; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G07570 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G07570
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionExtensin
Genome locationChr6:6419067..6421125
RNA-Seq ExpressionCSPI06G07570
SyntenyCSPI06G07570
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
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KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-20295.73Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]8.8e-21599.75Show/hide
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]5.0e-20295.48Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.5e-17779.16Show/hide
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]1.1e-19392.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein4.2e-21599.75Show/hide
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A0A1S3CB81 extensin2.4e-20295.48Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin4.9e-20395.73Show/hide
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A0A6J1GPH0 formin-2-like7.8e-17779.16Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like3.1e-17378.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 36.9e-0539.02Show/hide
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        LS  P+      CG      P  +T         PP SLP P PP      PP  + P PP PP P   P PP PP PPV + P P  P PP  P   PP
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        S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.3e-3548.94Show/hide
Query:  ITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVP
        ITI+G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E + FS NRTT+++G+Y++ I S+D   CAD  ++ S CQASLIG    S   CN+P
Subjt:  ITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVP

Query:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK
        G RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein4.9e-0639.02Show/hide
Query:  LSYRPMKKNESLCGSKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPP-----LPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPP
        LS  P+      CG      P  +T         PP SLP P PP      PP  + P PP PP P   P PP PP PPV + P P  P PP  P   PP
Subjt:  LSYRPMKKNESLCGSKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPP-----LPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPP

Query:  LPPLFPSPP----SPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSP
         PP  P PP    SP  PS PPPPPP     P    P   P   PPPPP   S PPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  +  + PP   
Subjt:  LPPLFPSPP----SPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSP

Query:  SPPPAFDPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        S PP   P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  SPPPAFDPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.5e-4742.9Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFT-SLFGR------TAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LL L S  T    GR         +L   +RIT+VG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFT-SLFGR------TAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGSSSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKIPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+C DG+ + S C A ++ +SS+    C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       K EK+      SKFF P
Subjt:  PSVDGINCADGMTMQSFCQASLIGSSSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKIPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSP
        +  PY  P+P+                    P LPPLP LPP P FPF      PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSP

Query:  FSP
        F P
Subjt:  FSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein5.4e-3747.02Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN
        I LLLLL L S   SL  + + A  +  +IT++G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN

Query:  CADGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
        CA      ++ + CQASLIG S + CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  CADGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGTTTGGCCGAACAGCTGAAGCTCTAACGTCAGTCACTCGAAT
CACAATAGTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAA
TTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGCTGAT
GGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGCAGCTCATCTGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAGTAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCT
CCTCAAAGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTACCTCCACTTCCTCCATTGCCTCCA
CTGCCTCCACTGCCCCCACTGCCTCCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTTTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTT
ATTTCCTTCACCTCCAAGTCCATCTCAACCATCTGCACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTC
CACCGCCTCCGCCATCATCACCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGA
GACCCGAGAACCTGGATTCCTAATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCGTATTCCTCCATTTTTCCC
TCCCCCACCTCCATCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACAAGGGCTTCATTTGGTATCATAGAAATTTTTTCTTCTTTTCTCGTGGCATTTTTCTGGGTCCTAAATATAATGAAGTTCCACTTATTGGGTAGTCAGTAGAAATATG
AAAAGTTTCTTCCTTACATCTTTCCAGATCTAGGAAATCAAATAGCCTTTTAATCATCCCATTTATCTCTGAATCCGCCTTAAAAGACTAACCACAAAACCCCTTTCATT
TTACACTTGCCCCCACATTCATCCAAAAAGGTACTTCACATGTCTTTGTTTGTAGTGAATAGAATAATCATTTTTTCTTTTCTGATTACAGTTGGTCTAACACCAAGAAC
TCACGGGCACATTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAATCACTTGAAAATTTTAAGATCTTACCCATTGATGCTTCTCGCACAACCTCCTCCACTTCATTGAATGTTTC
TTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGTTTGGCCGAACAGCTGAAGCTCTAACGTCAGTCACTCGAATCACAATA
GTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAATTGCTCC
CAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGCTGATGGTATGA
CAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGCAGCTCATCTGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAAGCAAGAT
AATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAGTAAGAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAA
GTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTACCTCCACTTCCTCCATTGCCTCCACTGCCTC
CACTGCCCCCACTGCCTCCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTTTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTTATTTCCT
TCACCTCCAAGTCCATCTCAACCATCTGCACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCGCC
TCCGCCATCATCACCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGA
GAACCTGGATTCCTAATATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCGTATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCA
CCTCCATCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAATATTGTGCTTTGTTTTCCCT
CCTCTTTACCACTACAAATTTTCTTTCAATATGATATTGTTTGATATGTGCTTATGTATTTTTCCGGTGCCCTGTCCATTCAGGAAAAACAACAAACACCTTGTGTGCCA
ATATAATTCATGTACAGAAAACAAAAGGGGATTTGTCTGTTAATATGATAAATCAAGAAGCTGGATATCATCAATGTATTATTTCATTAATCTTCAAATTTGCAAGAAAA
GTTTACATTCTCAAGTCTTTAGAGAATGATACTAAAAGGAAAAGAAAGAAACTCATAGACCGTCAGTACCTTGCTTCCGGAAAATACCACCGCAACAAAACAACCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLFGRTAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCAD
GMTMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPLPPLPPLPP
LPPLPPLPPLPPVPFFPFPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPSQPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPR
DPRTWIPNIPPFSPSPPPAFDPRDPRTWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP