; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G04730 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G04730
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionlight-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic
Genome locationChr6:4297481..4300486
RNA-Seq ExpressionCSPI06G04730
SyntenyCSPI06G04730
Gene Ontology termsGO:0006850 - mitochondrial pyruvate transmembrane transport (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0031305 - integral component of mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0050833 - pyruvate transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140959.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucumis sativus]3.0e-85100Show/hide
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XP_008441491.1 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 [Cucumis melo]4.8e-7589.53Show/hide
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XP_022939849.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita moschata]2.3e-6983.16Show/hide
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XP_023551626.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-6983.68Show/hide
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XP_038884716.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Benincasa hispida]1.0e-6982.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBA0 Uncharacterized protein1.4e-85100Show/hide
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A0A1S3B3J8 proline-rich receptor-like protein kinase PERK142.3e-7589.53Show/hide
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A0A6J1FIC8 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic1.1e-6983.16Show/hide
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A0A6J1JS47 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic2.7e-6378.35Show/hide
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A0A6J1K1U3 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic8.0e-6882.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FEC1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic1.2e-4470.44Show/hide
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        L+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G34000.1 one-helix protein 28.5e-4670.44Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGGGCTTGTTCATTCCCCTTCCCCAGTATCAAAATCCCCTCCACTTCCTCCTCACCGGCCGCCACCTCCGCTGCCGCTTCTTCCTCCGCCTCCACCTCCTCTTC
AGCTTCTTCTTCATCCTCCCTCCGATTCTCCTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGACCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCTCCGCTCCTTCTCTCA
GAGACCCCTCCCCGCCCTCTCCCCCTTCCCTGACGCCTCCTCTCAAGCCTACTCCTCCCCCGCAATCCCCTCCGTCGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGCGGCTC
AAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTGATCAGGGACCGTTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGC
TATGTTTGGTTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCGAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCGACATCATATCCACACCAAACATATCCCCTCCTCAAATCCTAATCCCTTTCTCTTAAACCAAATCCCTTTTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTTTATTCTTTTGACT
TCAATTCTTCCATTTCACTTCCACTCACAATTTTCTGAAATGTCTGGGGCTTGTTCATTCCCCTTCCCCAGTATCAAAATCCCCTCCACTTCCTCCTCACCGGCCGCCAC
CTCCGCTGCCGCTTCTTCCTCCGCCTCCACCTCCTCTTCAGCTTCTTCTTCATCCTCCCTCCGATTCTCCTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGA
CCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCTCCGCTCCTTCTCTCAGAGACCCCTCCCCGCCCTCTCCCCCTTCCCTGACGCCTCCTCTCAAGCCTACTCCTCCCCCGCAATCCCCT
CCGTCGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGCGGCTCAAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTGATCAGGGACCGTTCTTTGG
CTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCGAACTTTGTTGATCAAGTAAAGA
TCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGACGCGATGTACGAGGTCAATGTTGCTATATTTTTCCATTTTCTGTAATTTATGTATCTACATCATGTAATTCA
TCTTATAGTCTTCATGAGAGTTTTGTTGTCTGTTACACTTAATTGCCATGCAAGTGTGTGTGCTCCTTGCAATACTTTACTGTTTTTCAGTTATATATAAAAATCTTCCC
CCCTTTTTTATGAGTCTGTAATTCTAATTCAGTTGGAGCATATTACCTATTCAAACCTTGCTAAAATTCTGTACCTTCATTTATTAGAGGTTCCATTTACATAATAAAAA
CGTTGAAACTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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