; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G15850 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G15850
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like
Genome locationChr6:14257936..14259342
RNA-Seq ExpressionCSPI06G15850
SyntenyCSPI06G15850
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008462695.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like [Cucumis melo]9.2e-21893.35Show/hide
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        S QI+EILKIKEEMEIKRSFESKLN   QSNSILGYPSTSQSSTNPSQ TRITSPDARRSVSEITG+SRFGH DDLYMNFNRK +NGESSDLES+VKQER
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XP_011659864.2 LOW QUALITY PROTEIN: E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like [Cucumis sativus]3.4e-16497.44Show/hide
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XP_022144841.1 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like [Momordica charantia]6.7e-17679Show/hide
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        TLKG+KEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCR+RVGSEDLKL ++SSSMR LLSN SELKQDSNIELFVQREEE++Q+Q
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            HGSSRFSIGRSFRKILK++K+ EMLI KA     DE MKNLHR NHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMI +ISS RFTS ETDIEQST P
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        RS Q EEILKIKEEMEIKRSF+SK + I+QSNS  IL +PSTS+S+  P QT RI SPD RRSVSEITG+SRF   DL + FN + + GE SDL +N KQ
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        ERMR+ WYPIAKRTVQWFANRETR Q AENR Q VE V
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XP_023531707.1 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-14668.25Show/hide
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        MIR +L  F  FSV F V+AQ  SQDAEN +FQP+LGFVIGILGVMF+LTF+LLVYAK+CH R+S+ V++ V H  QIRSS      GIDKTVIESLPFF
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        RFSTLKG+K GLECA+CLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLE+HA+CPLCR+ V SEDL+L +NSSSMRFL SNLSELKQDSNIELFVQREEEE 
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           QQQQ +HGS RFSIGRSFRK+LK+DKE EMLI K   DY+ D+ MKNLHRHNHKII+SDFVFMNRWSNVSSSD+MFLNKEMID+ISS RFTSLET +
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        E+STL RS + EE LK                         G+PSTS  S      RITS +ARRSVSEITGV+RFG  D++MNFNRK + GESS+LE+N
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        VK    R+ WYPIA++TVQWFANRE      + RQ  VE V
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XP_038878637.1 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like [Benincasa hispida]2.3e-20087.02Show/hide
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        MIR S  VFFLF VFFVVEAQ+DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMF+LTFILLVYAK+CHRR+S+  DDV HPRQIR+S RFSGIDKTVIESLPFFRFS
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        TLKG+KEGLECAVCLSKFEDIEILR+LPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCR+RVGSEDLKLLSNS+SMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEE  QQ
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        QQ+LHGSSRFSIGRSFRKILK+DKE EMLI KA G+ EDE MKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISS RFTS ETDIEQS+LP
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        RS QIEEILK+ EEMEIKRSF +SKLN I QS NSILG+PSTSQSSTNPSQ TRIT PDARRSVSEITG SRFG D  LY NFNRK ++GESSDL +NVK
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        QER R+IWYPIAKRTVQWFANRETRFQ AENRQQ VE V
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CHK3 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like4.5e-21893.35Show/hide
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        S QI+EILKIKEEMEIKRSFESKLN   QSNSILGYPSTSQSSTNPSQ TRITSPDARRSVSEITG+SRFGH DDLYMNFNRK +NGESSDLES+VKQER
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A0A5D3DZ48 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like4.5e-21893.35Show/hide
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A0A6J1CUL6 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like3.2e-17679Show/hide
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        M R SL  F LFSVFF VEAQ+D QD+ENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTF+LL+YAKFCHRR S+  D VNHP QIRSS R SGIDKTVIESLPFFRFS
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        RS Q EEILKIKEEMEIKRSF+SK + I+QSNS  IL +PSTS+S+  P QT RI SPD RRSVSEITG+SRF   DL + FN + + GE SDL +N KQ
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        ERMR+ WYPIAKRTVQWFANRETR Q AENR Q VE V
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A0A6J1EPJ8 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like5.9e-14667.65Show/hide
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Query:  IEQSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLES
        +E+STL RS + EE L+                         G+PSTS  S      RITS +ARRSVSEITGV+RFG  D++M FNR+ + GESS+LE+
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        NVK    R+ WYPIA++TVQWFANRE      + RQ  VE V
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A0A6J1KW64 E3 ubiquitin-protein ligase ATL42-like4.5e-14668.18Show/hide
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Query:  RFSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEEQ
        RFSTLKG+K+GLECA+CLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLE+HA+CPLCR+ V SEDL+L +NSSSMRFL SNLSELKQDSNIELFVQREEEE+
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Query:  ---QQQILHGSSRFSIGRSFRKILKNDKENEMLISKASGDYE-DEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIE
           QQQ +HGS RFSIGRSFRK+LK DKE EMLI K   DY+ D+ MKNLHRHNHKII+SDFVFMNRWSNVSSSD+MFLNKEMID+ISS RFT LET +E
Subjt:  ---QQQILHGSSRFSIGRSFRKILKNDKENEMLISKASGDYE-DEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIE

Query:  QSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESNV
        +STL RS + EE LK                         G+PSTS  S      RITS +ARRSVSEITGVSRFG  D++M FNRK + GESS+LE+NV
Subjt:  QSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESNV

Query:  KQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQIVEAV
        K    R+ WYPIA++TVQWFANRE      + RQ  VE V
Subjt:  KQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQIVEAV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5EAE9 RING-H2 finger protein ATL433.7e-3637.29Show/hide
Query:  SAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDDVNHPRQ---------------IRSSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVC
        S+  P +  VI +L   F LTF+LL+Y K C RR       VNHP++               +    + SGID++VIESLP FRF  L G K+GLECAVC
Subjt:  SAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDDVNHPRQ---------------IRSSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVC

Query:  LSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR---------------EEEEQQQ
        L++FE  E+LRLLPKCKHAFH+ C+D WL+ H++CPLCR RV  ED+ L+ + +S   L  +  E    +N    + R               E   +  
Subjt:  LSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR---------------EEEEQQQ

Query:  QILHGSSRFSIGRSFRKILK-----NDKENEMLISKASGDYEDEKMKN-----------LHRHNHKIIVSDFVFMN-RWSNVSSSDLMFLNKEMI
        +I   SS  S   SFR+ L      ND   E   S A    +  + K+             R  H+II+S     + RWS V  SDL++L  EMI
Subjt:  QILHGSSRFSIGRSFRKILK-----NDKENEMLISKASGDYEDEKMKN-----------LHRHNHKIIVSDFVFMN-RWSNVSSSDLMFLNKEMI

Q5XF85 E3 ubiquitin-protein ligase ATL423.9e-9449.88Show/hide
Query:  FQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCH-RRASISVDDVNHPRQIR----------SSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFED
        F+PSL  V G+L +MF LTF+LLVYAK CH    S S D   H R++R          SS RFSG+DKT IESLP FRFS LKG+K+GL+C+VCLSKFE 
Subjt:  FQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCH-RRASISVDDVNHPRQIR----------SSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFED

Query:  IEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVG-SEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEEQQ--QQILHGSSRFSIGRSFRKI
        +EILRLLPKC+HAFHI CID WLE+HA+CPLCR RV   ED  +L+N +S RFL  N SE+++DS++EL+++REEEE++  ++ L GSSRFSIG SFRKI
Subjt:  IEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVG-SEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEEQQ--QQILHGSSRFSIGRSFRKI

Query:  LKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIEQSTLPRSRQIEE--ILKIKEEMEI
        LK   + + L+ +   D +++K+  +H+ NH+I+VSD VF NRWSNVSSSDLMFLN EM+++ISS RF+SL+       + R  + ++  IL+IKEEME 
Subjt:  LKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIEQSTLPRSRQIEE--ILKIKEEMEI

Query:  KRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFG---HDDLYMNFNRKFKNGESSDLES------NVKQERMREIWYPIA
        KR  E+KL  +T       + S +  S + S++ +  P  RRSVS+IT V R     H D          +G +++  S      N  +ER R +W PIA
Subjt:  KRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFG---HDDLYMNFNRKFKNGESSDLES------NVKQERMREIWYPIA

Query:  KRTVQWFANRETRFQTAENRQ
        ++T QWFANRE R Q     Q
Subjt:  KRTVQWFANRETRFQTAENRQ

Q9LF64 RING-H2 finger protein ATL523.6e-2335.76Show/hide
Query:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD---VNHPRQ--IRSSPRFS----GIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAV
        D   + +S+F P L  +IGIL    +L     + +K+CHR    S  +   +NH  +    S+ R S    G+++++I+S+  +++ +  G  +G +C+V
Subjt:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD---VNHPRQ--IRSSPRFS----GIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAV

Query:  CLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLS
        CLS+FE+ E LRLLPKC HAFH+ CID WL+ H++CPLCR  V   +    S   ++  +++N S
Subjt:  CLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLS

Q9SL78 Putative RING-H2 finger protein ATL125.3e-7542.11Show/hide
Query:  LNVFFLFSVFF-VVEAQMDSQD---AENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD----VNHPR----QIRSSPRFSGIDKTVIES
        +++ F F +F   V AQ        A +  F+PSL  + G+  ++F LTF+LLVYAK  H       D     + H R        S RFSG+DK  IES
Subjt:  LNVFFLFSVFF-VVEAQMDSQD---AENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD----VNHPR----QIRSSPRFSGIDKTVIES

Query:  LPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSE-DLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR
        LPFFRFS LKG K+GLEC+VCLSKFED+EILRLLPKC+HAFHI CID WLE+HA+CPLCR RV  E DL +L NSS+   +L+     ++DS +E++++R
Subjt:  LPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSE-DLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR

Query:  EEEEQQQQILHGSSRFSIGRSFRKILKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDI
        EE         GSSRFS   SFRKILK      +L+ +   +  DEK K +H+ NH+I+VSD VF NRWSN++SSDL FL  EM++++SS RF+S++   
Subjt:  EEEEQQQQILHGSSRFSIGRSFRKILKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDI

Query:  EQSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESN
                R     L+ KE+ME+KR        I   +S                       +RR+VSEIT VSR     +  ++     +   +   + 
Subjt:  EQSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESN

Query:  VKQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQI
          +ER R +W PIA+RT QWF NRE        RQ +
Subjt:  VKQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQI

Q9SRQ8 RING-H2 finger protein ATL512.8e-2331.91Show/hide
Query:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRR----ASISVDDVN--------------------HPRQIRSSPRFSGIDKTVIESLPFFR
        D  D+ +S F P L  +IGIL   F+L     + +K+CHRR    +S S   +N                    +P Q        G+D+++I+S+  ++
Subjt:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRR----ASISVDDVN--------------------HPRQIRSSPRFSGIDKTVIESLPFFR

Query:  FSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNI
        +  + G  E  +C+VCLS+F++ E LRLLPKC HAFH+ CID WL+ H++CPLCR  + +     + + ++ + +  N S    D ++
Subjt:  FSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20030.1 RING/U-box superfamily protein3.8e-7642.11Show/hide
Query:  LNVFFLFSVFF-VVEAQMDSQD---AENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD----VNHPR----QIRSSPRFSGIDKTVIES
        +++ F F +F   V AQ        A +  F+PSL  + G+  ++F LTF+LLVYAK  H       D     + H R        S RFSG+DK  IES
Subjt:  LNVFFLFSVFF-VVEAQMDSQD---AENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD----VNHPR----QIRSSPRFSGIDKTVIES

Query:  LPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSE-DLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR
        LPFFRFS LKG K+GLEC+VCLSKFED+EILRLLPKC+HAFHI CID WLE+HA+CPLCR RV  E DL +L NSS+   +L+     ++DS +E++++R
Subjt:  LPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSE-DLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR

Query:  EEEEQQQQILHGSSRFSIGRSFRKILKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDI
        EE         GSSRFS   SFRKILK      +L+ +   +  DEK K +H+ NH+I+VSD VF NRWSN++SSDL FL  EM++++SS RF+S++   
Subjt:  EEEEQQQQILHGSSRFSIGRSFRKILKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDI

Query:  EQSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESN
                R     L+ KE+ME+KR        I   +S                       +RR+VSEIT VSR     +  ++     +   +   + 
Subjt:  EQSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESN

Query:  VKQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQI
          +ER R +W PIA+RT QWF NRE        RQ +
Subjt:  VKQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQI

AT3G03550.1 RING/U-box superfamily protein2.0e-2431.91Show/hide
Query:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRR----ASISVDDVN--------------------HPRQIRSSPRFSGIDKTVIESLPFFR
        D  D+ +S F P L  +IGIL   F+L     + +K+CHRR    +S S   +N                    +P Q        G+D+++I+S+  ++
Subjt:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRR----ASISVDDVN--------------------HPRQIRSSPRFSGIDKTVIESLPFFR

Query:  FSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNI
        +  + G  E  +C+VCLS+F++ E LRLLPKC HAFH+ CID WL+ H++CPLCR  + +     + + ++ + +  N S    D ++
Subjt:  FSTLKGTKEGLECAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNI

AT4G28890.1 RING/U-box superfamily protein2.8e-9549.88Show/hide
Query:  FQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCH-RRASISVDDVNHPRQIR----------SSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFED
        F+PSL  V G+L +MF LTF+LLVYAK CH    S S D   H R++R          SS RFSG+DKT IESLP FRFS LKG+K+GL+C+VCLSKFE 
Subjt:  FQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCH-RRASISVDDVNHPRQIR----------SSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKFED

Query:  IEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVG-SEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEEQQ--QQILHGSSRFSIGRSFRKI
        +EILRLLPKC+HAFHI CID WLE+HA+CPLCR RV   ED  +L+N +S RFL  N SE+++DS++EL+++REEEE++  ++ L GSSRFSIG SFRKI
Subjt:  IEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVG-SEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEEQQ--QQILHGSSRFSIGRSFRKI

Query:  LKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIEQSTLPRSRQIEE--ILKIKEEMEI
        LK   + + L+ +   D +++K+  +H+ NH+I+VSD VF NRWSNVSSSDLMFLN EM+++ISS RF+SL+       + R  + ++  IL+IKEEME 
Subjt:  LKNDKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIEQSTLPRSRQIEE--ILKIKEEMEI

Query:  KRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFG---HDDLYMNFNRKFKNGESSDLES------NVKQERMREIWYPIA
        KR  E+KL  +T       + S +  S + S++ +  P  RRSVS+IT V R     H D          +G +++  S      N  +ER R +W PIA
Subjt:  KRSFESKLNKITQSNSILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFG---HDDLYMNFNRKFKNGESSDLES------NVKQERMREIWYPIA

Query:  KRTVQWFANRETRFQTAENRQ
        ++T QWFANRE R Q     Q
Subjt:  KRTVQWFANRETRFQTAENRQ

AT5G05810.1 RING/U-box superfamily protein1.0e-3637.46Show/hide
Query:  PSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDDVNHPRQ---------------IRSSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKF
        P +  VI +L   F LTF+LL+Y K C RR       VNHP++               +    + SGID++VIESLP FRF  L G K+GLECAVCL++F
Subjt:  PSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDDVNHPRQ---------------IRSSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAVCLSKF

Query:  EDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR---------------EEEEQQQQILH
        E  E+LRLLPKCKHAFH+ C+D WL+ H++CPLCR RV  ED+ L+ + +S   L  +  E    +N    + R               E   +  +I  
Subjt:  EDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQR---------------EEEEQQQQILH

