; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G13410 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G13410
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like
Genome locationChr6:11912618..11914257
RNA-Seq ExpressionCSPI06G13410
SyntenyCSPI06G13410
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022947015.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita moschata]1.7e-9981.05Show/hide
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XP_022970795.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita maxima]2.0e-10080.48Show/hide
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XP_038900371.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]3.9e-10988.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF76 Uncharacterized protein5.5e-12599.59Show/hide
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A0A1S3C4A9 protodermal factor 1-like9.4e-11794.19Show/hide
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A0A5A7UHX0 Protodermal factor 1-like9.4e-11794.19Show/hide
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A0A6J1G5M6 protodermal factor 1-like8.0e-10081.05Show/hide
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A0A6J1I3W1 protodermal factor 1-like9.4e-10180.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S728 Protodermal factor 11.7e-4646.86Show/hide
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           G  P       H STP+  TPS+PPS  GGYY+ P        +PPS  VDPGTP    +P TP + P TP TP IP     I  TC YW NHP LI
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 11.2e-4746.86Show/hide
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        VS  V+ L A LLSQ L   V S    D K+YY SPP    G+PPS                  + S P PPSH                          
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Query:  -GSGGTP-------HYSTPTPSTPSNPPSGGGGYYNPPSSGG----SPPSTPVDPGTP---STPSTPSV-PSTPTTPTIPT----IPFTCTYWLNHPGLI
           G  P       H STP+  TPS+PPS  GGYY+ P        +PPS  VDPGTP    +P TP + P TP TP IP     I  TC YW NHP LI
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Query:  KPR
        KPR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAAGCAAACAAGTTTCTGCTCTCGTTTTCACTTTGCTTGCTGGGCTGCTTTCTCAAAGCCTACTCATCCCTGTATTGTCCACCTCCATTGCTGATCAGAAAAGCTA
CTACTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGATCTCCTCCATCAGGTTCACATAGCAGCCCTATGCCACCATCACATGGTAGTGGAGGAACGCCACATTACTCCACACCAACTC
CTTCCACACCATCAAATCCGCCGTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCGTCTTCTGGTGGTAGCCCACCAAGCACCCCTGTAGATCCAGGCACTCCTAGCACTCCA
AGCACTCCTAGTGTTCCTAGCACACCAACCACACCTACCATTCCCACTATTCCATTTACCTGCACTTATTGGCTGAATCATCCAGGATTGATATGGGGAGTATTGGGATG
GTGGGGAACATTAGGAAATGCCTTCGGAGCAACCAATGTCCCAGGGTTTGGAACAAATCTCAACTTGCTCCAAGCACTATCTAACACAAGGAATGATGGGTATGGGGCTC
TTTTGAGAGAAGGAACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCTAGTAACAGATTCCCCTACACAACTAAGCAAGTTAGGACAAGTTTCGTCTCGGCACTCAGCTCCAACAAA
GCAGCAGGCAGTCAGGCCAACACGTTCAAGTTAGCCAACGAGGGCAAAATTAAACCCAGAGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAAATAATCATTCTGAAAATATATAGACAGAAATGAACCAGAACCAAAATGGCCCAGAGTAGCATTACAATTTTGAATTATATATCATAATAGCTATACTATGGAGAC
TATATCTAATAAATTTATCAGGAGAAATGTGAGGTTCAAAATTTCAAAGGCATGCATGTGATTTCACCTCCCCCCCCCCAATGAATTCATCCCTGGAAAATTTGAACATT
ATTTGAAACAATTAAAAGCAGCAAGCAATATGAATAAATGCACCAATAAAACAGCAACTAACCACATACTCTTCCACCTGTAAGAAGTAACTTCACTTTCCCTCATCCCC
CCCTTCTATATATTCCCCCATTTGTTCTAAACATTCCATCCATCACCATTACCATTCCTTCCCTTCTTTCCCATCTCTAATCCCTTTGCTCCCAATCAGAAAAACAACCA
ACCGAAGAAACACAACCATGAGAAGCAAACAAGTTTCTGCTCTCGTTTTCACTTTGCTTGCTGGGCTGCTTTCTCAAAGCCTACTCATCCCTGTATTGTCCACCTCCATT
GCTGATCAGAAAAGCTACTACTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGATCTCCTCCATCAGGTTCACATAGCAGCCCTATGCCACCATCACATGGTAGTGGAGGAACGCCACA
TTACTCCACACCAACTCCTTCCACACCATCAAATCCGCCGTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCGTCTTCTGGTGGTAGCCCACCAAGCACCCCTGTAGATCCAG
GCACTCCTAGCACTCCAAGCACTCCTAGTGTTCCTAGCACACCAACCACACCTACCATTCCCACTATTCCATTTACCTGCACTTATTGGCTGAATCATCCAGGATTGATA
TGGGGAGTATTGGGATGGTGGGGAACATTAGGAAATGCCTTCGGAGCAACCAATGTCCCAGGGTTTGGAACAAATCTCAACTTGCTCCAAGCACTATCTAACACAAGGAA
TGATGGGTATGGGGCTCTTTTGAGAGAAGGAACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCTAGTAACAGATTCCCCTACACAACTAAGCAAGTTAGGACAAGTTTCGTCTCGG
CACTCAGCTCCAACAAAGCAGCAGGCAGTCAGGCCAACACGTTCAAGTTAGCCAACGAGGGCAAAATTAAACCCAGAGCTTGATTTCCCCCCTTTTTCCTACCATTTACC
ATCTTAATAACTAATGAGTGTGCCTTAGCAGTTAGTAGTGAGACAGTGAGACCAATTTACCATTGCATGTGTTTTGTTTTATTTTGTTTTTGTTTCTAGTTTCTTGCAAT
CTCTTTTGTTCATGTATTTGAACATAGAGATGCTCAGTCTTTGTTATCCAAATTCATTGTGAAATCAAGATTTGTTTCAAGTACTTAAATTTATTTAATCATATTATCCA
AAAGGGGGTTGAAAATTAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSKQVSALVFTLLAGLLSQSLLIPVLSTSIADQKSYYSPPDPHSGSPPSGSHSSPMPPSHGSGGTPHYSTPTPSTPSNPPSGGGGYYNPPSSGGSPPSTPVDPGTPSTP
STPSVPSTPTTPTIPTIPFTCTYWLNHPGLIWGVLGWWGTLGNAFGATNVPGFGTNLNLLQALSNTRNDGYGALLREGTASYLNSLASNRFPYTTKQVRTSFVSALSSNK
AAGSQANTFKLANEGKIKPRA