; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G12220 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G12220
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionhistone deacetylase HDT1-like
Genome locationChr6:10723841..10726922
RNA-Seq ExpressionCSPI06G12220
SyntenyCSPI06G12220
Gene Ontology termsGO:0005730 - nucleolus (cellular component)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR041232 - Nucleoplasmin-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646904.1 hypothetical protein Csa_020859 [Cucumis sativus]1.7e-13090.6Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSG              
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES
                 +SDS SEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGD  NSDE+DDDSES
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES

Query:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK
        DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK
Subjt:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK

XP_004145780.1 histone deacetylase HDT1 isoform X2 [Cucumis sativus]2.6e-13491.45Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV          C+
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLT------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED
                   DGYLDSDS SEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGD  NSDE+
Subjt:  FLLT------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED

Query:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK
        DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK
Subjt:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK

Query:  HGGK
        HGGK
Subjt:  HGGK

XP_008458629.1 PREDICTED: histone deacetylase HDT1-like [Cucumis melo]1.2e-12385.2Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKK+KA+ENVTIFLKIGDQKLVLGILS EKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV          C+
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLT------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED
                   DGYLDSD+GS+DEELPL SA NGKPS K VKPGLVESN+AKKASLKKPLKPSKD+D+ SEDDESD DEDSDDESDEEML+GD  +SDE+
Subjt:  FLLT------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED

Query:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK
        DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTP+PAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSF SD ALQSHSKAK
Subjt:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK

Query:  HGGK
        HG K
Subjt:  HGGK

XP_011657054.1 histone deacetylase HDT1 isoform X1 [Cucumis sativus]6.7e-13591.48Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV          C+
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLT-------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDE
                   TDGYLDSDS SEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGD  NSDE
Subjt:  FLLT-------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDE

Query:  DDDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKA
        +DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKA
Subjt:  DDDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKA

Query:  KHGGK
        KHGGK
Subjt:  KHGGK

XP_023513047.1 histone deacetylase HDT1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-10676.9Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVK+G+ L+VKPG +K +HLSQATLGEIKK+KANENVTIFLKIGDQKLVLGILS EKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKD-DDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDD
             DGY DSDSGSEDEEL L  A NGKPS K  K    +SN AK ASLK    KPL+PSKD DDE  +DDESD DEDSDDESDEEML+ DG +SD++D
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKD-DDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDD

Query:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH
        DDS+SDEETPKK+E  KKR NESATK+TP+PAKKAKLA+P KTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLE+PKSGGQFSCKSCDR+FGSD ALQSHSKAKH
Subjt:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH

Query:  GGK
        GGK
Subjt:  GGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KB05 Histone deacetylase 2a5.7e-14898.66Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES
        FLLTTDGYLDSDS SEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGD  NSDE+DDDSES
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES

Query:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK
        DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK
Subjt:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK

A0A1S3C9I8 histone deacetylase HDT1-like5.7e-12485.2Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKK+KA+ENVTIFLKIGDQKLVLGILS EKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV          C+
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLT------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED
                   DGYLDSD+GS+DEELPL SA NGKPS K VKPGLVESN+AKKASLKKPLKPSKD+D+ SEDDESD DEDSDDESDEEML+GD  +SDE+
Subjt:  FLLT------TDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED

Query:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK
        DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTP+PAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSF SD ALQSHSKAK
Subjt:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK

Query:  HGGK
        HG K
Subjt:  HGGK

A0A6J1FU30 histone deacetylase HDT1-like1.9e-10676.9Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVK+G+ L+VKPG +K +HLSQATLGEIKK+KANENVTIFLKIGDQKLVLGILS EKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKD-DDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDD
             DGY DSDSGSEDEEL L  A NGKPS K  K    +SN AK ASLK    KPL+PSKD DDE  +DDESD DEDSDDESDEEML+ D  +SD++D
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKD-DDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDD

Query:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH
        DDS+SDEETPKK+E  KKR NESATKTTP+PAKKAKLA+P KTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLE+PKSGGQFSCKSCDR+FGSD ALQSHSKAKH
Subjt:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH

Query:  GGK
        GGK
Subjt:  GGK

A0A6J1H225 histone deacetylase HDT1-like3.2e-9873.68Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVK GQSL+VKPG ++ +HLSQATLGE KK+KANENVTIFLKIG QKLVLGILS EKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGK GSV       +   +
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTD--GYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED
        +    D   Y DSDSGSEDEEL L  A NGK + K  K    +SN AK  SLK    KPLKPSKD+D+  +DDESD DED DDESDEEML+ D S+SD++
Subjt:  FLLTTD--GYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDED

Query:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK
        DDD+ESDEETPKKVE  KKR NESA+KTTP+PAKKAKLA+PEKTDSKKGGHTATPHP KK  KTP AK ETPKSGGQFSCKSCDRSFGSD ALQSHSKAK
Subjt:  DDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAK

Query:  HGGK
        HGGK
Subjt:  HGGK

A0A6J1JAV1 histone deacetylase HDT1-like3.5e-10576.24Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVK+G+ L+VKPG +K +HLSQATLGEIKK+KANENVTIFLKIG QKLVLGILS EKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSV            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKD-DDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDD
             DGY DSDSGSEDEEL L  A NGKPS K  K    +SN AK ASLK    KPL+PSKD DDE  EDDESD D+DSDDESDEEML+ D  +SD++D
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLK----KPLKPSKD-DDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDD

Query:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH
        DDS+SDEETPKK+E  KKR NESATKTTP+PAKKAKLA+P KTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTP AKLE+PKSGGQFSCKSCDR+FGSD ALQSHSKAKH
Subjt:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH

Query:  GGK
        GGK
Subjt:  GGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24591 Histone deacetylase HDT14.3e-4446.45Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWG+EVK G ++  +PG   ++HLSQA LGE KK   ++N  +++KI DQKL +G LS +K P + FDL+F+KEFELSH  K+ SV    T   +   
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPL-VSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEML--DGDGSNSDEDD--
        F    +  +D DS  EDEEL + V   NGK   K  K    E   A  +      K SKDDD+  ED+  D DED  D+SDE +   +GD  +SDEDD  
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPL-VSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEML--DGDGSNSDEDD--

Query:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATP--EKTDSKKGG--HTATPHPAK-----KTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVA
        DD E D  TPKK E  KKR  ES+   TP+  KKAK+ATP  +KT  KKG   H ATPHPAK        K+  +    PKSGG   CK C +SF S+ A
Subjt:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATP--EKTDSKKGG--HTATPHPAK-----KTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVA

Query:  LQSHSKAKHG
        LQ+HS+AK G
Subjt:  LQSHSKAKHG

Q6V9I6 Histone deacetylase HDT18.7e-5349.16Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWG EVK+G+ L V+PG+  ++HLSQA+LGE+KK+K +E+V + + I  +KLVLG L+ EK PQ  FDLVF+++FELSHN KSGSV         T  
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDD-DEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSE
        F    D   + D    DE++PL  A +GKP PK         + A      + ++P+KDD DE S+DD+SD  ED DD  D                   
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDD-DEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSE

Query:  SDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKK-GGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH
        S+EETPKK E AK+R  +SATK TPV  KKAKL TP+KTD KK GGH ATPHP+K+  K       TPKS G   CK C+RSFGS+ AL SHSKAKH
Subjt:  SDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKK-GGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH

Q8LJS2 Histone deacetylase HDT14.2e-5551.47Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGN--EKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLT
        MEFWGVEVK GQ++ V P +  +  IH+SQ  LGE KK+K NE V ++LK+G+QK+VLG LS +  P LS DLV + + ELSH  KS SV          
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGN--EKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLT

Query:  CSFLLTT--DGYLD-SDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPK--GVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDE
        C + + T  D   D SDS  EDEEL L    NGKP  K  G K      +  K  +  K   P KD+D+DS DDESD D   +DES       D SNS+E
Subjt:  CSFLLTT--DGYLD-SDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPK--GVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDE

Query:  DDDDSESDEETP-KKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTP-AAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHS
        + D    DEETP KKV+  KKR NESA K TP+ AKKAK ATPEKTD KK  H ATPHP+KK GKTP + K +TP S GQ SC SC +SF ++  LQ H 
Subjt:  DDDDSESDEETP-KKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTP-AAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHS

Query:  KAKHGGK
        KAKHGG+
Subjt:  KAKHGGK

Q9M4U4 Histone deacetylase HDT31.9e-4446.79Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWG+EVK G ++  +PG   ++HLSQA LGE KK   ++N  +++KI DQKL +G LS +K P + FDL+F+KEFELSH  K+ SV    T   +   
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSA-PNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEML--DGDGSNSDEDD--
        F    +  +D DS  EDEEL + +   NGK   K  K    E   A  +      K SKDDD+  ED+  D DED  D+SDE +   +GD  +SDEDD  
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSA-PNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEML--DGDGSNSDEDD--

Query:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATP--EKTDSKKGG--HTATPHPAK-----KTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVA
        DD E D  TPKK E  KKR  ES+   TP+  KKAK+ATP  +KT  KKG   H ATPHPAK        K+  +    PKSG    CKSC +SF S+ A
Subjt:  DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATP--EKTDSKKGG--HTATPHPAK-----KTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVA

Query:  LQSHSKAKHGGK
         Q+HSKAKHGGK
Subjt:  LQSHSKAKHGGK

Q9M4U5 Histone deacetylase HDT22.7e-4648.89Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWG+EVK G ++  +PG+  ++H+SQA LGE KK   +++  +++K+ D+KL +G LS +K+PQ+ FDLVF KEFELSH  K+ SV      V     
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPL-VSAPNGKPSPKGVKPGLVE--SNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDES-DGDEDSDDESDE-EML---DGDGSNSD
                +D DS  E+EEL + V   NGK   K  +    +  +  A K+SL    K SKDD +DS++DES D DED  D+SDE E L   +GD  +SD
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPL-VSAPNGKPSPKGVKPGLVE--SNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDES-DGDEDSDDESDE-EML---DGDGSNSD

Query:  EDD--DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATP--EKTDSKKGG-HTATPHPAKKTGKTPA--AKL--ETPKSGGQFSCKSCDRSFGS
        EDD  DD E +  TPKK E+ KKR  E+A K TP+  KKAK+ATP  +KT  KKG  H ATPHPAK  GKTPA   KL  ++PKSGG   CKSC ++F S
Subjt:  EDD--DDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATP--EKTDSKKGG-HTATPHPAKKTGKTPA--AKL--ETPKSGGQFSCKSCDRSFGS

Query:  DVALQSHSKAKHGGK
        ++ALQ+HSKAKHG K
Subjt:  DVALQSHSKAKHGGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G44750.1 histone deacetylase 32.6e-3643.24Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWG+EVK+G+ + V P    LIH+SQA+LGE K +K  E V + +K+G+Q LVLG LS E  PQL  DLVF+KEFELSH    GSV            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES
        F+      ++    SE+EE      P G  +    KP       AK A     +KP+ DD+E              DESD + +D D    D D +DSE 
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES

Query:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-TPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH
        +E TPKK  S+KKR NE+  K  PV AKKAK+A TP+KTD KK G           GK   A  ++PKS  Q SC SC ++F S  AL+SH+KAKH
Subjt:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-TPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH

AT3G44750.2 histone deacetylase 32.6e-3643.92Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWG+EVK+G+ + V P    LIH+SQA+LGE K +K  E V + +K+G+Q LVLG LS E  PQL  DLVF+KEFELSH    GSV      V     
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES
          +   GY    S  E+EE+P  +A      PK           AK A     +KP+ DD+E              DESD + +D D    D D +DSE 
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSES

Query:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-TPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH
        +E TPKK  S+KKR NE+  K  PV AKKAK+A TP+KTD KK G           GK   A  ++PKS  Q SC SC ++F S  AL+SH+KAKH
Subjt:  DEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-TPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKH

AT5G03740.1 histone deacetylase 2C4.9e-4340.95Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGVEVK G+ L + PG ++L+H+SQ  LGE  K    E + +++ +G  KL++G LS EKFPQLS ++V E+ F LSH  K+GSV            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEEL--PLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKP---LKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEE------MLDGDGS
              GY    S  E E+L    + A   K +PK           AK+ + + P   +K  +DDD D  +++S  D+DS++  DEE        D +  
Subjt:  FLLTTDGYLDSDSGSEDEEL--PLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKP---LKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEE------MLDGDGS

Query:  NSDEDDDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGG-HTATPHPAKKTGKT--------PAAKLETPKSGGQFSCKSCDRS
        +S +D++D  S+EETPKK E  KKR  E  +   P   KKAK  TP+KTDSKK   H ATPHP+K+ GK          + + +TPKS G F CKSC R+
Subjt:  NSDEDDDDSESDEETPKKVESAKKRLNESATKTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGG-HTATPHPAKKTGKT--------PAAKLETPKSGGQFSCKSCDRS

Query:  FGSDVALQSHSKAKH
        F S++ LQSH+KAKH
Subjt:  FGSDVALQSHSKAKH

AT5G22650.1 histone deacetylase 2B7.6e-3643.1Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGV V    +  V P  + L+H+SQA+L      K+ E+V + + +G  KLV+G LS +KFPQ+SFDLVF+KEFELSH+G   +V            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSD--SGSEDEELP-LVSAP-------NGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSN
        F+      ++ D  + S+DE++P  V AP       NG      VK        AK A +K   +  + D+ED  DDE + +ED D E   ++ + D  +
Subjt:  FLLTTDGYLDSD--SGSEDEELP-LVSAP-------NGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSN

Query:  SDEDDDDSESDEETPKKVESA-KKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-----TPEKT-DSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFS
         +E+D + E +EETPKK E   KKR NES +K TPV  KKAK A     TP+KT + KKGGHTATPHPAKK GK+P    ++PKSGGQ S
Subjt:  SDEDDDDSESDEETPKKVESA-KKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-----TPEKT-DSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFS

AT5G22650.2 histone deacetylase 2B3.1e-3743.25Show/hide
Query:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS
        MEFWGV V    +  V P  + L+H+SQA+L      K+ E+V + + +G  KLV+G LS +KFPQ+SFDLVF+KEFELSH+G   +V            
Subjt:  MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCS

Query:  FLLTTDGYLDSD--SGSEDEELP-LVSAP-------NGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSN
        F+      ++ D  + S+DE++P  V AP       NG      VK        AK A +K   +  + D+ED  DDE + +ED D E   ++ + D  +
Subjt:  FLLTTDGYLDSD--SGSEDEELP-LVSAP-------NGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSN

Query:  SDEDDDDSESDEETPKKVESA-KKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-----TPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFS
         +E+D + E +EETPKK E   KKR NES +K TPV  KKAK A     TP+KT+ KKGGHTATPHPAKK GK+P    ++PKSGGQ S
Subjt:  SDEDDDDSESDEETPKKVESA-KKRLNESATKTTPVPAKKAKLA-----TPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTTTGGGGTGTTGAAGTCAAGGCTGGTCAGTCACTTATTGTGAAACCTGGAAATGAGAAATTGATTCATCTATCACAGGCAACACTAGGTGAAATAAAGAAGGA
AAAAGCAAATGAAAATGTGACTATTTTTTTGAAAATTGGTGACCAGAAGCTTGTTTTGGGTATTCTCTCTGGAGAGAAGTTTCCTCAGCTCTCATTTGATCTTGTGTTTG
AGAAGGAATTTGAGCTTTCCCACAATGGGAAGAGTGGAAGTGTTAGTTTGCAACTTACATTGGTTTCCTTGACCTGCTCTTTTCTCCTTACCACGGATGGTTATCTTGAT
TCTGATTCTGGCTCGGAAGATGAAGAACTTCCCTTGGTCTCTGCTCCAAACGGAAAACCAAGCCCGAAGGGGGTGAAGCCTGGTTTGGTTGAAAGTAATGATGCAAAGAA
AGCTTCTCTGAAGAAGCCTTTGAAACCAAGCAAGGATGACGATGAAGATTCTGAGGATGATGAATCTGATGGTGATGAAGATTCAGATGACGAATCTGATGAGGAAATGC
TTGACGGAGATGGTAGCAATTCTGATGAAGATGATGATGACTCTGAAAGTGATGAGGAGACGCCAAAGAAGGTTGAATCAGCCAAGAAGAGGTTGAATGAGTCTGCCACC
AAGACTACACCCGTTCCTGCTAAGAAGGCAAAGTTAGCTACGCCTGAAAAGACTGATTCAAAAAAGGGGGGCCATACGGCTACTCCTCATCCAGCCAAAAAAACTGGTAA
AACTCCTGCTGCTAAGTTGGAGACCCCAAAATCTGGTGGCCAGTTCTCTTGCAAATCCTGTGACAGGTCGTTTGGTTCCGATGTTGCACTTCAGTCACACAGTAAAGCTA
AGCATGGGGGTAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTTTTGGGGTGTTGAAGTCAAGGCTGGTCAGTCACTTATTGTGAAACCTGGAAATGAGAAATTGATTCATCTATCACAGGCAACACTAGGTGAAATAAAGAAGGA
AAAAGCAAATGAAAATGTGACTATTTTTTTGAAAATTGGTGACCAGAAGCTTGTTTTGGGTATTCTCTCTGGAGAGAAGTTTCCTCAGCTCTCATTTGATCTTGTGTTTG
AGAAGGAATTTGAGCTTTCCCACAATGGGAAGAGTGGAAGTGTTAGTTTGCAACTTACATTGGTTTCCTTGACCTGCTCTTTTCTCCTTACCACGGATGGTTATCTTGAT
TCTGATTCTGGCTCGGAAGATGAAGAACTTCCCTTGGTCTCTGCTCCAAACGGAAAACCAAGCCCGAAGGGGGTGAAGCCTGGTTTGGTTGAAAGTAATGATGCAAAGAA
AGCTTCTCTGAAGAAGCCTTTGAAACCAAGCAAGGATGACGATGAAGATTCTGAGGATGATGAATCTGATGGTGATGAAGATTCAGATGACGAATCTGATGAGGAAATGC
TTGACGGAGATGGTAGCAATTCTGATGAAGATGATGATGACTCTGAAAGTGATGAGGAGACGCCAAAGAAGGTTGAATCAGCCAAGAAGAGGTTGAATGAGTCTGCCACC
AAGACTACACCCGTTCCTGCTAAGAAGGCAAAGTTAGCTACGCCTGAAAAGACTGATTCAAAAAAGGGGGGCCATACGGCTACTCCTCATCCAGCCAAAAAAACTGGTAA
AACTCCTGCTGCTAAGTTGGAGACCCCAAAATCTGGTGGCCAGTTCTCTTGCAAATCCTGTGACAGGTCGTTTGGTTCCGATGTTGCACTTCAGTCACACAGTAAAGCTA
AGCATGGGGGTAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEFWGVEVKAGQSLIVKPGNEKLIHLSQATLGEIKKEKANENVTIFLKIGDQKLVLGILSGEKFPQLSFDLVFEKEFELSHNGKSGSVSLQLTLVSLTCSFLLTTDGYLD
SDSGSEDEELPLVSAPNGKPSPKGVKPGLVESNDAKKASLKKPLKPSKDDDEDSEDDESDGDEDSDDESDEEMLDGDGSNSDEDDDDSESDEETPKKVESAKKRLNESAT
KTTPVPAKKAKLATPEKTDSKKGGHTATPHPAKKTGKTPAAKLETPKSGGQFSCKSCDRSFGSDVALQSHSKAKHGGK