; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G03100 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G03100
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTransmembrane protein, putative
Genome locationChr6:2604582..2607216
RNA-Seq ExpressionCSPI06G03100
SyntenyCSPI06G03100
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049627.1 putative transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-18294.43Show/hide
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KAG6601797.1 hypothetical protein SDJN03_07030, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.8e-15380.06Show/hide
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XP_004150537.1 uncharacterized protein LOC101210554 [Cucumis sativus]1.4e-19299.71Show/hide
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XP_022953398.1 uncharacterized protein LOC111455963 [Cucurbita moschata]9.6e-15480.35Show/hide
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XP_038885654.1 uncharacterized protein LOC120075963 isoform X1 [Benincasa hispida]3.4e-16787.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KC53 Uncharacterized protein6.7e-19399.71Show/hide
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A0A5D3CZV8 Putative transmembrane protein8.2e-18394.43Show/hide
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A0A6J1CDR4 uncharacterized protein LOC1110103161.6e-14979.88Show/hide
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        AEAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSL+GLSLNFF +LPA+NSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFVIAWTLMFAPLLFTDRKRD+Y GSLD+LWG Q
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        PWLIGENLQN+KESK+G+VSSLRF+PVVGLIAYLLFLKLDE+L
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A0A6J1GN87 uncharacterized protein LOC1114559634.7e-15480.35Show/hide
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        M   +IA+QPLL N+SF +IKPY  +    PF+F  PQQP+LS  I T T     P RRN S   PAARRKPT VDS  FS++G+S+VRR+LQ+LLW AE
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        LTNTFLIPYMAIRLNE S+DSAP+PQSKLG+LMT  APVVG+IGGA CIISIIWSFVGR +GNFGG+AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLY+VFQPW
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        LIGENLQN+KESK+G+VSSLRFVPVVGLIAYLLF+KLDEEL
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A0A6J1I448 uncharacterized protein LOC1114704513.0e-15380.06Show/hide
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        M  A+IA+QPLL N+SF +IKPY  +     F+F RPQQP+LS    T T     P RRN S   PAARRKPT VDS  F+++G+S+VRR+LQ+LLW AE
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Query:  AVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLPAMNSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFVIAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGFQMF
         VY+LWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSL+GLSLNFF +LPA+NSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFVIAWTLMFAPLLFTDR+RD+Y+GSLDLLWGFQMF
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        LTNTFLIPYMAIRLNEAS DSAP+PQSKLG+LMT  APVVG+IGGA CIISIIWSFVGR +GNFGG+AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLY+VFQPW
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Query:  LIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEEL
        LIGENLQN+KESK+G+VSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEEL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G25805.1 unknown protein1.3e-11168.86Show/hide
Query:  ARRKPTFVDSTDFSNDGDSNVRRLLQVLLWGAEAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLPAMNSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFV
        ARRKP     T      D ++RR+++ LLW +EAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLP  N+ GI  + APVLHPM+EGLFNFV
Subjt:  ARRKPTFVDSTDFSNDGDSNVRRLLQVLLWGAEAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSLLGLSLNFFFVLPAMNSVGIRLIDAPVLHPMSEGLFNFV

Query:  IAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGFQMFLTNTFLIPYMAIRLNEASEDSAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAMCIISIIWSFVGRVDGNFGGV
        IAWTLMFAPLL+TDRKR++Y  SLD+LW   MFLTNTFLIPYMA+RLN+A  D  P  +S+LG +MT GAP+VG+ G  +C+IS +WS  GR DG+FGG+
Subjt:  IAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGFQMFLTNTFLIPYMAIRLNEASEDSAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAMCIISIIWSFVGRVDGNFGGV

Query:  AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEE
         +RW++LI YL SERLAYAFIWDICLY++FQPWLIGENLQNVK++KI +V  LRFVPV GL+AY LFL L++E
Subjt:  AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGENLQNVKESKIGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAGGCCATGATAGCATCTCAACCTTTACTCTCCAACCACTCCTTTCCGGTGATTAAACCCTACACTCTAACTTCCCCCCTCTCTCCTTTCCGTTTCTTCAGACC
ACAACAACCACTGCTCTCTCCTCTAATCTCCACCACCACTCCCTTCTCACTCTCACCCAATCGCCGGAATTGTTCTCTTACCCGCCCTGCCGCTCGCAGGAAACCCACAT
TCGTTGATTCTACAGACTTTTCCAACGACGGTGATTCCAATGTCCGACGGTTGCTTCAAGTTCTGCTCTGGGGTGCTGAGGCTGTTTACATTTTGTGGCTATTTCTCCTT
CCTTATGCTCCGGGAGATCCTGTGTGGGCAATCAGTTCAGAAACTGTGAATTCTCTTCTGGGTCTTTCTCTGAATTTCTTCTTTGTATTGCCTGCTATGAACTCTGTGGG
CATTCGTTTGATTGATGCTCCTGTTCTTCACCCAATGTCTGAGGGATTGTTCAATTTTGTTATCGCATGGACGCTCATGTTTGCTCCCCTGCTGTTCACGGATCGAAAGA
GGGACCAATACAGTGGTTCATTAGACTTATTGTGGGGCTTTCAGATGTTCCTTACGAACACCTTTTTGATACCTTATATGGCTATCCGGCTTAATGAGGCTAGTGAAGAC
TCTGCCCCGCAACCGCAGTCGAAGCTGGGCACTTTGATGACCAATGGAGCTCCTGTCGTTGGCGTGATCGGTGGTGCAATGTGCATCATATCGATAATATGGTCGTTCGT
TGGTCGAGTGGATGGTAACTTTGGAGGTGTAGCAGAGAGATGGGAGTTCTTGATCCAATATCTATCTTCAGAGAGGTTAGCTTATGCTTTTATTTGGGATATTTGCCTTT
ACAGTGTATTCCAGCCTTGGTTGATTGGAGAAAACCTTCAAAATGTTAAGGAGAGCAAGATTGGAGTTGTAAGTTCCCTTAGATTTGTCCCTGTGGTTGGCTTAATTGCC
TATCTTCTTTTTCTCAAACTTGATGAGGAATTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGAAGGCCTCCTCCCTACATAAACAAAGCCTCGGGATTCCAAATCCAAATTTGCAGCCATAACTTTGCCACGCACAGTTATTTGGAGAGAAAAATGGCGAAGGCCATGA
TAGCATCTCAACCTTTACTCTCCAACCACTCCTTTCCGGTGATTAAACCCTACACTCTAACTTCCCCCCTCTCTCCTTTCCGTTTCTTCAGACCACAACAACCACTGCTC
TCTCCTCTAATCTCCACCACCACTCCCTTCTCACTCTCACCCAATCGCCGGAATTGTTCTCTTACCCGCCCTGCCGCTCGCAGGAAACCCACATTCGTTGATTCTACAGA
CTTTTCCAACGACGGTGATTCCAATGTCCGACGGTTGCTTCAAGTTCTGCTCTGGGGTGCTGAGGCTGTTTACATTTTGTGGCTATTTCTCCTTCCTTATGCTCCGGGAG
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GCTCCTGTTCTTCACCCAATGTCTGAGGGATTGTTCAATTTTGTTATCGCATGGACGCTCATGTTTGCTCCCCTGCTGTTCACGGATCGAAAGAGGGACCAATACAGTGG
TTCATTAGACTTATTGTGGGGCTTTCAGATGTTCCTTACGAACACCTTTTTGATACCTTATATGGCTATCCGGCTTAATGAGGCTAGTGAAGACTCTGCCCCGCAACCGC
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AACTTGATGAGGAATTATAATTTCTGCTTGCATGTAACAACAACTAAAAATTAGATAAATATGGGTTATTTGTTAAAAGACAATTTAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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