; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G11400 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G11400
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionglucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like
Genome locationChr6:10091847..10094723
RNA-Seq ExpressionCSPI06G11400
SyntenyCSPI06G11400
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044965 - Glycoside hydrolase family 17, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0054595.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-8392.05Show/hide
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XP_011656992.1 major pollen allergen Ole e 10 isoform X2 [Cucumis sativus]2.4e-9898.92Show/hide
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XP_038900832.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.5e-8488.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDA3 X8 domain-containing protein1.2e-9898.92Show/hide
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A0A1S4E1R5 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like2.2e-8991.89Show/hide
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A0A5A7ULQ0 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like6.2e-8492.05Show/hide
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A0A6J1FWZ7 major pollen allergen Ole e 10-like7.1e-7279.68Show/hide
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A0A6J1JFA6 major pollen allergen Ole e 10-like1.4e-7280.21Show/hide
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        WCIA+  ASQAALQLALDYACG+GGADCS+IQ GG CYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPS+G+CEYPST
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 11.5e-1851.11Show/hide
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        ++CIA        LQ ALD+ACG G ++CS IQ G +CY PN+V+ HAS+AFNSYYQK      SC+F G A+IT+T+PS G+C +P ++
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Q84V39 Major pollen allergen Ole e 102.6e-1841.73Show/hide
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        T  +P  P+  P  S P + SP        P     G   WC+    A+ A LQ  +DY C   G DC  IQ  G C+NPN+VR HASYA NS+YQ K  
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Query:  LPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPS
            C+F GT  ITS++PS G+C + S
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Q9M069 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 72.2e-1747.06Show/hide
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        ++ S TPS  ++  S WC+  + A+   LQ +LD+ACG  G DC +IQ GG C+ PN+V  HA+YA N Y+QK+P  P  C+F  TA +TS NPS   C 
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Query:  YP
        YP
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Q9M2K6 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 52.3e-1950.56Show/hide
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Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 34.8e-1747.19Show/hide
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        ++CIA +   +  LQ ALD+ACG G  DCS++  G +CY P+ V  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+T+PS GTC +P +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.1e-2947.53Show/hide
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        +T   I  P+TT+P          TI  PT+      P+ NP +  P T          P +  P  + S ++S G SWC+A   ASQ +LQ ALDYACG
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        I  ADCS +Q GGNCY+P S++ HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +TNPSTG+C Y
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.3e-2962.64Show/hide
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        G   WCIA  +AS  +LQ+ALDYACG GGADC  IQ G  CY PN++RDHAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TST+PS G+C + S+
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AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.1e-3756.83Show/hide
Query:  QKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHAS
        +KDITTP+ T PT   PT  + N  S      +  +T PS        G  SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACGIGGADCS IQ GGNCYNPNS+R HAS
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Query:  YAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPST
        +AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S +PS G+C +PST
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein7.6e-3456.92Show/hide
Query:  QKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHAS
        +KDITTP+ T PT   PT  + N  S      +  +T PS        G  SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACGIGGADCS IQ GGNCYNPNS+R HAS
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Query:  YAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPS
        +AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S +PS
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AT5G55180.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein5.1e-2248.28Show/hide
Query:  PASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPL-PNSCNFGGTA
        P + N + V P    PS         G +WC+A+   ++  LQ  LDYACG GGADC  IQ G  CYNP S+  HASYAFNSYYQKN     +CNFGG A
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Query:  VITSTNPSTGTCEYPS
         + S  P  G CE+P+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGGAGGTTCGTTTGTAGCACTCTAATTCTATTCCTATTCATTCACTGGTTTTGCCCAGGTTCATCAAGGGCAGATCCTACACAAAAACAGGGGAAGCAATTCAG
AGCAGCATCAAGAAAATCTTCTTCAACTCAAAAGGACATCACGACCCCAATAACAACAGTCCCAACAATCAACATCCCAACCATCCCCATCATAAACCCTGCCAGTTCCA
ACCCCGATACCGTCTCCCCAGCCATGACGACCCCAAGCTTTACACCGTCAACCACCATCAGCGGTGGCTCCAGCTGGTGCATTGCGAGTCAGAGTGCGTCGCAGGCGGCG
CTGCAATTAGCTTTGGACTATGCGTGTGGCATAGGAGGCGCCGATTGCTCGTCGATTCAAGGCGGAGGAAACTGCTATAATCCTAATTCGGTTCGAGACCATGCTTCTTA
CGCGTTCAATAGCTATTATCAGAAGAATCCGCTTCCGAATAGCTGTAATTTTGGAGGCACTGCCGTGATTACTAGCACCAATCCCAGCACTGGCACGTGCGAGTACCCAT
CAACAAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTTTCCTAACCTCTTCCCCCTCTCTCCTTTTCTCCATCTTCCATTGCCTTGCACTTTCAAAATCATCCACTCAACTCTCTCCCTATTCCCATATTAAATAAAATCTTT
ACTGTCGTTTCAAATGTTCTCTCACTCTCACCCCATCAAGTTCCAAAAACCCCCTGTCTTTCATCTTCACTACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTGTGTTTCAATC
CCACACATACCCAACTCTAGAATTCCGATCAACAACCGGCCAAGTTCCGCCAACAAGTCCTCAGAGGAAAGATTTTGACGGAGGAACAAAGAGAGTTTCTTCAAATGGAT
GGGAGGTTCGTTTGTAGCACTCTAATTCTATTCCTATTCATTCACTGGTTTTGCCCAGGTTCATCAAGGGCAGATCCTACACAAAAACAGGGGAAGCAATTCAGAGCAGC
ATCAAGAAAATCTTCTTCAACTCAAAAGGACATCACGACCCCAATAACAACAGTCCCAACAATCAACATCCCAACCATCCCCATCATAAACCCTGCCAGTTCCAACCCCG
ATACCGTCTCCCCAGCCATGACGACCCCAAGCTTTACACCGTCAACCACCATCAGCGGTGGCTCCAGCTGGTGCATTGCGAGTCAGAGTGCGTCGCAGGCGGCGCTGCAA
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CAATAGCTATTATCAGAAGAATCCGCTTCCGAATAGCTGTAATTTTGGAGGCACTGCCGTGATTACTAGCACCAATCCCAGCACTGGCACGTGCGAGTACCCATCAACAA
GGTGAACCCCTACAACCAATTAATATAAAGCACAAGTTCATCTGTTTTGAACACTACAAATTCAAGTGGCTCCACCGTGTTCGGCGCCGTTCCTTCCGGCCCTTCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCATCGGCACTCATTTTTCCTTCTACCCAATATTTTTCCTTATTTACAAATTTTCTTCTTTTTATTGCTTTCTAAAAACTTCTCCCTAATTTCTAA
TTTCTCTCCACCATTTTGTAAATTGGGTTTTTTTTGTTCTTTTACACCACAAAAATAACTCCACACATTATATTCTAAGTCCATACCACAAACACACAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGRFVCSTLILFLFIHWFCPGSSRADPTQKQGKQFRAASRKSSSTQKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAA
LQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTR