| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0039788.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like [Cucumis melo var. makuwa] | 5.8e-173 | 93.92 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQA VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKN
GFNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVA ETVNETEKN
Subjt: GFNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKN
Query: VGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEER
VGDEKPIQE+DTSG NT++PAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEER
Subjt: VGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEER
Query: TKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
TKKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFP LGAK
Subjt: TKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| KAG7011066.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.4e-155 | 85.32 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M T+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KK AQTKP+ S +Q NKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRD N+EN +APEDG GKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE+KREG+GRGNWGR DEFAEVA E VNE EKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKP+QE+DTSGVN ENPAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKAL+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGY GS +SNVAAPSI DPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| XP_004140509.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A [Cucumis sativus] | 7.7e-186 | 99.72 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPADGERH APGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| XP_008459799.1 PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like [Cucumis melo] | 2.3e-174 | 94.18 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVA ETVNETEKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKPIQE+DTSG NT++PAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFP LGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| XP_038874269.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like [Benincasa hispida] | 8.1e-159 | 88.37 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M T+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAA A AP SKK PAQTKP+ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRD NNE+ NAPEDG GGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE A+GERPRRAFERHSGTGRGNEFKREG+GRGNWGRSTDEFAEV E VNETEKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEP+E PEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNN+IFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERH APGGRGRGRGRG RGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K9Z4 HABP4_PAI-RBP1 domain-containing protein | 3.7e-186 | 99.72 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPADGERH APGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A1S3CBH1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like | 1.1e-174 | 94.18 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVA ETVNETEKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKPIQE+DTSG NT++PAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFP LGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A5A7TA33 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like | 2.8e-173 | 93.92 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQA VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKN
GFNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVA ETVNETEKN
Subjt: GFNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKN
Query: VGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEER
VGDEKPIQE+DTSG NT++PAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEER
Subjt: VGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEER
Query: TKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
TKKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFP LGAK
Subjt: TKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A6J1EYL1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X2 | 3.4e-155 | 85.32 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M T+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KK AQTKP+ S +Q NKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRD N+EN +APEDG GKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNWGR DEFAEVA E VNE EKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
GDEKP+QE+DTSGVN+ENPAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKAL+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGY GS +SNVAAPSI DPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A6J1F3H7 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X1 | 8.4e-154 | 85.08 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M T+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KK AQTKP+ S +Q NKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
FNRD N+EN +APEDG GKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNWGR DEFAEVA E VNE EKNV
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGGKTSERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNV
Query: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL-GSEKDKRKEMADKEER
GDEKP+QE+DTSGVN+ENPAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKAL+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKL GSEKDKRKE+ADKEER
Subjt: GDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL-GSEKDKRKEMADKEER
Query: TKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
TKKSLSINEFLRPA+GERH PGGRGRGRGRGSRGGY GS +SNVAAPSI DPGQFPTLGAK
Subjt: TKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23523 RGG repeats nuclear RNA binding protein A | 9.2e-73 | 55.38 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
M TLNPFDLL DDDAEDPSQL AVA + K K Q LP+ LPSKPLPPAQAVRE+R++ RG GGGRG G+ RGR G
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSTNNENIN-----APEDGVGGKTSERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
G+NRD NN + E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ EG +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E
Subjt: GFNRDSTNNENIN-----APEDGVGGKTSERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
Query: F-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
AE ETEK+VG EKP +D + N E+ E E EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+KAL +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKL
Subjt: F-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS---NVAAPSIGDPGQFPTLGAK
GS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PA+G + G GRGRG RGG S N AAP+IGD QFP+LG K
Subjt: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS---NVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| O23593 RGG repeats nuclear RNA binding protein B | 2.3e-63 | 49.22 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M ++NPFDLL DDDAEDPSQ++A+K PL AP QT K +P+KP PP+QAVRE+RN G GRG GRG YGRG GG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGG---KTSERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGET
NRDS NN+ A E+G GG ++ E G GGP G RG RRG + N G+ + ERPR+ ++RHS T GNE KR+G+GR NWG + D+ V E+
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGG---KTSERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGET
Query: VNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
+KN+ EK E + + E PA++ +E +PEDKEMTLEEYEK+LE+K+KAL A K EERKVD K F +MQQLSSKK NND +FIKLG+EKDKR
Subjt: VNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
Query: EMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
+ ++EE+T+KSLSINEFL+PADG+ + P GGR GR G R G + P+IGD QFPTLG
Subjt: EMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
|
|
| Q9LVT8 RGG repeats nuclear RNA binding protein C | 2.6e-59 | 50.53 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M +LNPFDLLG DDAEDPSQL AVA + +KA A +P K A P+KP PP+QAVRESRN +GGRG GGRG G+ RGR GG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNE---NINAPEDGVGGKTSERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
+NRD+ NN+ N N G + + G GG R GG RRGG +GE + ERP R ++RHS TG G KR G GRGNWG + D+
Subjt: FNRDSTNNE---NINAPEDGVGGKTSERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
Query: VAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
+ E E EK+ EK ED+T E A+E + E E+ +EMTLEEYEK+LE+K+KAL A K EERKVD K F SMQQLS+KK+ + +IFIKL
Subjt: VAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
GS+K+KRK D E+ KKSLSINEFL+PADG+R+ GG RGR GRG RG G + AAP+IGD QFP+LG
Subjt: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
|
|
| Q9SQ56 RGG repeats nuclear RNA binding protein A (Fragment) | 3.7e-66 | 58.55 | Show/hide |
Query: GGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSTNNEN-----------INAPEDGVGGKTSERR-GYGGPRG--RGGRRGGFNDGEGA--EGERPRRAFERHSG
GGRG RGGGRG G GRGR GFN++S ++EN EDG GK SERR GYGGPRG GGRRGGFN+G+ A EGERPRR F+R SG
Subjt: GGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSTNNEN-----------INAPEDGVGGKTSERR-GYGGPRG--RGGRRGGFNDGEGA--EGERPRRAFERHSG
Query: TGRGNEF-KREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVD
TGRGNE+ KREGSGRGNWG D+ A+ VN+ EK V EK +++ N ++ A EP+E EPE+KEMTLEEYEKL+E+KRKALLALK EERKV+
Subjt: TGRGNEF-KREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVD
Query: -PKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSN--VAAPSIGDPGQFPT
KE SMQ LS+KK++++IFIKLGSEK+KRKE +K +T+ SINEFL+PA+GE + GGRGRG GRG RGG+ G N +APSI D GQFP+
Subjt: -PKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMSN--VAAPSIGDPGQFPT
Query: LGAK
L AK
Subjt: LGAK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G16830.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 6.5e-74 | 55.38 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
M TLNPFDLL DDDAEDPSQL AVA + K K Q LP+ LPSKPLPPAQAVRE+R++ RG GGGRG G+ RGR G
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSTNNENIN-----APEDGVGGKTSERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
G+NRD NN + E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ EG +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E
Subjt: GFNRDSTNNENIN-----APEDGVGGKTSERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
Query: F-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
AE ETEK+VG EKP +D + N E+ E E EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+KAL +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKL
Subjt: F-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS---NVAAPSIGDPGQFPTLGAK
GS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PA+G + G GRGRG RGG S N AAP+IGD QFP+LG K
Subjt: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS---NVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G16830.2 Hyaluronan / mRNA binding family | 2.2e-53 | 60 | Show/hide |
Query: GAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEF-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLED
G +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E AE ETEK+VG EKP +D + N E+ E E EPEDKEMTL+EYEK+LE+
Subjt: GAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEF-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLED
Query: KRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS--
K+KAL +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKLGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PA+G + G GRGRG RGG S
Subjt: KRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS--
Query: -NVAAPSIGDPGQFPTLGAK
N AAP+IGD QFP+LG K
Subjt: -NVAAPSIGDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G16830.3 Hyaluronan / mRNA binding family | 2.4e-60 | 55.27 | Show/hide |
Query: VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSTNNENIN-----APEDGVGGKTSERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGEGAEGERP
VRE+R++ RG GGGRG G+ RGR GG+NRD NN + E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ EG +GERP
Subjt: VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSTNNENIN-----APEDGVGGKTSERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGEGAEGERP
Query: RRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEF-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLA
RRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E AE ETEK+VG EKP +D + N E+ E E EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+KAL +
Subjt: RRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEF-AEVAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLA
Query: LKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS---NVAAPS
L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKLGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PA+G + G GRGRG RGG S N AAP+
Subjt: LKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGRGRGSRGGYSGSPMS---NVAAPS
Query: IGDPGQFPTLGAK
IGD QFP+LG K
Subjt: IGDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G17520.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.6e-64 | 49.22 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M ++NPFDLL DDDAEDPSQ++A+K PL AP QT K +P+KP PP+QAVRE+RN G GRG GRG YGRG GG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNENINAPEDGVGG---KTSERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGET
NRDS NN+ A E+G GG ++ E G GGP G RG RRG + N G+ + ERPR+ ++RHS T GNE KR+G+GR NWG + D+ V E+
Subjt: FNRDSTNNENINAPEDGVGG---KTSERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAGET
Query: VNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
+KN+ EK E + + E PA++ +E +PEDKEMTLEEYEK+LE+K+KAL A K EERKVD K F +MQQLSSKK NND +FIKLG+EKDKR
Subjt: VNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
Query: EMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
+ ++EE+T+KSLSINEFL+PADG+ + P GGR GR G R G + P+IGD QFPTLG
Subjt: EMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
|
|
| AT5G47210.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.8e-60 | 50.53 | Show/hide |
Query: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M +LNPFDLLG DDAEDPSQL AVA + +KA A +P K A P+KP PP+QAVRESRN +GGRG GGRG G+ RGR GG
Subjt: MTTLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKAPAQTKPLPSGAQLNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSTNNE---NINAPEDGVGGKTSERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
+NRD+ NN+ N N G + + G GG R GG RRGG +GE + ERP R ++RHS TG G KR G GRGNWG + D+
Subjt: FNRDSTNNE---NINAPEDGVGGKTSERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGEGAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
Query: VAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
+ E E EK+ EK ED+T E A+E + E E+ +EMTLEEYEK+LE+K+KAL A K EERKVD K F SMQQLS+KK+ + +IFIKL
Subjt: VAGETVNETEKNVGDEKPIQEDDTSGVNTENPAKEPQETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKALLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
GS+K+KRK D E+ KKSLSINEFL+PADG+R+ GG RGR GRG RG G + AAP+IGD QFP+LG
Subjt: GSEKDKRKEMADKEERTKKSLSINEFLRPADGERHCAPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSPMSNVAAPSIGDPGQFPTLG
|
|
