CuGenDBv2

Gene ID	CSPI06G04140
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	Chr6:3824019..3832400
RNA-Seq Expression	CSPI06G04140
Synteny	CSPI06G04140
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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XP_008456625.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo]

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XP_011656578.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus]

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XP_038884353.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida]

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        E Q KV +SLV+VSKP NTE ITVDK +ASIEAKP  VS MNKINDQGKSDVP TTEKSPIFSFPT SSPSITANV G ES++RPEK+AS E+PKAAT P
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        IFGFGEK PSQKEA S  PTFAF +K TT TNEQN I VVTSE NV+PTQQAS PTTFKFGDKA+FPIPANAATENGNK+ GS   FASPLVNEKEGA  
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Query:  GGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFS
        GGSASVFKAE+SSS    SIPSFGVPKES+SEKAGDKSSS G   GTSG+LFSSSVSTS STPT  LFSFS+PSTNSNLNNGSLVSTTPS  PTPATTFS
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        NN+T+QNSS+KPSF+AA SNSEPV++TS PTSS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPS VGS+E+KTK ETTFGNLSG P SD SAVKV+STG+S
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        VFQFGAAST SD+NK PANSTF  +N+P FGA  S  SSGLA STQSTP LQF+SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASN F SG TFGLASSSSS 
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Query:  NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN
        NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFGLSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+ + SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA N
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        N+QA+MEDSMAEDT+QT  SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQF GSQQN+P    NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
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        K+VKVKSKSRKK
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XP_038884354.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida]

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        IFGFGEK PSQKEA S  PTFAF +K TT TNEQN I VVTSE NV+PTQQAS PTTFKFGDKA+FPIPANAATENGNK+ GS   FASPLVNEKEGA  
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Query:  GGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVT
        GGSASVFKAE+SSSSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSS G   GTSG+LFSSSVSTS STPT  LFSFS+PSTNSNLNNGSLVSTTPS  PTPATTFSNN+T
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        +QNSS+KPSF+AA SNSEPV++TS PTSS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPS VGS+E+KTK ETTFGNLSG P SD SAVKV+STG+SVFQF
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Query:  GAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSV
        GAAST SD+NK PANSTF  +N+P FGA  S  SSGLA STQSTP LQF+SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASN F SG TFGLASSSSS NNSV
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Query:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA
        SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFGLSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+ + SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
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        +MEDSMAEDT+QT  SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQF GSQQN+P    NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VK
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Query:  VKSKSRKK
        VKSKSRKK
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XP_038884355.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida]

0.0e+00

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Query:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
        ADP  TQEGTN+ FVPSINSNNT G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV S+G QEG PK P QSQDGVSPHM +
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        THV    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA            GNP KS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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Query:  PSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPF
        PSIKNS+AT DAYR+ TSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRRNSVLDD+MGSVGPIRR R KSNHLF   L LPSSSTSI  SGIGSET++HLQSTKVHPF
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        SS GGK LYS+E +RN SKM+AES+N M PSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
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Query:  ENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF
        ENVEGIRSNDA DLTS+KNDKFEESSP KF VPNDKSISTG+GVGSSV  K+  SGSG QVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Subjt:  ENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF

Query:  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAP
        E Q KV +SLV+VSKP NTE ITVDK +ASIEAKP  VS MNKINDQGKSDVP TTEKSPIFSFPT SSPSITANV G ES++RPEK+AS E+PKAAT P
Subjt:  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAP

Query:  IFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANV
        IFGFGEK PSQKEA S  PTFAF +K TT TNEQN I VVTSE NV+PTQQAS PTTFKFGDKA+FPIPANAATENGNK+ GS   FASPLVNEKEGA  
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Query:  GGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFS
        GGSASVFKAE+SSS    SIPSFGVPKES+SEKAGDKSSS G   GTSG+LFSSSVSTS STPT  LFSFS+PSTNSNLNNGSLVSTTPS  PTPATTFS
Subjt:  GGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFS

