; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G02050 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G02050
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationChr6:1521657..1523192
RNA-Seq ExpressionCSPI06G02050
SyntenyCSPI06G02050
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]2.0e-121100Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]6.2e-115100Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]5.0e-7273.16Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]3.7e-9990.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein3.0e-115100Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein7.2e-10996.07Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein7.2e-10996.07Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein2.4e-7273.16Show/hide
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like6.2e-6878.5Show/hide
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        KE NS  NSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT+SDTSIPPLTPPPSY+SSSHSTSK S KPT  +SIF     RKSRT+ SFS SS SSSSSSS  
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein1.9e-0845.92Show/hide
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        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ SD + P   PLTPPPSYF +S S++K  S P   +++F  L   K+R+ PS  +SS SSSSSS
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AT2G40475.1 unknown protein3.7e-1740.38Show/hide
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        ++ + KE +   +SS   YYGGA  ++PF WE+RPGTPKH  FS++  +PPLTPPPSY+SSS S+ +K S   T+  + F +    +  + PSFS SS S
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        SSSSSS         SSSS PS        K   R     S    Y  +D D +E+V+    +SPTS LC+  G SS          + S+K AL S++ 
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        HGS+ + L
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AT3G56260.2 unknown protein1.3e-0942.46Show/hide
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        YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  SD+S+P PLTPPPSY+SS   ST +  SK     S F       S  S    S+ GS  ++SS  SWSS+ SSSS
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Query:  SSPSPFVRPKFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS
         S SP   P   K  +R S     P  Y+  ++D          +SPTS LC   G        G    + SV  AL S
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AT5G01790.1 unknown protein5.2e-1159.65Show/hide
Query:  SFRV-YYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSD-TSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSK
        SFR+ YY GA GA+PF WES PGTPKH  S+  ++PPLTPPPS+FS S    +  SK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAACTCAAAGCTACGACCAAATCTCTCAAAAATCTTTCCCAATTACCAAACATGAAGATAAATTCTTCACTAGAGCTCTATCCAAAGAGCTCAATTCCACCACCAA
CTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGTGCCACCGGTGCAATTCCGTTCCGATGGGAGTCCCGACCGGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGACACTTCAATCCCTCCTC
TTACTCCTCCTCCTTCTTACTTTTCCTCTTCACATTCTACTTCCAAAGCTTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGGCTTACACCCAGGAAATCTCGA
ACTTCCCCGTCTTTCTCCTCCTCTTCTGGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATTAGCTTCGTGGTCATCCTCTTTCTCATCCTCCTCCTCATCTCCCTCGCCTTTCGTTAG
ACCTAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCGATTCTCGGATATTCCTAGCTTACCATTTGAGTATAGCTTTGACGATAAAGACGGAGACGAGGTGGTGGCCGGGAGTGCTCCGA
ATTCTCCTACTTCAATTTTGTGCTTTGGTGGTGGTTCTTCAAGTAGAGCTTCATTGTTTGGAGGTTGTTACCAGTTAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCCATTGTT
GGCCATGGATCTGCAAGTAGAGGGCTTGAGTCAGGAAGCTACCGTGTGGTTGCAGGAAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAACTCAAAGCTACGACCAAATCTCTCAAAAATCTTTCCCAATTACCAAACATGAAGATAAATTCTTCACTAGAGCTCTATCCAAAGAGCTCAATTCCACCACCAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GHGSASRGLESGSYRVVAGS