
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GTTTAGTCCTTTCAATTCTTTTTAGGCTCTTGTGTCTTAGTGGTGTACAAATTACACAGTTATTTTGTAATTATAGCCTTTTCATAATTATTAACAATTGAAGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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