Query:  GSSRFSIGRSFRKILK-----NDKENEMLISKASGDYEDEKMKN-----------LHRHNHKIIVSDFVFMN-RWSNVSSSDLMFLNKEMI
         SS  S   SFR+ L      ND   E   S A    +  + K+             R  H+II+S     + RWS V  SDL++L  EMI
Subjt:  GSSRFSIGRSFRKILK-----NDKENEMLISKASGDYEDEKMKN-----------LHRHNHKIIVSDFVFMN-RWSNVSSSDLMFLNKEMI

AT5G17600.1 RING/U-box superfamily protein2.6e-2435.76Show/hide
Query:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD---VNHPRQ--IRSSPRFS----GIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAV
        D   + +S+F P L  +IGIL    +L     + +K+CHR    S  +   +NH  +    S+ R S    G+++++I+S+  +++ +  G  +G +C+V
Subjt:  DSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDD---VNHPRQ--IRSSPRFS----GIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLECAV

Query:  CLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLS
        CLS+FE+ E LRLLPKC HAFH+ CID WL+ H++CPLCR  V   +    S   ++  +++N S
Subjt:  CLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCCGGTTCAGTTTGAATGTTTTTTTCCTCTTTTCTGTGTTCTTTGTTGTTGAAGCTCAAATGGATTCTCAAGATGCTGAAAACAGTGCTTTTCAGCCAAGTCTTGG
CTTCGTGATCGGGATTCTAGGAGTTATGTTTTTGTTGACATTTATTCTTCTTGTTTATGCAAAGTTCTGCCATAGAAGAGCTTCTATTAGTGTGGATGATGTAAATCATC
CTAGACAAATCAGGTCAAGTCCTCGGTTTTCTGGAATTGATAAGACGGTGATCGAATCTCTTCCATTCTTTAGATTCTCCACACTGAAAGGTACCAAAGAAGGGCTGGAA
TGTGCAGTCTGTCTTTCGAAATTTGAAGATATCGAAATTCTTCGGTTATTGCCAAAGTGCAAGCATGCTTTTCATATTAACTGCATCGATCATTGGCTCGAAAAACATGC
TAGCTGTCCTCTTTGCAGGCGAAGAGTTGGCTCCGAGGACTTGAAGCTTCTTTCAAATTCAAGCAGCATGAGATTCTTATTGAGCAACTTATCAGAATTGAAACAAGATT
CAAACATAGAGCTCTTTGTACAGAGAGAAGAAGAAGAACAACAACAACAAATACTCCATGGCTCTTCTAGATTCAGCATTGGAAGAAGCTTCAGAAAGATCTTAAAGAAT
GACAAGGAAAATGAAATGTTGATATCAAAAGCTTCTGGTGATTATGAAGATGAGAAAATGAAGAACTTACACAGACACAACCACAAAATTATCGTATCGGATTTTGTTTT
CATGAATCGATGGAGCAACGTAAGTTCCTCCGATTTGATGTTCTTGAACAAAGAGATGATTGATGCCATTTCAAGCCGTAGATTCACTTCCTTAGAAACAGATATTGAGC
AGTCAACTCTACCAAGATCAAGGCAAATTGAAGAAATCTTGAAGATCAAAGAGGAGATGGAAATAAAGAGATCCTTTGAGAGCAAACTCAACAAAATAACCCAAAGCAAC
TCAATTCTTGGGTACCCTTCTACATCACAATCTTCTACAAATCCAAGTCAAACAAGAATTACAAGCCCAGATGCAAGAAGATCAGTGTCAGAGATCACAGGCGTATCAAG