Query:  NNVTSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNS
        NN+T+QNSS+KPSF+AA SNSEPV++TS PTSS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPS VGS+E+KTK ETTFGNLSG P SD SAVKV+STG+S
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Query:  VFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA
        VFQFGAAST SD+NK PANSTF  +N+P FGA  S  SSGLA STQSTP LQF+SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASN F SG TFGLASSSSS 
Subjt:  VFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA

Query:  NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN
        NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFGLSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+ + SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA N
Subjt:  NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN

Query:  NEQASMEDSMAEDTIQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLP---QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
        N+QA+MEDSMAEDT+QT  SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQF GSQQN+P    NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
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Query:  KYVKVKSKSRKK
        K+VKVKSKSRKK
Subjt:  KYVKVKSKSRKK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K9E4 Uncharacterized protein

0.0e+00

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Query:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
        ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
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Query:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA
        THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA
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Query:  YRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE
        YRSTT SSSQSAWEQG LLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE
Subjt:  YRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE

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        IQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAR
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Query:  DLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS
        DLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS
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Query:  VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK
        VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK
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        EAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
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        SSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSG  FSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA
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        TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGP
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Query:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW
        ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA+NSVSSSAGTSSSFFNW
Subjt:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW

Query:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT
        QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT
Subjt:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT

Query:  ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
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A0A1S3C4Z3 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

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Query:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
        ADPSGTQEGTN+GFVPSINS+NTQGLSDLEKIL EKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHG+QEGSPK PTQSQDGVSPHMA 
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Query:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA
        THVV ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIAT DA
Subjt:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA

Query:  YRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE
        YR+TTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLF T L LPSSSTSI ASGI SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYS+E
Subjt:  YRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE

Query:  IQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAR
         QRNFSK +AESKNAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDA 
Subjt:  IQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAR

Query:  DLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS
        D TSQKNDKFEESSPSK NVPNDKSIST DGVGSSV TKD GSGSGMQVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEM+ KVDDSLVS
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Query:  VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK
        VSKPKNTE ITV KSK SIEAKP VVSVMNKINDQGKSDVP+TTEKSPIFSFPT SSPS TANVKG ESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK
Subjt:  VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK

Query:  EAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
        E  S PPTFAFGSKATTTNEQN I VVTSEAN EPT+ AS PTTFKFGDKASF IPANAATENGNKSAGSLFKF SPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
Subjt:  EAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS

Query:  SSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA
        SSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSSPGLIFGTSG LFSSS STSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVS TPSTLPTPATTFSNNVTSQNSS+KPS  AA
Subjt:  SSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA

Query:  TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGP
        TSNSEPV+STSPP SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPS VGSVE KTKPETTFGNLSG P SDT+AVKVASTG+SVFQFGAASTTSDANKGP
Subjt:  TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGP

Query:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW
        ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLA STQSTPALQF SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW
Subjt:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW

Query:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT
        QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA  ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDT+QT
Subjt:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT

Query:  ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Subjt:  ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK

A0A5A7SNY9 Nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

93.49

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Query:  MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVA
        MATERE+VQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLS LVDPA KLI S+AH LFSTVFRKRLPPPPPSF LSREAN+EMEHRNQEEVA
Subjt:  MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVA

Query:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
        ADPSGTQEGTN+GFVPSINS+NTQGLSDLEKIL EKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHG+QEGSPK PTQSQDGVSPHMA 
Subjt:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT

Query:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA
        THVV ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIAT DA
Subjt:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA

Query:  YRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE
        YR+TTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLF T L LPSSSTSI ASGI SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYS+E
Subjt:  YRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNE

Query:  IQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAR
         QRNFSK +AESKNAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDA 
Subjt:  IQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAR

Query:  DLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS
        D TSQKNDKFEESSPSK NVPNDKSIST DGVGSSV TKD GSGSGMQVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEM+ KVDDSLVS
Subjt:  DLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS

Query:  VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK
        VSKPKNTE ITV KSK SIEAKP VVSVMNKINDQGKSDVP+TTEKSPIFSFPT SSPS TANVKG ESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK
Subjt:  VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQK

Query:  EAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
        E  S PPTFAFGSKATTTNEQN I VVTSEAN EPT+ AS PTTFKFGDKASF IPANAATENGNKSAGSLFKF SPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
Subjt:  EAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS

Query:  SSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA
        SSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSSPGLIFGTSG LFSSS STSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVS TPSTLPTPATTFSNNVTSQNSS+KPS  AA
Subjt:  SSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA

Query:  TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGP
        TSNSEPV+STSPP SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPS VGSVE KTKPETTFGNLSG P SDT+AVKVASTG+SVFQFGAASTTSDANKGP
Subjt:  TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGP

Query:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW
        ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLA STQSTPALQF SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW
Subjt:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW

Query:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT
        QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA  ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDT+QT
Subjt:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT

Query:  ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
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A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

77.36

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Query:  MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGWLS LVDPA KLI S+AH LFS+VFRKRLPPPPPS P+SREANDEME +NQEEVA
Subjt:  MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVA

Query:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
        ADP GTQEGTN  FVPSINSNN  G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ IQEGSPK P  +Q+GV PHM  
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Query:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV+ ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM             GNP KSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Subjt:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT

Query:  PSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPF
        PSIKNS+AT D+YR+T +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R KSN LF   L LPSSSTSI  SGIGSET++HLQSTKVHPF
Subjt:  PSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPF

Query:  SSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
        SS  GK  YS+E +RN SKM+AES+N  TPSSSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
Subjt:  SSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL

Query:  ENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF
        ENVE IRSND RDLTS+K DKFE+SS  K  VP+DKSISTG GVGSSV +KD  S SG+QVSFVGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E +SNGPV+ KSF
Subjt:  ENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF

Query:  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAP
        E + KVDDSLV+V KP +TE ITVDK +ASI+AKP  VS M KINDQ KSDVP TTEKS IFSFPTAS  S TANV   ES+ RPEK+AS E+PKAA AP
Subjt:  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAP

Query:  IFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANV
        IFGFGEK PSQK+     PTF FG+K TT TNEQN +  VTSE NV PT QAS PTTFKFGDKA+FPIPA+ ATENGN  AGS FKFAS LVNEKEGA  
Subjt:  IFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANV

Query:  GGSASVFKAENSSSSIP----SFGVPKESISEKAGD-KSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTF
         GSASVFK+E+SSSS      SFGVPKES+SEKAGD KSSS GL  GTSG L  SSVS   STPTPSLFSFS+P+TNSNL NGSL  +TPST P+P+ TF
Subjt:  GGSASVFKAENSSSSIP----SFGVPKESISEKAGD-KSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTF

Query:  SNNVTSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETT-FGNLSGFPASDTSAVKVASTG
         +N+T+QNSS+KPS +AATSNSEPV++TS  TSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPS VGSVETKTK ETT FGN+SG   SDTSA KV STG
Subjt:  SNNVTSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETT-FGNLSGFPASDTSAVKVASTG

Query:  NSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS
        +SVFQFGAASTTSD+NK P  STFA  ++P+FGAPV  +SSG+A STQSTP   FSSSSTSFGLT NTGLASG+SL GSSAPASN FTSGATFG   SSS
Subjt:  NSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS

Query:  SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPS-ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPP
        SANNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL+SSS+AS+S+PM+FGSS+TGA S  SMFSFTSAA+A  SQPAFG SN+ FTFGSTPP
Subjt:  SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPS-ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPP

Query:  ANNNEQASMEDSMAEDTIQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNL--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGD
        A NN+ A+MEDSMAEDT+QT    +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+  PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGD
Subjt:  ANNNEQASMEDSMAEDTIQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNL--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGD

Query:  KSNRKYVKVKSKSRKK
        KSNRK+VKVKSKSRKK
Subjt:  KSNRKYVKVKSKSRKK

A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

77.59

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Query:  MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGWLS LVDPA KLI S+AH LFS+VFRKRLPPPPPS P+SREANDEME +NQEEVA
Subjt:  MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVA

Query:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT
        ADP GTQEGTN  FVPSINSNN  G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ IQEGSPK P  +Q+GV PHM  
Subjt:  ADPSGTQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQDGVSPHMAT

Query:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV+ ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM             GNP KSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Subjt:  THVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT

Query:  PSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPF
        PSIKNS+AT D+YR+T +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R KSN LF   L LPSSSTSI  SGIGSET++HLQSTKVHPF
Subjt:  PSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPF

Query:  SSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
        SS  GK  YS+E +RN SKM+AES+N  TPSSSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL
Subjt:  SSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL

Query:  ENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF
        ENVE IRSND RDLTS+K DKFE+SS  K  VP+DKSISTG GVGSSV +KD  S SG+QVSFVGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E +SNGPV+ KSF
Subjt:  ENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF

Query:  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAP
        E + KVDDSLV+V KP +TE ITVDK +ASI+AKP  VS M KINDQ KSDVP TTEKS IFSFPTAS  S TANV   ES+ RPEK+AS E+PKAA AP
Subjt:  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAP

Query:  IFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANV
        IFGFGEK PSQK+     PTF FG+K TT TNEQN +  VTSE NV PT QAS PTTFKFGDKA+FPIPA+ ATENGN  AGS FKFAS LVNEKEGA  
Subjt:  IFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANV

Query:  GGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGD-KSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNV
         GSASVFK+E+SSSS  SFGVPKES+SEKAGD KSSS GL  GTSG L  SSVS   STPTPSLFSFS+P+TNSNL NGSL  +TPST P+P+ TF +N+
Subjt:  GGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGD-KSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNV

Query:  TSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETT-FGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVF
        T+QNSS+KPS +AATSNSEPV++TS  TSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPS VGSVETKTK ETT FGN+SG   SDTSA KV STG+SVF
Subjt:  TSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETT-FGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVF

Query:  QFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANN
        QFGAASTTSD+NK P  STFA  ++P+FGAPV  +SSG+A STQSTP   FSSSSTSFGLT NTGLASG+SL GSSAPASN FTSGATFG   SSSSANN
Subjt:  QFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANN

Query:  SVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPS-ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNN
        SVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL+SSS+AS+S+PM+FGSS+TGA S  SMFSFTSAA+A  SQPAFG SN+ FTFGSTPPA NN
Subjt:  SVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPS-ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNN

Query:  EQASMEDSMAEDTIQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNL--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
        + A+MEDSMAEDT+QT    +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+  PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
Subjt:  EQASMEDSMAEDTIQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNL--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR

Query:  KYVKVKSKSRKK
        K+VKVKSKSRKK
Subjt:  KYVKVKSKSRKK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q555D2 Nuclear pore complex protein DDB_G0274915

8.5e-04

26.26

Show/hide

Query:  MDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKP------FVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKG
        + ++G ++   +D+    + K      S S   +  +I     K  I+ KP         S+       G    PSTT    +FS     S + T+++ G
Subjt:  MDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKP------FVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSITANVKG

Query:  TESSLRPEKVASPELPKAA-TAPIFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGN
          +      +AS     A  T  +FG    S S   + S   T +  + + +    ++    TS +    T  A+ P++  FG   +     +      +
Subjt:  TESSLRPEKVASPELPKAA-TAPIFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGN

Query:  KSAGSLFK--FASPLVNEKEGANVGGSASVFKAEN---------------SSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTP
         S+G LF    ASP       ++ G   S  + E+               S+S   S   P  S S  +   + S GL   +S T  S+ +  S +TP+ 
Subjt:  KSAGSLFK--FASPLVNEKEGANVGGSASVFKAEN---------------SSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTLFSSSVSTSTSTPTP

Query:  SLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAATS-------NSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA
         LF  S+ S++S++++    S+T ST  TP+T    + T        + +AAT+        S P S+TS  T+ P   F          S+ PST+   
Subjt:  SLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAATS-------NSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA

Query:  LSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDA-NKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSS
         S P+   ++ T T    + G    F +S + A    STG  +F   ++STT+ A + G   ST        FG+  S  S+GL  S+ S+ +   SSSS
Subjt:  LSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDA-NKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSS

Query:  TSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF----SSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPM
        T+   T+ TG      LFGS+AP++         GL  S+++ N S      T+++      S+T + STG     SSTPS    FG SSS+++S + P 
Subjt:  TSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF----SSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPM

