; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G28890 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G28890
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationChr5:27290218..27291204
RNA-Seq ExpressionCSPI05G28890
SyntenyCSPI05G28890
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]2.9e-4798.96Show/hide
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]4.8e-4291.67Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]3.7e-4291.67Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]5.1e-4492.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor1.1e-4498.91Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 21.4e-4798.96Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 21.4e-4798.96Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like2.3e-4291.67Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like1.8e-4291.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 12.3e-2371.43Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 31.0e-2360.64Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     + +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 12.3e-2371.43Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.9e-2558.76Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          S +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT   L CAACGCHRNFHR++V TEVVC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 24.9e-3779.8Show/hide
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        MRKRQVVLRR+  EEPSR  S ASS TVR+VRYGECQKNHAA VGGYAVDGCREFMAS G+EGT A LTCAACGCHR+FHRR++ TEVVCDC+S PS G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger7.5e-2560.64Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.4e-2658.76Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 244.4e-1767.31Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 23.4e-3879.8Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 222.6e-1767.31Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGACTCTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCA
CGCTGCCGGTGTCGGAGGATACGCCGTTGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGA
ATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATAAAGAAAATTAATAATTATTTTATCTCGTTTATTTAAAAATCCATATGATATATAATTAACAAATGAGAAAATGACATGTCATAAAAGCTATTTTTCCAATTGAA
CTTTTTTCCAACTCTATTTAAACAAGTGCTTTAAGGGTTAGGGTTTCAGCCAAGAACCCCATTTCAATTTGTAAAATCTCTCCCTGACTCCTACACTGAATTTATTATTC
CATTACCAAAATTTGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAACAAGACCTAGCTAATTACCCTAAAAAGGATTTTTTTTTTTTTTTTACAATTTTTCCTTTGGTTCAAATG
AGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGACTCTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCACGC
TGCCGGTGTCGGAGGATACGCCGTTGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACTGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGAATT
TTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAATTAAAAGACTGTACATATAATAATACTATAACTTCAGTGTGT
ATGGGGTGAGGAATTTTTTCTCTTTTTTTTTGGGGGGGGTGCTGAATAAACGAAATTTCTCAACATGGGATTAGGAGTTGAGATTCAGCTTTGTGGTTGTGTTGCTTGAA
TTATTATTATTATTATTTTTATAAAAAATTCTTGTGTTGGATTGGAATGAACTTGACTTGAACCAAGAAATTGTGTGTTTTGTGTAATTTGAATTTTTTTCCCCCTTTAA
TTTCAGGTTCATTTGAGGATAAAAAAAAGTTATGTAAATCCTTTTTTTTTTTTTCATTATATCTCTTTTGAATTATATATGTATTTGATTTGAGTGTATCTTTTGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRRSEEPSRDSVASSFTVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTTAGLTCAACGCHRNFHRRQVGTEVVCDCSSSPSNGT