ATTTGGTCATGATGATCTGTATATGAATTTTAACAGAAAATTTAAAAATGGGGAATCTTCTGATCTGGAAAGCAATGTAAAGCAAGAAAGAATGAGGGAAATTTGGTACC
CAATTGCTAAAAGAACAGTCCAATGGTTTGCTAATAGAGAAACAAGGTTTCAAACAGCTGAGAACAGACAACAAATAGTAGAAGCAGTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTATCAAAAAGGGAGTTTTTAGCTTCATTTGATTGAGATATTGGCTCTTTTGAAGATCAGTAGATTCCGAAAAAGTATTCGCCATTGAAGAATCAATGATCCGGTTCAGT
TTGAATGTTTTTTTCCTCTTTTCTGTGTTCTTTGTTGTTGAAGCTCAAATGGATTCTCAAGATGCTGAAAACAGTGCTTTTCAGCCAAGTCTTGGCTTCGTGATCGGGAT
TCTAGGAGTTATGTTTTTGTTGACATTTATTCTTCTTGTTTATGCAAAGTTCTGCCATAGAAGAGCTTCTATTAGTGTGGATGATGTAAATCATCCTAGACAAATCAGGT
CAAGTCCTCGGTTTTCTGGAATTGATAAGACGGTGATCGAATCTCTTCCATTCTTTAGATTCTCCACACTGAAAGGTACCAAAGAAGGGCTGGAATGTGCAGTCTGTCTT
TCGAAATTTGAAGATATCGAAATTCTTCGGTTATTGCCAAAGTGCAAGCATGCTTTTCATATTAACTGCATCGATCATTGGCTCGAAAAACATGCTAGCTGTCCTCTTTG
CAGGCGAAGAGTTGGCTCCGAGGACTTGAAGCTTCTTTCAAATTCAAGCAGCATGAGATTCTTATTGAGCAACTTATCAGAATTGAAACAAGATTCAAACATAGAGCTCT
TTGTACAGAGAGAAGAAGAAGAACAACAACAACAAATACTCCATGGCTCTTCTAGATTCAGCATTGGAAGAAGCTTCAGAAAGATCTTAAAGAATGACAAGGAAAATGAA
ATGTTGATATCAAAAGCTTCTGGTGATTATGAAGATGAGAAAATGAAGAACTTACACAGACACAACCACAAAATTATCGTATCGGATTTTGTTTTCATGAATCGATGGAG
CAACGTAAGTTCCTCCGATTTGATGTTCTTGAACAAAGAGATGATTGATGCCATTTCAAGCCGTAGATTCACTTCCTTAGAAACAGATATTGAGCAGTCAACTCTACCAA
GATCAAGGCAAATTGAAGAAATCTTGAAGATCAAAGAGGAGATGGAAATAAAGAGATCCTTTGAGAGCAAACTCAACAAAATAACCCAAAGCAACTCAATTCTTGGGTAC
CCTTCTACATCACAATCTTCTACAAATCCAAGTCAAACAAGAATTACAAGCCCAGATGCAAGAAGATCAGTGTCAGAGATCACAGGCGTATCAAGATTTGGTCATGATGA
TCTGTATATGAATTTTAACAGAAAATTTAAAAATGGGGAATCTTCTGATCTGGAAAGCAATGTAAAGCAAGAAAGAATGAGGGAAATTTGGTACCCAATTGCTAAAAGAA
CAGTCCAATGGTTTGCTAATAGAGAAACAAGGTTTCAAACAGCTGAGAACAGACAACAAATAGTAGAAGCAGTATAAATCAAACCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIRFSLNVFFLFSVFFVVEAQMDSQDAENSAFQPSLGFVIGILGVMFLLTFILLVYAKFCHRRASISVDDVNHPRQIRSSPRFSGIDKTVIESLPFFRFSTLKGTKEGLE
CAVCLSKFEDIEILRLLPKCKHAFHINCIDHWLEKHASCPLCRRRVGSEDLKLLSNSSSMRFLLSNLSELKQDSNIELFVQREEEEQQQQILHGSSRFSIGRSFRKILKN
DKENEMLISKASGDYEDEKMKNLHRHNHKIIVSDFVFMNRWSNVSSSDLMFLNKEMIDAISSRRFTSLETDIEQSTLPRSRQIEEILKIKEEMEIKRSFESKLNKITQSN
SILGYPSTSQSSTNPSQTRITSPDARRSVSEITGVSRFGHDDLYMNFNRKFKNGESSDLESNVKQERMREIWYPIAKRTVQWFANRETRFQTAENRQQIVEAV