; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G17920 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G17920
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionextensin-3-like
Genome locationChr6:16264484..16265089
RNA-Seq ExpressionCSPI06G17920
SyntenyCSPI06G17920
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058946.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-3163.93Show/hide
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KAA0058948.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-4082.41Show/hide
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KAE8647164.1 hypothetical protein Csa_018816, partial [Cucumis sativus]1.7e-6899.25Show/hide
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TYK10982.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-3163.93Show/hide
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XP_008466986.1 PREDICTED: extensin-3-like, partial [Cucumis melo]8.1e-4781.25Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KD80 Uncharacterized protein1.1e-8199.36Show/hide
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A0A1S3CSG8 extensin-3-like3.9e-4781.25Show/hide
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A0A5A7UXN4 Extensin-3-like6.0e-3263.93Show/hide
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A0A5D3CI60 Extensin-3-like6.0e-3263.93Show/hide
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A0A5D3CVI1 Extensin-3-like7.1e-4182.41Show/hide
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Query:  YQWPKGKI
        YQWPKGKI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCACGTAACCCCATTTTTGTGTTCTTCCTCTTCATCATCATGTCGTTGCTCTCTTTAAATTTGCCATCGAATTCTGCTGAGCACGATATTCCCTCATCTCTTTT
GTCACCGCCGCTAATGCCACCGATCACTAGACCTATAGTTCCTCATCACCCGTTTACATTCCCTTCTCCATTTAGGAAGACTTTTAGACACACATGGTTGCCACCACCAT
CGCCACCGGCGCAACAAGAATTGGAGAGGCCAATAGTTCCTTATTTTCCCTATAAATTTCCACCACCTCCATCAAGAAAACAGGCCAATCCTCCTCCGAGCTACCATGCC
TTTCCCCCACCAGCCTTACTGCTCCTACCCAGAAAACTTTACATGTCTGAGGTCAGGAGGGCGACGCCTCCACCACCGCCTATAAAGCCATATCAGTGGCCAAAAGGGAA
GATCCGTAAATCACCCCCACCTCCTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGTTGAGAAGGATAATGGAGTCACGTAACCCCATTTTTGTGTTCTTCCTCTTCATCATCATGTCGTTGCTCTCTTTAAATTTGCCATCGAATTCTGCTGAGCACGATATT
CCCTCATCTCTTTTGTCACCGCCGCTAATGCCACCGATCACTAGACCTATAGTTCCTCATCACCCGTTTACATTCCCTTCTCCATTTAGGAAGACTTTTAGACACACATG
GTTGCCACCACCATCGCCACCGGCGCAACAAGAATTGGAGAGGCCAATAGTTCCTTATTTTCCCTATAAATTTCCACCACCTCCATCAAGAAAACAGGCCAATCCTCCTC
CGAGCTACCATGCCTTTCCCCCACCAGCCTTACTGCTCCTACCCAGAAAACTTTACATGTCTGAGGTCAGGAGGGCGACGCCTCCACCACCGCCTATAAAGCCATATCAG
TGGCCAAAAGGGAAGATCCGTAAATCACCCCCACCTCCTTTCTAATTCTTCTACGTTTTCTTATATATATTCAATAAATTTCATTGTCTTTAATTTGGCCTTACTTAGTT
ACTTTACTTATCTTCTCATCAAAGCTTGTCCTTGAAAAAAAATATCAATCACCGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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