; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI05G29140 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI05G29140
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionVesicle transport v-SNARE family protein
Genome locationChr5:27488460..27492009
RNA-Seq ExpressionCSPI05G29140
SyntenyCSPI05G29140
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0012507 - ER to Golgi transport vesicle membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0031902 - late endosome membrane (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR007705 - Vesicle transport v-SNARE, N-terminal
IPR010989 - SNARE
IPR027027 - GOSR2/Membrin/Bos1
IPR038407 - Vesicle transport v-SNARE, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578564.1 Vesicle transport v-SNARE 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.8e-10495.02Show/hide
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KAG7016122.1 Vesicle transport v-SNARE 13 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-10394.57Show/hide
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XP_004141451.1 vesicle transport v-SNARE 11 [Cucumis sativus]4.0e-108100Show/hide
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XP_008459347.1 PREDICTED: vesicle transport v-SNARE 11 [Cucumis melo]1.3e-10698.64Show/hide
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XP_022939644.1 vesicle transport v-SNARE 13-like [Cucurbita moschata]7.8e-10495.02Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUA8 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein1.9e-108100Show/hide
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A0A1S3C9G1 vesicle transport v-SNARE 116.2e-10798.64Show/hide
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A0A5D3BNH0 Vesicle transport v-SNARE 116.2e-10798.64Show/hide
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A0A6J1FHT9 vesicle transport v-SNARE 13-like3.8e-10495.02Show/hide
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A0A6J1K0S2 vesicle transport v-SNARE 132.4e-10394.57Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O89116 Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A1.0e-2633.64Show/hide
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        MS  F+GYE+ +  L+A ++ K      L  ++KKQ V+ V+  ++EA  L+ +MDLE R +PP  + +   ++R YK ++  L+++ KR        A 
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         DE+    + D   +S +QR+ L+  TERL++SS R++   +  +ETE++G  +L++L   R+ +  A + L   D N+GKS RILT M RR+ +N+ ++
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          + I++V+AI+  + F
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Q96AJ9 Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A1.0e-2632.58Show/hide
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         DE+    + D   +S +QR+ L+  TERL++SS R++   +  +ETE++G  +L++L   R+ +  A   L   D N+GKS RILT M RR+ +N+ ++
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          + I++V+ I++ + F + +
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Q9LVP9 Vesicle transport v-SNARE 139.0e-8776.02Show/hide
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        MS+ F+ YERQYCE+SANLS+KCTSA AL+GEQKKQ +SE+K+G++EAEAL++KMDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SG+L+A  
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        RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ L +++DRIK+SRRT+LETEELGVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW +
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         +II VLVLAII ILYFKLT+
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Q9SEL5 Vesicle transport v-SNARE 121.9e-7669.68Show/hide
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        MS+VF+GYERQYCELS NLSRKC SAS L NGE+KK K++E+K+GIDEA+ LIRKMDLEARSL P+ KAV L+KLREYKSDLN LK E KR+ S     +
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        +R+EL+ESGMAD    SADQR RL  + ERLD+SSDRI+ESRR MLETEE+G+SI+QDL  QRQ+LLHAHN LHGVDD I KSK++LT MSRRM +NKWI
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        +TS+I+ LVLAIILI+ +KL+
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Q9SEL6 Vesicle transport v-SNARE 114.0e-8775.57Show/hide
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        MS+VFDGYERQYCELSA+LS+KC+SA +L+GEQKKQK+SE+K+G++ AE LIRKMDLEAR+LPPN+K+ LL KLRE+KSDLNN K+EVKRI SG L+AA 
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        RDELLE+GMADT TASADQR+RLM +TERL +++DR+K+SRRTM+ETEE+GVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDNIGKSK+ILT+M+RRMNKNKW +
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         +III L+ AI +ILYFKLTK
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26670.1 Vesicle transport v-SNARE family protein1.3e-7769.68Show/hide
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        MS+VF+GYERQYCELS NLSRKC SAS L NGE+KK K++E+K+GIDEA+ LIRKMDLEARSL P+ KAV L+KLREYKSDLN LK E KR+ S     +
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        +R+EL+ESGMAD    SADQR RL  + ERLD+SSDRI+ESRR MLETEE+G+SI+QDL  QRQ+LLHAHN LHGVDD I KSK++LT MSRRM +NKWI
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Query:  VTSIIIVLVLAIILILYFKLT
        +TS+I+ LVLAIILI+ +KL+
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AT3G29100.1 vesicle transport V-snare 132.6e-6577.06Show/hide
Query:  IRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGSLSAATRDELLESGMADTLTASADQRSRLMSTTERLDKSSDRIKESRRTMLETEELG
        ++KMDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SG+L+A  RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ L +++DRIK+SRRT+LETEELG
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        VSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW + +II VLVLAII ILYFKLT+
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AT3G29100.2 vesicle transport V-snare 132.9e-6477.84Show/hide
Query:  MDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGSLSAATRDELLESGMADTLTASADQRSRLMSTTERLDKSSDRIKESRRTMLETEELGVSI
        MDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SG+L+A  RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ L +++DRIK+SRRT+LETEELGVSI
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Query:  LQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIIVLVLAIILILYFKLTK
        LQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW + +II VLVLAII ILYFKLT+
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AT5G39510.1 Vesicle transport v-SNARE family protein2.9e-8875.57Show/hide
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        MS+VFDGYERQYCELSA+LS+KC+SA +L+GEQKKQK+SE+K+G++ AE LIRKMDLEAR+LPPN+K+ LL KLRE+KSDLNN K+EVKRI SG L+AA 
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Query:  RDELLESGMADTLTASADQRSRLMSTTERLDKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIV
        RDELLE+GMADT TASADQR+RLM +TERL +++DR+K+SRRTM+ETEE+GVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDNIGKSK+ILT+M+RRMNKNKW +
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Query:  TSIIIVLVLAIILILYFKLTK
         +III L+ AI +ILYFKLTK
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AT5G39630.1 Vesicle transport v-SNARE family protein6.5e-4045.25Show/hide
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        MS VF  Y++QY ELS NLS+KC+ A +L G +KK+K+SE+   ++ AE LI KMD  A +LPPN+K++LL KL+E KS L  L++E+KR  S +L   T
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Query:  RDELLESGMADTLTASADQRSRLMSTTERLDKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIV
        R+E+LE+  AD     ADQRSRLM +TE L ++ + IK+S+R +LETE +G+SIL++L  Q++SL ++   LH +DD + +S+ I+ ++     K  + V
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Query:  TSIIIVLVLAIILILYFKLTK
        T+ II+  L       FKL K
Subjt:  TSIIIVLVLAIILILYFKLTK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGAGGTGTTCGACGGATATGAACGGCAATACTGCGAGCTTTCGGCGAATCTGTCAAGAAAATGCACTTCGGCTAGTGCCCTTAATGGAGAGCAAAAGAAGCAAAA
GGTTTCTGAAGTAAAGACAGGAATTGATGAAGCAGAAGCTCTGATTCGGAAAATGGATCTTGAGGCCAGAAGTTTGCCGCCTAATGTCAAGGCTGTCCTTCTAGCTAAAT
TGAGAGAGTACAAATCTGACCTCAACAACTTAAAAAGTGAAGTTAAACGCATTGAATCTGGAAGCTTAAGTGCAGCCACTAGAGATGAGTTGCTGGAATCAGGAATGGCT
GATACATTGACGGCATCAGCTGACCAAAGATCGAGATTAATGAGCACAACAGAGAGGCTCGATAAGTCTAGTGATAGAATTAAGGAAAGTCGAAGAACCATGCTAGAAAC
AGAAGAACTTGGAGTTTCAATTCTTCAAGATTTACACTCGCAGAGACAGTCTCTCTTGCATGCTCATAATACGCTTCATGGAGTAGATGACAACATAGGGAAGAGTAAGA
GAATTTTAACCAACATGTCAAGAAGGATGAACAAGAACAAATGGATTGTTACATCCATAATCATTGTTCTTGTATTGGCCATCATCCTGATATTGTACTTCAAACTTACC
AAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATGGAAGCGTCGATTCATTTGTCAAAGCAACAAAATTTTTGGTACTTCGTGACGGGGTCCGTGCGCACTCCACCTGCCGTTTATTAATTCTTCCAATTTTCTCGTTCTA
CATAATTCCTCATCCTCTGGCCTTTCCAATCTCTGATCCTATTTGGTTTGGGCACGATGAGTGAGGTGTTCGACGGATATGAACGGCAATACTGCGAGCTTTCGGCGAAT
CTGTCAAGAAAATGCACTTCGGCTAGTGCCCTTAATGGAGAGCAAAAGAAGCAAAAGGTTTCTGAAGTAAAGACAGGAATTGATGAAGCAGAAGCTCTGATTCGGAAAAT
GGATCTTGAGGCCAGAAGTTTGCCGCCTAATGTCAAGGCTGTCCTTCTAGCTAAATTGAGAGAGTACAAATCTGACCTCAACAACTTAAAAAGTGAAGTTAAACGCATTG
AATCTGGAAGCTTAAGTGCAGCCACTAGAGATGAGTTGCTGGAATCAGGAATGGCTGATACATTGACGGCATCAGCTGACCAAAGATCGAGATTAATGAGCACAACAGAG
AGGCTCGATAAGTCTAGTGATAGAATTAAGGAAAGTCGAAGAACCATGCTAGAAACAGAAGAACTTGGAGTTTCAATTCTTCAAGATTTACACTCGCAGAGACAGTCTCT
CTTGCATGCTCATAATACGCTTCATGGAGTAGATGACAACATAGGGAAGAGTAAGAGAATTTTAACCAACATGTCAAGAAGGATGAACAAGAACAAATGGATTGTTACAT
CCATAATCATTGTTCTTGTATTGGCCATCATCCTGATATTGTACTTCAAACTTACCAAATAGTAAGGATATATATATATATATATATCTTTTCTCATTTGGCTTTGTCAT
ATTGTTGTTGAGTGTTGTTGAAACATGAGTTCTTGGTTTATTGTATTTTTCTGGGTCTGTTGTGAGTTTGTACATGGCTTATGTCATGATTAATATATCTTGCCAGCATC
TTTGTCTTAGTTAAGATGGGCAAGTGTTCACAATACAATTTTAATGTTGTATCCTCCATATTTGCTTACTGTGGGATATCCATATATTTGCTTACTTTCACAGCTTCAAT
TGATGATTTACAAAGATGGTTTGAGCTTACATAATTTGTTTTACTTTGATTAAAATGGTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEVFDGYERQYCELSANLSRKCTSASALNGEQKKQKVSEVKTGIDEAEALIRKMDLEARSLPPNVKAVLLAKLREYKSDLNNLKSEVKRIESGSLSAATRDELLESGMA
DTLTASADQRSRLMSTTERLDKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIIVLVLAIILILYFKLT
K