Query:  VFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGN---SNNAFTFGSTPPAN-------NNEQASMEDSMAEDTIQTASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTA
             S    ++S FS  ++++  TS P   N   +++  T  STP +N       +N  +S     A  T   A+  PSFG  P   P        ST+
Subjt:  VFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGN---SNNAFTFGSTPPAN-------NNEQASMEDSMAEDTIQTASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTA

Query:  PSPLGANPFQFSGSQQNLP------QNPSPF---QASGSLDFNASAGGSFSLGA
         +P GA+PF    S  + P       + +PF   Q S S   N   G S S  A
Subjt:  PSPLGANPFQFSGSQQNLP------QNPSPF---QASGSLDFNASAGGSFSLGA

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

1.4e-107

35.42

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRL---------PPPPPSFPLSREANDEMEHRNQ
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+          GWLS LVDPA +LI  +A  LF ++ RKRL         P      P  R  N E +  ++
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Query:  EEVA--ADPSG--TQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQD
        E+V+  +  +G    E TN    P        G +DLEKIL  KTF+R E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E      V  H       +  T   +
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Query:  GVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LSMAGN--------------PLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYS
        G    + +T   +   LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L + G               P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRGRSA+YS
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Query:  MARVPYSRVRATPSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQG---ALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIG
        MAR PYSR +++  I            +   +S S WE+    GS+QG    LKRR+SVLD+D+GSVGP+RR RQKSN L S SL LP S + +     G
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Query:  SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHG
         E   H                          SK +AE      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD            KL+S R  SP KLSPSML G
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Query:  PALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAG-SGSGMQVSFVGPSIQ---TKCAFQMSAHED
        PAL+SL++V++ K+L N+   ++N + D + QK +   ES   +    ++K+    DG   + S+KD    G G+ +       +    K +F+MSAHED
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Query:  FVDMDEE-GFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFP--------TASSPS-
        F+++D++ G ++ P   +  E Q   +     +S P   + +T        EA P    + N    QG S+    TE++   +FP         AS P+ 
Subjt:  FVDMDEE-GFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFP--------TASSPS-

Query:  --ITANVKGTESSLRP---EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSP---SQKEAGS------HPPTFAFG-SKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPP
          I    K + SS +P   EK    E PK  AA  P   F   +    +Q    S         + AFG S+A     ++      S +  E +  A+P 
Subjt:  --ITANVKGTESSLRP---EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSP---SQKEAGS------HPPTFAFG-SKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPP

Query:  ---TTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGV-----PKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTL
           + F  G  A  P P+N +  +      S+    S + ++    ++  +   F A ++SSSI  FG         S S  A   SS+    FG     
Subjt:  ---TTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGV-----PKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTL

Query:  FSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPT-SSPMPSFSAAPIFKFGSSS
        FS+   + +S       S  T   N+   N S            +T       S  +  +P F   +S+    S+ +P T ++  P  S + IF   SSS
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Query:  VPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLS-GFPASDTSAV--KVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQS
         P T    +SA     S  T T   + FG  S  F +S +S V    ASTG+SVF F A S+ S      ++ + A N   A  A    + SG   STQS
Subjt:  VPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLS-GFPASDTSAV--KVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQS

Query:  TPALQFSS--SSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGFSFG
         P  QF S  S+ SFGL+ N+ LAS SS FG S      FTS +T  L+S++SSA++S + S+   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTP+  FSFG
Subjt:  TPALQFSS--SSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGFSFG

Query:  LSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSAS-MFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTIQ---TASPMP
         SS+++ S++   +FG+S+   PS S +F F S    T  QP FGNS   +   FG++ P             NNN+Q SMEDSMAEDT Q    +   P
Subjt:  LSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSAS-MFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTIQ---TASPMP

Query:  SFGQQPLT-PPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGS-QQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
         FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQF G    +  QN SPFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  SFGQQPLT-PPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGS-QQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

1.0e-108

35.42

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRL---------PPPPPSFPLSREANDEMEHRNQ
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+          GWLS LVDPA +LI  +A  LF ++ RKRL         P      P  R  N E +  ++
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Query:  EEVA--ADPSG--TQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQD
        E+V+  +  +G    E TN    P        G +DLEKIL  KTF+R E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E      V  H       +  T   +
Subjt:  EEVA--ADPSG--TQEGTNIGFVPSINSNNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQEGSPKLPTQSQD

Query:  GVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LSMAGN--------------PLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYS
        G    + +T   +   LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L + G               P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRGRSA+YS
Subjt:  GVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LSMAGN--------------PLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYS

Query:  MARVPYSRVRATPSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQG---ALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIG
        MAR PYSR +++  I            +   +S S WE+    GS+QG    LKRR+SVLD+D+GSVGP+RR RQKSN L S SL LP S + +     G
Subjt:  MARVPYSRVRATPSIKNSIATADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQG---ALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIG

Query:  SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHG
         E   H                          SK +AE      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD            KL+S R  SP KLSPSML G
Subjt:  SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHG

Query:  PALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAG-SGSGMQVSFVGPSIQ---TKCAFQMSAHED
        PAL+SL++V++ K+L N+   ++N + D + QK +   ES   +    ++K+    DG   + S+KD    G G+ +       +    K +F+MSAHED
Subjt:  PALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKDAG-SGSGMQVSFVGPSIQ---TKCAFQMSAHED

Query:  FVDMDEE-GFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFP--------TASSPS-
        F+++D++ G ++ P   +  E Q   +     +S P   + +T        EA P    + N    QG S+    TE++   +FP         AS P+ 
Subjt:  FVDMDEE-GFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFP--------TASSPS-

Query:  --ITANVKGTESSLRP---EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSP---SQKEAGS------HPPTFAFG-SKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPP
          I    K + SS +P   EK    E PK  AA  P   F   +    +Q    S         + AFG S+A     ++      S +  E +  A+P 
Subjt:  --ITANVKGTESSLRP---EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSP---SQKEAGS------HPPTFAFG-SKATTTNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPP

Query:  ---TTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGV-----PKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTL
           + F  G  A  P P+N +  +      S+    S + ++    ++  +   F A ++SSSI  FG         S S  A   SS+    FG     
Subjt:  ---TTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGV-----PKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGTL

Query:  FSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPT-SSPMPSFSAAPIFKFGSSS
        FS+   + +S       S  T   N+   N S            +T       S  +  +P F   +S+    S+ +P T ++  P  S + IF   SSS
Subjt:  FSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPT-SSPMPSFSAAPIFKFGSSS

Query:  VPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLS-GFPASDTSAV--KVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQS
         P T    +SA     S  T T   + FG  S  F +S +S V    ASTG+SVF F A S+ S      ++ + A N   A  A    + SG   STQS
Subjt:  VPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLS-GFPASDTSAV--KVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQS

Query:  TPALQFSS--SSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGFSFG
         P  QF S  S+ SFGL+ N+ LAS SS FG S      FTS +T  L+S++SSA++S + S+   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTP+  FSFG
Subjt:  TPALQFSS--SSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGFSFG

Query:  LSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSAS-MFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTIQ---TASPMP
         SS+++ S++   +FG+S+   PS S +F F S    T  QP FGNS   +   FG++ P             NNN+Q SMEDSMAEDT Q    +   P
Subjt:  LSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSAS-MFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTIQ---TASPMP

Query:  SFGQQPLT-PPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGS-QQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
         FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQF G    +  QN SPFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  SFGQQPLT-PPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGS-QQNLPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK

AT5G20200.1 nucleoporin-related

1.1e-14

24.46

Show/hide

Query:  GGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEE-------------
        GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S +VDPA+++I+  A  +    F      P  + P   +   + E +N  +             
Subjt:  GGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINSTAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEE-------------

Query:  -----VAADPSGTQEGTNIGFVPSINS------NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ-EGSPKL
                 PSGT       F  S         N+   +S+LE+++  KTFS+ EIDRL E++ SR  D+P      +  ++P        +      K 
Subjt:  -----VAADPSGTQEGTNIGFVPSINS------NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ-EGSPKL

Query:  PTQSQDGVSPHMATTHVVTANVL-------DEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKS--STLSLVPRS-------------PGNFDVVENGFV
        P   +D  S   AT   +  +++       DE   SPAE+AKAYMG +   ++         K       LV +S             PG     ++GF 
Subjt:  PTQSQDGVSPHMATTHVVTANVL-------DEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPLKS--STLSLVPRS-------------PGNFDVVENGFV

Query:  TPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIA---TADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGL
        TP+SR  S  L +  R PYSR   + S    +     +  + S   S SQS   + G L   +            D G  GP RRTRQ +    + S+  
Subjt:  TPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIA---TADAYRSTTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGL

Query:  PSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKL---TPPKEKSSELKLLS
        P S  S  AS   +              SS  G+  Y +      S++T   K+      +   +P  SS++A  IL+ L++    + PK K++ELKL +
Subjt:  PSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKL---TPPKEKSSELKLLS

Query:  VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPN--DKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPS
           + P            + +++   SAK  E+++ I S       +Q +   +  + +  ++ N  +K+ S  +G+        +G G+ +Q  F  P 
Subjt:  VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPN--DKSISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPS

Query:  IQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIE-AKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPT
           K +   S H      DE G S+    D +  +         ++ KP +  +        SI  AKPF            K  VPS +     F+FP 
Subjt:  IQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIE-AKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPT

Query:  ASSPSITANVKGTESSLRPEKVASP-------------ELPKAATAPIFGF------GEKSP-------SQKEAGSHPPTFAFGSKATTTNEQ
        +SS   T++ + T  S+ P   + P             E  K    P F F      G+KSP         +E  S      FG K T  +E+
Subjt:  ASSPSITANVKGTESSLRPEKVASP-------------ELPKAATAPIFGF------GEKSP-------SQKEAGSHPPTFAFGSKATTTNEQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGACAGAGCGTGAGGACGTTCAATATGAAGGAGGTAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGGCCTATTAGAAGGTCTCATACCACGCCCTATGATCGGCCGCCGACTGC
TCTAAGGAACTCTGCTGCTAAAGGATGGCTTTCTAACCTTGTCGATCCAGCGCACAAGCTAATTAATTCTACCGCCCATTGGCTTTTTTCTACTGTCTTTCGTAAACGCC
TCCCCCCTCCGCCGCCGTCATTTCCACTTTCTCGAGAGGCTAATGACGAGATGGAACATAGGAATCAGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTTCTGGGACTCAAGAAGGGACT
AATATTGGTTTTGTTCCAAGCATCAATTCGAATAACACCCAAGGGCTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAACGAGAAGACCTTTTCAAGATTTGAGATTGATCGCTTGAC
TGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGACGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGGTCCCTTCAACCCCTGTTACCAGTCATGGAATACAGGAAGGATCTC
CAAAACTTCCAACTCAGAGTCAGGATGGAGTTAGCCCGCATATGGCTACAACTCATGTTGTGACTGCAAATGTCCTCGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCTGAGATCGCA
AAAGCATACATGGGCAGCAGACCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCAGGCAATCCTTTGAAATCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCAGGAAATTTTGA
TGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACGCCGAGATCTCGTGGTAGGTCTGCCCTATACAGCATGGCTCGAGTTCCATATTCCAGAGTTCGTGCAACCCCCAGCATAAAGAATA
GTATAGCCACAGCAGATGCTTACAGGTCCACTACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCGTGGGAGCAAGGGGGACTTTTGGGGTCTAAACAAGGAGCTTTGAAACGCCGAAAC
TCAGTTTTAGATGATGATATGGGATCTGTTGGTCCTATCCGAAGAACTCGTCAGAAATCCAATCACCTTTTTTCAACAAGTTTAGGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTAT
TCGAGCAAGTGGCATTGGTTCTGAGACTGCTCGGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTAATGGTGGGAAGCCACTTTATTCAAATGAGATACAGCGCA
ATTTCTCCAAAATGACTGCAGAGTCCAAAAATGCTATGACACCTAGTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTA
GATAAATTGACCCCTCCAAAGGAAAAATCTTCGGAACTGAAGCTGCTTAGTGTAAGGAATAACTCACCCATGAAGTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAG
AAGCCTGGAAGATGTGGATTCAGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGGCATTCGGTCTAACGATGCCCGTGATCTTACTTCTCAAAAGAATGATAAGTTCGAGGAAAGTA
GTCCGTCAAAATTTAACGTACCCAATGATAAATCTATTTCTACCGGTGATGGTGTAGGTTCTTCAGTTTCTACTAAGGATGCCGGATCTGGTTCTGGCATGCAAGTTTCA
TTTGTTGGCCCTTCCATACAAACAAAATGTGCCTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATGGATGAAGAAGGATTTTCTAATGGACCAGTAGCTGATAAATC
GTTTGAGATGCAAGGAAAAGTTGATGACTCATTAGTGTCTGTGAGTAAGCCGAAGAATACTGAAGTCATCACAGTAGATAAATCAAAGGCTTCAATTGAGGCTAAACCAT
TCGTGGTATCTGTAATGAACAAAATAAATGACCAAGGAAAATCTGATGTTCCCTCCACTACAGAAAAGAGCCCCATTTTTTCCTTTCCAACAGCATCTTCACCTAGCATT
ACAGCCAACGTGAAGGGTACTGAATCAAGCTTGAGACCTGAAAAAGTTGCTTCACCTGAGTTACCAAAAGCAGCCACAGCCCCTATTTTTGGCTTTGGAGAAAAGTCGCC
TTCACAGAAGGAAGCAGGGTCTCATCCCCCCACCTTTGCCTTTGGAAGCAAGGCTACCACAACAAATGAACAAAATACCATTCATGTTGTAACTTCAGAAGCCAACGTCG
AACCAACTCAACAGGCTTCTCCTCCTACAACGTTTAAATTTGGAGACAAAGCTTCGTTTCCTATTCCAGCAAATGCCGCTACAGAAAATGGGAATAAGAGTGCGGGGTCT
CTATTTAAGTTTGCATCACCTTTGGTTAATGAAAAAGAAGGTGCTAATGTTGGCGGTAGTGCTTCAGTTTTTAAAGCAGAGAATTCTAGCAGCAGCATACCATCATTTGG
AGTTCCAAAAGAGTCTATATCGGAGAAAGCTGGTGATAAGAGTTCAAGTCCTGGTCTTATATTTGGTACATCTGGGACTTTGTTTTCGTCATCTGTCTCAACATCAACAT
CAACACCAACTCCGAGTTTGTTTTCATTTAGCACCCCTAGCACTAATTCAAATCTCAACAACGGGTCTCTTGTTTCTACTACTCCATCTACTTTGCCGACTCCAGCCACC
ACCTTTTCTAATAATGTAACAAGTCAGAATTCATCCGTCAAACCATCTTTCAGTGCTGCCACTAGCAACAGTGAACCCGTCAGTTCTACAAGTCCTCCTACGTCCTCTCC
TATGCCATCCTTTTCAGCTGCACCAATTTTTAAATTTGGAAGCTCTAGCGTTCCTTCTACTTCTGCTCCAGCTCTATCAGCACCAAGTGTAGTTGGATCCGTAGAAACCA
AGACCAAGCCAGAGACAACATTCGGCAATTTAAGTGGCTTTCCTGCAAGTGACACATCTGCTGTTAAAGTTGCTAGTACTGGAAACAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCA
TCTACTACTTCAGATGCTAATAAAGGACCAGCAAATTCAACTTTTGCTCAAAACAACATTCCTGCATTTGGTGCTCCGGTTTCATTTTCTAGTAGTGGGCTTGCATTGTC
TACTCAGAGTACACCTGCTTTGCAATTCAGTTCATCATCTACGTCATTTGGTTTGACTCGGAATACAGGTTTGGCGTCTGGCAGTTCTCTATTTGGTTCTTCAGCTCCAG
CATCTAATCCGTTCACTTCAGGTGCTACTTTTGGGCTTGCTTCCTCCAGTTCCTCTGCTAACAATTCTGTCAGTTCTAGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAACTGG
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CTTTGGATCATCATCAACCGGTGCACCGTCAGCCTCTATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAAGTGCGACGACATCACAACCTGCTTTTGGTAATTCTAACAATGCCTTCA
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CSPI06G04140 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome