; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G07950 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G07950
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic
Genome locationChr6:6705222..6707648
RNA-Seq ExpressionCSPI06G07950
SyntenyCSPI06G07950
Gene Ontology termsGO:1901259 - chloroplast rRNA processing (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7025359.1 hypothetical protein SDJN02_11854 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.3e-11575.08Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL------------VS---------LRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE
        MAN A+ L+ SS SS S  IL  K  N    KQLHS  SS HFD+ KL            VS         LRHNHG RFPVLFTVLD E+A+T E I E
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL------------VS---------LRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE

Query:  GDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDM
          VKSE S+SNQEVK LARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALD SDVGGREMRVRFAVDM
Subjt:  GDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDM

Query:  NSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGL
        N K RN NNLHSSP+KNIIYESPYK+Y+GNL+WDVKP DLRNLF +FGTVVSAK+LNDRRAGKSR+YGFLSFSSAAERDA+ISL+GTE+ NRKL+V+EGL
Subjt:  NSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGL

Query:  ERSES
        ER+ES
Subjt:  ERSES

XP_004140529.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis sativus]2.3e-15398.6Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSS--SPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLAR
        MANLATSLTFSSSS  SPSLWILKHKSP+YCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSE SLSNQEVKKLAR
Subjt:  MANLATSLTFSSSS--SPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLAR

Query:  PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNII
        PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNII
Subjt:  PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNII

Query:  YESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
        YESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
Subjt:  YESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

XP_008459818.1 PREDICTED: 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis melo]9.2e-15096.48Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPC
        MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSF SSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESS+SNQEVKKLARPC
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPC

Query:  ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYE
        ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRFAVDMN K RNLNNL+SSPKKNIIYE
Subjt:  ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYE

Query:  SPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
        SPYKVYVGNLSWDV+PGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTE+N RKLVVREG ERSES
Subjt:  SPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

XP_022156980.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Momordica charantia]1.9e-11875.08Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE
        MAN AT LT SSSSS S     WIL+     +CT KQLHS  SS HF Y+KL                      SL HN   RF VL  +LD ESA+TEE
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE

Query:  AIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRF
        AI E DVKSE + SNQEVKK A+PCELYVCNLPR+CDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRF
Subjt:  AIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRF

Query:  AVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVV
        AVDM+ KKRN+ NL+SSPKKNIIYESPYKVYVGNL+WDVKPGDLR+LFS+FGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAER+A+ISLDGTE+NNRKL+V
Subjt:  AVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVV

Query:  REGLERSES
        REGLER+ES
Subjt:  REGLERSES

XP_038906862.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Benincasa hispida]3.4e-14491.1Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSS--------PSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQE
        MANLATSLTFSSSSS        PSLWILKHKSPNYC+FK+LHSF SS HFD+TKLVSLRHNHG RFPVLFTVL+NESALTEE I EGDVKSE S+SNQE
Subjt:  MANLATSLTFSSSSS--------PSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQE

Query:  VKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSS
        VKK ARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRFAVDMN KKRNLNNLHSS
Subjt:  VKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSS

Query:  PKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
        PKKNIIYESPYKVY+GNL+WDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDA+ISLDGTEYNNRKLVVREGLER+ES
Subjt:  PKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAH9 Uncharacterized protein1.1e-15398.6Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSS--SPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLAR
        MANLATSLTFSSSS  SPSLWILKHKSP+YCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSE SLSNQEVKKLAR
Subjt:  MANLATSLTFSSSS--SPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLAR

Query:  PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNII
        PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNII
Subjt:  PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNII

Query:  YESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
        YESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
Subjt:  YESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

A0A1S3CB56 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic4.5e-15096.48Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPC
        MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSF SSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESS+SNQEVKKLARPC
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPC

Query:  ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYE
        ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRFAVDMN K RNLNNL+SSPKKNIIYE
Subjt:  ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYE

Query:  SPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
        SPYKVYVGNLSWDV+PGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTE+N RKLVVREG ERSES
Subjt:  SPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

A0A5D3DM74 28 kDa ribonucleoprotein4.5e-15096.48Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPC
        MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSF SSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESS+SNQEVKKLARPC
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPC

Query:  ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYE
        ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRFAVDMN K RNLNNL+SSPKKNIIYE
Subjt:  ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYE

Query:  SPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
        SPYKVYVGNLSWDV+PGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTE+N RKLVVREG ERSES
Subjt:  SPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

A0A6J1DRW5 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic9.1e-11975.08Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE
        MAN AT LT SSSSS S     WIL+     +CT KQLHS  SS HF Y+KL                      SL HN   RF VL  +LD ESA+TEE
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE

Query:  AIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRF
        AI E DVKSE + SNQEVKK A+PCELYVCNLPR+CDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRF
Subjt:  AIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRF

Query:  AVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVV
        AVDM+ KKRN+ NL+SSPKKNIIYESPYKVYVGNL+WDVKPGDLR+LFS+FGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAER+A+ISLDGTE+NNRKL+V
Subjt:  AVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVV

Query:  REGLERSES
        REGLER+ES
Subjt:  REGLERSES

A0A6J1H6A5 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic3.6e-11574.75Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL------------VS---------LRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE
        MAN A+ L+ SS SS S  IL  K  N    KQLHS  SS HFD+ KL            VS         LRH HG RFPV+FTVLD E+A+T E I E
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKL------------VS---------LRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE

Query:  GDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDM
          VKSE S+SNQEVK LARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALD SDVGGREMRVRFAVDM
Subjt:  GDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDM

Query:  NSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGL
        N K RN NNLHSSP+KNIIYESPYK+Y+GNL+WDVKP DLRNLFS+FGTVVSAK+LNDRRAGKSR+YGFLSFSSAAERDA+ISL+GTE+ NRKL+V+EGL
Subjt:  NSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGL

Query:  ERSES
        ER+ES
Subjt:  ERSES

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19682 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic3.6e-2432.31Show/hide
Query:  RFPVLFTVL--DNESALTEEAIVEGDVKS--ESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINS
        +FP   +VL  D+ + + ++    GD  S    +   +E ++ +   +L+V NLP   D   L ++F+  G V  AEV  N ET  S+G G+VTM ++  
Subjt:  RFPVLFTVL--DNESALTEEAIVEGDVKS--ESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINS

Query:  AKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSS
        A  ++      D+ GR + V  A    S+         +P+    ++  Y++YVGN+ WD+    L  +FS  G VVSA+V+ DR +G+SR +GF++ SS
Subjt:  AKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSS

Query:  AAERDASI-SLDGTEYNNRKLVVREGLER
         AE   +I +LDG   + R + V    ER
Subjt:  AAERDASI-SLDGTEYNNRKLVVREGLER

P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic6.6e-2635.68Show/hide
Query:  GERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAK
        GE  P       +E+ +++E  VEG          Q   +     +L+V NLP   D  +L  +F   G V  AEV  N ET  S+G G+VTM ++  A+
Subjt:  GERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAK

Query:  VSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAA
         ++  L+G D+ GR++ V  A    S +R       +P+ +  +E   +VYVGNL WDV    L  LFS  G VVSA+V++DR  G+SR +GF++ SS +
Subjt:  VSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAA

Query:  E-RDASISLDGTEYNNRKLVVREGLER
        E  DA  +LDG   + R + V    ER
Subjt:  E-RDASISLDGTEYNNRKLVVREGLER

Q04836 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic1.9e-2535.35Show/hide
Query:  NESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVG
        +E  ++E    EGDV   +     E  + +   +L+V NL    +   L  +F+  GTV  AEV  N ET  S+G G+VTM S++ A+ ++   +  D+ 
Subjt:  NESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVG

Query:  GREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDGT
        GR + V  A    S+         +P+   +YE  ++VYVGNL WDV  G L  LFS  G VV A+V+ DR  G+SR +GF++ S   E + +IS LDG 
Subjt:  GREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDGT

Query:  EYNNRKLVVREGLER
            R + V    ER
Subjt:  EYNNRKLVVREGLER

Q08935 29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic2.8e-2437.1Show/hide
Query:  QEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLH
        +E +  +   +++V NLP S D A L E+F+  G V   EV  +  TG S+G G+VTM S    + +    +G ++ GR +RV        +KR  ++  
Subjt:  QEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLH

Query:  SSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEYNNRKLVV
           +    ++S  +VYVGNL+W V    L  LFS  G VV AKV+ DR +G+SR +GF+++SSA E + +I SLDG + N R + V
Subjt:  SSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEYNNRKLVV

Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic4.8e-2433.5Show/hide
Query:  VEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAV
        V+   +SE  +   E  + A+   L+V NLP   D   L  +F+  GTV  +EV  N +T  S+G G+VTM ++  A+ ++   +  +V GR + V  A 
Subjt:  VEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAV

Query:  DMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEYNNRKLVVR
           S+           ++  +Y++ +++YVGNL WDV  G L  LFS  G VV A+V++DR  G+SR +GF+  S+  E + +I +LDG     R + V 
Subjt:  DMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEYNNRKLVVR

Query:  EGLERS
           ER+
Subjt:  EGLERS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G01080.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein2.6e-7048.82Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSL
        MA    ++  SSSS  S     +  P Y T      +S+  S    ++   S  H+   R     P+   V  +E ++     EE +V+G+ +   +S +
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSL

Query:  SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMN-SKKRNLN
        S  E  K  RPCELYVCN+PRS DIA+L++MF+P+GTV++ EVSRNP+TG S+G GYVTMGSINSAK++I +LDG++VGGREMRVR++VDMN   +RN  
Subjt:  SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMN-SKKRNLN

Query:  NLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
         L+S+PKK ++YES +KVYVGNL W  +P  LRN FS+FGT+VS +VL+DR+ G++RV+ FLSF+S  ERDA++S +GT+Y  R+++VREG+E+SES
Subjt:  NLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

AT1G01080.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.5e-6948.66Show/hide
Query:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSL
        MA    ++  SSSS  S     +  P Y T      +S+  S    ++   S  H+   R     P+   V  +E ++     EE +V+G+ +   +S +
Subjt:  MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSL

Query:  SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAE-VSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMN-SKKRNL
        S  E  K  RPCELYVCN+PRS DIA+L++MF+P+GTV++ E VSRNP+TG S+G GYVTMGSINSAK++I +LDG++VGGREMRVR++VDMN   +RN 
Subjt:  SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAE-VSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMN-SKKRNL

Query:  NNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES
          L+S+PKK ++YES +KVYVGNL W  +P  LRN FS+FGT+VS +VL+DR+ G++RV+ FLSF+S  ERDA++S +GT+Y  R+++VREG+E+SES
Subjt:  NNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES

AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 333.7e-2432.55Show/hide
Query:  EEAIVEGDV-KSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMR
        EE   EGD  + E     Q  +       LYV NLP +   +EL ++F   GTV+  ++  +  T  S+G G+VTMGSI  AK ++   + S +GGR ++
Subjt:  EEAIVEGDV-KSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMR

Query:  VRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAE-RDASISLDGTEYNNR
        V F       +  +             +SP+KVY GNL W++    L++ F     V+ AKV+ +R  G+SR +GF+SF SA   + A  +++G E   R
Subjt:  VRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAE-RDASISLDGTEYNNR

Query:  KLVVREGLERSE
         L +    ER +
Subjt:  KLVVREGLERSE

AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein1.4e-2635.35Show/hide
Query:  NESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVG
        +E  ++E    EGDV   +     E  + +   +L+V NL    +   L  +F+  GTV  AEV  N ET  S+G G+VTM S++ A+ ++   +  D+ 
Subjt:  NESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVG

Query:  GREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDGT
        GR + V  A    S+         +P+   +YE  ++VYVGNL WDV  G L  LFS  G VV A+V+ DR  G+SR +GF++ S   E + +IS LDG 
Subjt:  GREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDGT

Query:  EYNNRKLVVREGLER
            R + V    ER
Subjt:  EYNNRKLVVREGLER

AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B3.4e-2533.5Show/hide
Query:  VEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAV
        V+   +SE  +   E  + A+   L+V NLP   D   L  +F+  GTV  +EV  N +T  S+G G+VTM ++  A+ ++   +  +V GR + V  A 
Subjt:  VEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAV

Query:  DMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEYNNRKLVVR
           S+           ++  +Y++ +++YVGNL WDV  G L  LFS  G VV A+V++DR  G+SR +GF+  S+  E + +I +LDG     R + V 
Subjt:  DMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEYNNRKLVVR

Query:  EGLERS
           ER+
Subjt:  EGLERS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAACCTTGCGACCTCCTTAACCTTCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCTATGGATCCTCAAACATAAATCTCCAAATTACTGTACATTCAAACAACTGCACTCTTT
CCATTCATCCTTTCACTTCGACTACACGAAGCTCGTTTCCCTAAGGCATAACCATGGGGAAAGGTTTCCAGTGCTTTTCACTGTTCTTGACAATGAATCTGCGCTTACGG
AGGAGGCCATTGTGGAAGGTGATGTTAAGAGCGAAAGCAGCCTTTCAAATCAGGAAGTGAAAAAGCTAGCACGTCCTTGTGAGCTATACGTTTGTAATTTGCCGAGGAGT
TGCGACATTGCGGAGCTGGTTGAGATGTTTAAACCTTATGGCACAGTCTTGGCTGCTGAGGTTTCTCGGAATCCAGAGACAGGCATAAGCAAAGGATGTGGCTATGTCAC
AATGGGTTCAATAAACTCGGCTAAAGTTTCAATTACAGCATTAGATGGTTCTGATGTTGGGGGACGTGAAATGCGCGTTAGATTTGCAGTTGATATGAATTCCAAAAAGA
GGAACCTTAATAACTTGCATTCATCACCCAAGAAGAATATAATATATGAAAGTCCTTACAAAGTGTATGTTGGAAATCTTTCGTGGGATGTCAAACCTGGAGACCTGAGG
AACCTTTTTAGCAGATTTGGAACTGTGGTCAGTGCAAAAGTTTTGAACGATCGTAGAGCTGGAAAAAGCCGCGTTTACGGGTTTCTATCGTTTTCTTCAGCTGCAGAGCG
TGATGCATCGATTTCTTTGGATGGAACAGAGTACAACAACAGGAAGCTTGTTGTTAGAGAAGGTTTGGAAAGGAGCGAATCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAGCTTCTTCTTCATCTCCGCCATGGCTAACCTTGCGACCTCCTTAACCTTCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCTATGGATCCTCAAACATAAATCTCCAAATTACTGT
ACATTCAAACAACTGCACTCTTTCCATTCATCCTTTCACTTCGACTACACGAAGCTCGTTTCCCTAAGGCATAACCATGGGGAAAGGTTTCCAGTGCTTTTCACTGTTCT
TGACAATGAATCTGCGCTTACGGAGGAGGCCATTGTGGAAGGTGATGTTAAGAGCGAAAGCAGCCTTTCAAATCAGGAAGTGAAAAAGCTAGCACGTCCTTGTGAGCTAT
ACGTTTGTAATTTGCCGAGGAGTTGCGACATTGCGGAGCTGGTTGAGATGTTTAAACCTTATGGCACAGTCTTGGCTGCTGAGGTTTCTCGGAATCCAGAGACAGGCATA
AGCAAAGGATGTGGCTATGTCACAATGGGTTCAATAAACTCGGCTAAAGTTTCAATTACAGCATTAGATGGTTCTGATGTTGGGGGACGTGAAATGCGCGTTAGATTTGC
AGTTGATATGAATTCCAAAAAGAGGAACCTTAATAACTTGCATTCATCACCCAAGAAGAATATAATATATGAAAGTCCTTACAAAGTGTATGTTGGAAATCTTTCGTGGG
ATGTCAAACCTGGAGACCTGAGGAACCTTTTTAGCAGATTTGGAACTGTGGTCAGTGCAAAAGTTTTGAACGATCGTAGAGCTGGAAAAAGCCGCGTTTACGGGTTTCTA
TCGTTTTCTTCAGCTGCAGAGCGTGATGCATCGATTTCTTTGGATGGAACAGAGTACAACAACAGGAAGCTTGTTGTTAGAGAAGGTTTGGAAAGGAGCGAATCTTAAAT
GCAGTTAGTCTTCTTGCACAAGTTAGAAAGAAATCTCATCTTGTTTAATTGTTTTAAATCAATTATGAGTTTGATCTAGCTATATTAGAATCTTGCAAAGTTTTGTTTTG
AGGGTGTTAAAATCTATCATAAGGAATATTCAATCATAAATAGCAGCCATTCTTAGATTCATTGCATAGAAGTCTCTACTTTGGATTTTCTTGGCCGGTAGTTTTGTATT
AAATTTGATTATTGTTTAACAAGAGTGGGCTAGTTAATCGGTTTCTGCTACTTGTAATTCTCTTGAGCAGCCATCCTTCTATAAATTGACTGATTCTTTTGATCATTTGT
ATATGAATAAAAAGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFHSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSLSNQEVKKLARPCELYVCNLPRS
CDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSITALDGSDVGGREMRVRFAVDMNSKKRNLNNLHSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVKPGDLR
NLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEYNNRKLVVREGLERSES