; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G02140 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G02140
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL74
Genome locationChr6:1588409..1589083
RNA-Seq ExpressionCSPI06G02140
SyntenyCSPI06G02140
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052006.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis melo var. makuwa]5.8e-9193.96Show/hide
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KAG7016045.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.2e-8586.41Show/hide
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XP_011656436.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis sativus]1.5e-99100Show/hide
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XP_022134542.1 RING-H2 finger protein ATL74 [Momordica charantia]7.4e-8688.04Show/hide
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        IPVAVYGSE+GLEIRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNH FHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS SESAV EAGNR AG
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XP_038885444.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Benincasa hispida]1.6e-8891.3Show/hide
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        IPVAVYGSE+GL+IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS SESA  EAGN  AG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAH2 RING-type domain-containing protein7.4e-100100Show/hide
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A0A5D3BXT6 RING-H2 finger protein ATL722.8e-9193.96Show/hide
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A0A6J1BZW4 RING-H2 finger protein ATL743.6e-8688.04Show/hide
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A0A6J1FF16 RING-H2 finger protein ATL74-like1.2e-8485.87Show/hide
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        M M S+HHRPRP RLLLD +TT  PSNGSRTRNSY NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCA RCSRRF+FETGGGTASRL ATGLKKSALR+
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        +PV VYGSE+GL IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL EQQS SES   +AGNR AG
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A0A6J1JVF4 RING-H2 finger protein ATL74-like4.0e-8586.41Show/hide
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        M M S+HHRPRP RLLLD +TT  PSNGSRTRNSY NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRF+FETGGGTASRL ATGLKKSALR+
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        +PV VYGSE+GL IRETDCPICLGDF+AGEKIK+LPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSL EQQS SES   +AGNR AG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0C034 RING-H2 finger protein ATL102.1e-3047.37Show/hide
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        +E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF++GE+++
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        +LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E
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Q6NQG7 RING-H2 finger protein ATL782.1e-3849.36Show/hide
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        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F+A E++K
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Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQ-QSVSESAVTEAGNRGAGPRIS
        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++  + +++ + T + N    P+ S
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Q9FLC6 RING-H2 finger protein ATL731.1e-4258.39Show/hide
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        T A P     + ++  N A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C 
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Query:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS
        ICLGDF+ GE +++LPKCNHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+
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Q9LZV8 RING-H2 finger protein ATL741.1e-3954.25Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE
        RLLL+       ++GS   + Y  + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   ++
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Query:  IRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        I  T+C ICLG+F  GE++++LP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
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Q9SG96 RING-H2 finger protein ATL721.7e-4558.9Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV
        RLLL+P   AP +   + +    N+  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
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Query:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK+++LPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49220.1 RING/U-box superfamily protein1.5e-3147.37Show/hide
Query:  NEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTAT---GLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK
        +E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF++GE+++
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Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E
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AT1G49230.1 RING/U-box superfamily protein1.5e-3949.36Show/hide
Query:  YNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIK
        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F+A E++K
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Query:  ILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQ-QSVSESAVTEAGNRGAGPRIS
        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++  + +++ + T + N    P+ S
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AT3G10910.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-4658.9Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV
        RLLL+P   AP +   + +    N+  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
Subjt:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV

Query:  YGSETGLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK+++LPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
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AT5G01880.1 RING/U-box superfamily protein7.7e-4154.25Show/hide
Query:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE
        RLLL+       ++GS   + Y  + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   ++
Subjt:  RLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLE

Query:  IRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        I  T+C ICLG+F  GE++++LP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
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AT5G05280.1 RING/U-box superfamily protein7.5e-4458.39Show/hide
Query:  TTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSETGLEIRETDCP
        T A P     + ++  N A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C 
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Query:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS
        ICLGDF+ GE +++LPKCNHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+
Subjt:  ICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCGCGTCCCCCTCGCCTCCTCCTCGACCCCGACACGACGGCACCACCGTCAAATGGAAGCAGAACGCGAAATTCATATAACAA
TGAAGCCAATTTCGATACAAACATGGTGATAATTCTTGCCGCGTTACTCTGCGCACTGATTTGCGCTCTAGGATTGAACTCAATCGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GACGGTTCGCCTTCGAAACAGGCGGCGGCACAGCCTCGCGTCTCACCGCTACAGGGCTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATCCCGGTCGCCGTGTATGGGTCGGAAACA
GGCCTAGAGATCCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTAGGAGATTTCATGGCCGGCGAGAAAATAAAAATACTCCCGAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCATCATGTCCGACATGTCGTCAATCACTGCTGGAACAACAATCCGTTTCGGAATCGGCGGTAACCGAGGCGGGGAATCGAGGCGCCG
GACCACGGATTTCACGTTCGATGTATCGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCATCATGTCCGACATGTCGTCAATCACTGCTGGAACAACAATCCGTTTCGGAATCGGCGGT
AACCGAGGCGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCGCGTCCCCCTCGCCTCCTCCTCGACCCCGACACGACGGCACCACCGTCAAATGGAAGCAGAACGCGAAATTCATATAACAA
TGAAGCCAATTTCGATACAAACATGGTGATAATTCTTGCCGCGTTACTCTGCGCACTGATTTGCGCTCTAGGATTGAACTCAATCGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GACGGTTCGCCTTCGAAACAGGCGGCGGCACAGCCTCGCGTCTCACCGCTACAGGGCTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATCCCGGTCGCCGTGTATGGGTCGGAAACA
GGCCTAGAGATCCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTAGGAGATTTCATGGCCGGCGAGAAAATAAAAATACTCCCGAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCATCATGTCCGACATGTCGTCAATCACTGCTGGAACAACAATCCGTTTCGGAATCGGCGGTAACCGAGGCGGGGAATCGAGGCGCCG
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AACCGAGGCGGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRMESNHHRPRPPRLLLDPDTTAPPSNGSRTRNSYNNEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSET
GLEIRETDCPICLGDFMAGEKIKILPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSVSESAVTEAGNRGAGPRISRSMYRYLVSFPLIMSDMSSITAGTTIRFGIGG
NRGG