; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G07450 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G07450
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationChr6:6313804..6315603
RNA-Seq ExpressionCSPI06G07450
SyntenyCSPI06G07450
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-10699.01Show/hide
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XP_038906838.1 uncharacterized protein LOC120092736 [Benincasa hispida]7.8e-10395.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein2.7e-109100Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988822.2e-10398.48Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein9.7e-10799.01Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557803.5e-8886.14Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883502.1e-8584.24Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein5.0e-3146.15Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)2.6e-3547.52Show/hide
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        DR
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AT2G33510.2 unknown protein2.7e-3244.24Show/hide
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        VEDCPKC +++L+HFDR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCTCTTGAGCAATCTTTCCGTAACTTCTCCCTCAACCACCGTCTATCCTCCGCCGCCCCCTCCTCCGCCGGAGTGCG
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TCTCCCTCCCTCCCTTCTGGGAGCAATGTCTCGATTTGAAGACAGGGGAAGTTTACTATAGAAACTGCCGAACCGGAATGAAGGTAAAAGAAGATCCGAGGACAGCGGTA
GCACACAGCCGAGATTTATATTTGGAAGACGACGACGGAGAGGACGGTGATGAAAGTTCTTCAGACGGTGGAAGTGAGGAGTCGTGTTCTTCATCGTCGTACGGTGGTAG
TAGACAGCAATATCCAGCGGAAAACGTGGAGGACGTACTGGTGGTGGCTGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTCATGGTACCGAAACAGGTTGAAGATTGTCCCAAAT
GCAGCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACGACGATAACACACATTCTTTCCCTTCTTCTTATTCTCATTCTTTCTTCCATTTAATCTCTTTTCTTATTCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCATCGAGATGAAATCT
CCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCTCTTGAGCAATCTTTCCGTAACTTCTCCCTCAACCACCGTCTATCCTCCGCCGCCCCCTCCTCCGCCGGAGTGCGGAGATCACC
GTCTTCATTTTCTTCCTCTTCCTCCTCTTCCGATGACGAACCTCATCTTCCTCTTCATCAACATAATCGCTTCGACACAATCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCCCTCC
CTCCCTTCTGGGAGCAATGTCTCGATTTGAAGACAGGGGAAGTTTACTATAGAAACTGCCGAACCGGAATGAAGGTAAAAGAAGATCCGAGGACAGCGGTAGCACACAGC
CGAGATTTATATTTGGAAGACGACGACGGAGAGGACGGTGATGAAAGTTCTTCAGACGGTGGAAGTGAGGAGTCGTGTTCTTCATCGTCGTACGGTGGTAGTAGACAGCA
ATATCCAGCGGAAAACGTGGAGGACGTACTGGTGGTGGCTGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTCATGGTACCGAAACAGGTTGAAGATTGTCCCAAATGCAGCAGCA
GTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGAACCACTTTATTTATTATTTTTGAGAAAACAAGAAATCAAAATCAAACTGTATTTGGGTTA
AATTGATCTGACAAAATCATTGATTCTTTTTCTTTGGATTAATTTGGTGATTAGCAAAAGGCTAAATGGGGATTTAAATTTCTTTAATTAGCTCTATTTCTCTCTTTGTG
AATGATCTGTTGTTCGTGTGTTCGTTGTTATTGATATGTAGACAAAAATTATAGAAAAACAAAAAGAAGAATTGAAATGAAAAGAATGTGAGAAAGAGTGCGGCCATGGA
TGATGGTATAAGGAGGAAGCTGATAGAGAGGGTATATGAATGGGATGGTCAACGACTCAAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGAATAATATT
TTGCTCGTGAAGACAGCGACTTGTTGCTTTCATGATTCCTCAACCCACACTGATTGAATCGTACGCAATTATTATTATTATTATTTTAACAACCCAAAAATTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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