; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G03630 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G03630
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic
Genome locationChr6:3308408..3309590
RNA-Seq ExpressionCSPI06G03630
SyntenyCSPI06G03630
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140886.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis sativus]1.0e-13499.62Show/hide
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XP_008445737.1 PREDICTED: tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis melo]7.2e-12594.21Show/hide
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XP_022992337.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]9.1e-10477.86Show/hide
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XP_023547651.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.1e-10479.01Show/hide
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XP_038884158.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Benincasa hispida]2.6e-11988.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein4.8e-13599.62Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic3.5e-12594.21Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein3.5e-12594.21Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like5.7e-10479.15Show/hide
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like4.4e-10477.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf531.2e-2135.21Show/hide
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Query:  QYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNH
           +  +P EF+W +  + P GHLPL N LRG  ++  I ++
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P51202 Uncharacterized protein ycf532.0e-2137.09Show/hide
Query:  TSSAISFDELDRLLGAKDFRQADEETRRLLIALAGEGALKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKK
        ++  + + +L  LL   +   AD+ T++ LI LAG     R ++YF++++ I  EDL+ ID LW  HS GKFG+ VQ++I+  + K++ + + K+GW   
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           EI +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG +++S + +H A+
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P72583 Ycf53-like protein1.8e-2540.99Show/hide
Query:  GSFSLSSDTSSAISFDELDRLLGAKDFRQADEETRRLLIALAGEGALKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLF
        G F L S  +  I +  L   LG++DF  ADE TR  L  LAG GA +R ++YF+EV+   A DL  I+ LW  HS+G FG+SVQ+R++    K+FTKL+
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Query:  MKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNHPAFGE
         K+GW            +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG R+  ++  HP + +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf537.4e-2439.07Show/hide
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        ++  +++ +L  LL  +D  +AD+ T++ LI LAG  A  R ++YF++++ I A+DL+ ID LW  HS GKFG  VQ++I+  V KD+ K + K+GW   
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Query:  LDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPLTNALRGTRLMSNILNHPAF
           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG +++S +  H A+
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic7.3e-5649.43Show/hide
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        HS PS  H     HR NL   S    ++L LK  +S A  +   +A+++S S  A  + S ++ ++    +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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        ++GE A+KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL ++TP GHLPL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding5.2e-5749.43Show/hide
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        HS PS  H     HR NL   S    ++L LK  +S A  +   +A+++S S  A  + S ++ ++    +A  FD L+  L  ++FRQADEETRRLLI 
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Query:  LAGEGALKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEDTPEGHLPL
        ++GE A+KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL ++TP GHLPL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAACTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCACTCTCTCCGCCATCCTCACCGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACC
AACTTCCTCCACCGCTGTCACCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCT
CTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGGCGCCAAAGACTTTCGGCAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTCGCCGGCGAAGGCGCCCTGAAAAGAGGG
TACGTCTATTTCTCCGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATCTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACG
GATTTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGTTGGATGAAGAAGCTGGATACGGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCGACGG
AGTTTATTTGGGAGCTGACGGAGGACACGCCTGAAGGGCATCTGCCATTAACTAATGCTTTGAGAGGGACACGGCTAATGAGCAATATTTTGAACCATCCGGCATTTGGG
GAGGAGGCCATTGAAGAGAAAGGTGAAGAAAAAATTGCAGGGGTGGTTGAAAATGGAGGATTGAAGAAAGGATTGAAATCGATCACTGAGAGGCTTTTCAAAAGAGATTA
TAGCTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCAATCAAAAGCCTCACTTGAATCCTTTTCGATGAGAAACTCTGTTTCCCTTTCACTTCCACTCGTTCCTTATCTCTCAATCAAAATTCACTCAAAACCCCAAAACCT
CTCTTTTTCACATTTTCAATTTTCATTCACTCTCCCTCTCCCTCTCCCCCATGGCAACTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCACTCTCTCCGCCATCCTCACCGCCCT
AACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACCAACTTCCTCCACCGCTGTCACCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGC
CGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGGCGCCAAAGACTTTCGGCAAGCCGACGAGGAGA
CCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTCGCCGGCGAAGGCGCCCTGAAAAGAGGGTACGTCTATTTCTCCGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGAT
CTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACGGATTTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGTTGGATGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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