; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G16100 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G16100
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr6:14514476..14515054
RNA-Seq ExpressionCSPI06G16100
SyntenyCSPI06G16100
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF2282261.1 hypothetical protein GH714_043954 [Hevea brasiliensis]3.5e-3255.88Show/hide
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                C  V GSF   G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAG EPPTSPR EHFT PF
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KAG8611734.1 hypothetical protein MANES_S023516v8 [Manihot esculenta]4.5e-3248.96Show/hide
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        G+ QA           R  P   A    C+ V GS    G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAG EPPTSPR EHFT PFNR
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KAG8612080.1 hypothetical protein MANES_S023652v8 [Manihot esculenta]3.1e-3350.26Show/hide
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        GR  W    RD QAD+PSA  L+AQL FK+ +VRGILQFTP     C   R    +                  GA  F+S SLA  A G+  R  +   
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Query:  RQAG-------KERARLSPALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
         +AG       +   R  P   A    C+ V GS    G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAG EPPTSPR EHFT PFNR
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PHT25661.1 hypothetical protein CQW23_34715 [Capsicum baccatum]1.2e-3251.1Show/hide
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        RDAQAD+PSA+ L+AQL FKD +V GILQFTP         +C +                 P T   +  RGAG     SLA    GF  R  +RG   
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Query:  AGKERARLSPALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
          +   R +P      L      GSF   G +NDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPR EHFT  FNR
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XP_021648209.1 uncharacterized protein LOC110640953 isoform X1 [Hevea brasiliensis]1.8e-3352.91Show/hide
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Query:  KERARLSP-ALDAVG--------LFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
        + R  L P    A G          C  V GSF   G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAG EPPTSPR EHFT PFNR
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2G2UY24 Uncharacterized protein5.8e-3351.1Show/hide
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        RDAQAD+PSA+ L+AQL FKD +V GILQFTP         +C +                 P T   +  RGAG     SLA    GF  R  +RG   
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Query:  AGKERARLSPALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
          +   R +P      L      GSF   G +NDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPR EHFT  FNR
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A0A6A6K0B8 Uncharacterized protein1.7e-3255.88Show/hide
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        GR  WG   RD QAD+PSA  L+AQL FKD +VRGILQFTP  S      L R   + I             RC +  G R+AG  R  L P    A G 
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Query:  ------LFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPF
                C  V GSF   G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAG EPPTSPR EHFT PF
Subjt:  ------LFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPF

A0A6A6K0N4 Uncharacterized protein3.7e-3251.6Show/hide
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        GR  WG   RD QAD+PSA  L+AQL FKD +VRGILQFTP     C   R    +    + +  S    AS      F F    R ++R    G R+AG
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Query:  KERARLSPALDA--------VGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
               P L              C  V GSF   G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAG EPPTSPR EHFT PFNR
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A0A6N2KB50 Uncharacterized protein (Fragment)6.4e-3247.92Show/hide
Query:  GATTRDAQADMPSARRLQAQLTFKDLVVRGILQFTP--------------------------KCSAPRTPRLERGAGKFISSSLARPASGFCFRCAKRGK
        GAT RD QAD+PS RR +AQL FKD +V GILQFTP                          K  AP TPRL   A          P++ F +R ++RG 
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Query:  RQAGKERARLSP--------ALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
          +   R  + P              L C    G     G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVA  EPPTSPR EHFT PFNR
Subjt:  RQAGKERARLSP--------ALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR

A0A6N2MKG5 Uncharacterized protein1.1e-3148.21Show/hide
Query:  GATTRDAQADMPSARRLQAQLTFKDLVVRGILQFTP--------------------------KCSAPRTPRLERGAGKFISSSLARPASGFCFRCAKRGK
        GAT RD QAD+PS RR +AQL FKD +V GILQFTP                          K  AP TPRL   A          P++ F +R ++RG 
Subjt:  GATTRDAQADMPSARRLQAQLTFKDLVVRGILQFTP--------------------------KCSAPRTPRLERGAGKFISSSLARPASGFCFRCAKRGK

Query:  --RQAGKE---------RARLSPALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR
           + G+          R R+ P      L C    G     G DNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVA  EPPTSPR EHFT PFNR
Subjt:  --RQAGKE---------RARLSPALDAVGLFCKCVCGSFDILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0C5Q0 Putative uncharacterized protein YLR154W-F6.4e-0578.57Show/hide
Query:  ILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKV
        +L   NDPSAGSPTETLLRLL+PLND+V
Subjt:  ILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCGGGCGAGTTGTGTGGGGGGCAACAACGCGTGACGCCCAGGCAGACATGCCCTCGGCCAGAAGGCTCCAGGCGCAACTTACGTTCAAAGACTTGGTGGTTCGCGG
GATCCTGCAATTCACACCAAAATGCTCCGCCCCCCGCACGCCGAGGCTAGAGCGAGGGGCGGGCAAATTCATTTCAAGTTCCTTGGCGCGACCTGCGTCGGGGTTTTGTT
TTAGATGCGCCAAGAGGGGAAAGAGGCAGGCAGGCAAAGAGCGTGCTCGCCTCTCCCCCGCCCTCGATGCGGTCGGTTTGTTTTGTAAATGCGTTTGTGGGTCGTTTGAT
ATTTTAGGCATCGACAATGATCCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCTCCTTCCTCTAAATGATAAGGTTCAATGGACTTCTCGCGACGTTGCGGG
CAGTGAACCGCCCACATCACCGCGATTCGAACACTTCACCAGACCATTCAATCGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCGGGCGAGTTGTGTGGGGGGCAACAACGCGTGACGCCCAGGCAGACATGCCCTCGGCCAGAAGGCTCCAGGCGCAACTTACGTTCAAAGACTTGGTGGTTCGCGG
GATCCTGCAATTCACACCAAAATGCTCCGCCCCCCGCACGCCGAGGCTAGAGCGAGGGGCGGGCAAATTCATTTCAAGTTCCTTGGCGCGACCTGCGTCGGGGTTTTGTT
TTAGATGCGCCAAGAGGGGAAAGAGGCAGGCAGGCAAAGAGCGTGCTCGCCTCTCCCCCGCCCTCGATGCGGTCGGTTTGTTTTGTAAATGCGTTTGTGGGTCGTTTGAT
ATTTTAGGCATCGACAATGATCCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCTCCTTCCTCTAAATGATAAGGTTCAATGGACTTCTCGCGACGTTGCGGG
CAGTGAACCGCCCACATCACCGCGATTCGAACACTTCACCAGACCATTCAATCGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGGRVVWGATTRDAQADMPSARRLQAQLTFKDLVVRGILQFTPKCSAPRTPRLERGAGKFISSSLARPASGFCFRCAKRGKRQAGKERARLSPALDAVGLFCKCVCGSFD
ILGIDNDPSAGSPTETLLRLLLPLNDKVQWTSRDVAGSEPPTSPRFEHFTRPFNR