; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI06G19030 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI06G19030
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDamaged dna-binding 2, putative isoform 1
Genome locationChr6:17227358..17228869
RNA-Seq ExpressionCSPI06G19030
SyntenyCSPI06G19030
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064705.1 Damaged dna-binding 2, putative isoform 1 [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-10892.31Show/hide
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XP_038883984.1 uncharacterized protein LOC120074946 [Benincasa hispida]8.9e-9584.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KFI7 Uncharacterized protein5.2e-11799.56Show/hide
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A0A1S3BCZ8 uncharacterized protein LOC1034885252.6e-10892.31Show/hide
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A0A5A7VFP0 Damaged dna-binding 2, putative isoform 12.6e-10892.31Show/hide
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A0A6J1HF10 uncharacterized protein LOC1114629222.3e-8881.28Show/hide
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A0A6J1K8D9 uncharacterized protein LOC1114920744.3e-8780.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24550.1 unknown protein6.5e-1144.76Show/hide
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        SS SSSSIGE+      S + ++ E+++A S  +G L     SLE+ LPI+RG+SN Y GKSKSF +L++A+S +  KD+ K EN F+++RR ++A+ L 
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Query:  AGGIS
          G S
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AT3G43850.1 unknown protein1.3e-2259.46Show/hide
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        SS+SS SIGEN       SD+D+G +NE ESSY GPL  MESLEE LPI+R IS FY GKSKSF SL + +SS  +KD+ KPEN +SR+RRNLL+  + +
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Query:  -GGISKRPIIS
         GGISK+P  S
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AT4G31510.1 unknown protein1.0e-0835.98Show/hide
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        R      D   PA +       RC  S    SSSS+GE       +S+N++ ED+   SS    L     SLE+ LPI+RG+SN Y GKSKSF +L++AS
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Query:  SSSSIKDIAKPENAFSRKRRNLLASNL-IAGGISKRPIIS--SSRSSLALAVVLSSSEIHKNND
        +++   D+ K E+  +++RR L+A+ L     +S   I +  +  S   LA+  S +E HK ND
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AT5G21940.1 unknown protein6.3e-3045.28Show/hide
Query:  SSSSSSSIGENSGFSVRSSDN--DDGEDNEAESSYKGPLG-MESLEEVLPIRRGISNFYNGKSKSFTSLV-----DASSSSSIKDIAKPENAFSRKRRNL
        SSS+SSSIG NS    +SS++  DD  +NE ES YKGPL  MESLE+VLP+R+GIS +Y+GKSKSFT+L        +SSSS+KD+AKPEN +SR+RRNL
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Query:  LASNL-------IAGGISKRPIISSSRSSLALAVVLSSSEI------------HKNNDLNSILPPPTLIR--------PPLYPNGRGSRINSGSAVPSLC
        L   +         GGISK+ ++SSSRS+L LA+ +++  +              ++   S  PP  L          PPLYP  +GS  N  S+  SL 
Subjt:  LASNL-------IAGGISKRPIISSSRSSLALAVVLSSSEI------------HKNNDLNSILPPPTLIR--------PPLYPNGRGSRINSGSAVPSLC

Query:  KFPTWRSYSMAN
         F  WRS+S+A+
Subjt:  KFPTWRSYSMAN

AT5G24890.1 unknown protein5.2e-0839.8Show/hide
Query:  SSSSSSIGE--NSGFSVRSSDNDDGEDNEAESSYKGPLGMESLEEVLPIRRGISNFYNGKSKSFTSLVDASSSSSIKDIAKPENAFSRKRRNLLASNL
        SS SSSIG   +S      S+N++ + +  E   +G   M SLE+ LP +RG+SN Y GKSKSF +L       S+K++AK EN  +++RR  + + L
Subjt:  SSSSSSIGE--NSGFSVRSSDNDDGEDNEAESSYKGPLGMESLEEVLPIRRGISNFYNGKSKSFTSLVDASSSSSIKDIAKPENAFSRKRRNLLASNL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAATTGCTCTGGAAACCAATACCGTTTTTTCTCAACCTGGATTGCCCTCTTACTGTTCTGTCTTGAATACCACCGGAATTATTCCGGTAGTTCGGCGAGAGGCGGC
TCTTGCTGATGCGGTGGCGCCAGCGGATGTGGATAGATGTAGTTCCTCTTCATCGTCCTCGATCGGAGAAAATAGTGGTTTCTCTGTACGATCATCGGATAATGACGATG
GAGAGGATAATGAGGCGGAAAGTTCGTATAAAGGACCTCTAGGAATGGAGTCGTTGGAAGAAGTTCTGCCTATCAGGAGAGGAATTTCAAATTTCTATAACGGGAAATCG
AAATCCTTCACAAGTCTAGTAGACGCTTCCTCCTCCTCCTCCATTAAAGACATAGCGAAGCCTGAAAACGCTTTCTCTCGAAAACGGAGGAATCTTCTTGCATCTAATCT
AATCGCCGGCGGCATATCAAAGCGTCCGATTATTAGTTCAAGTCGAAGCTCGTTAGCGTTGGCCGTCGTCCTGAGCAGTTCTGAAATCCACAAAAATAACGATCTGAATT
CAATATTACCTCCGCCGACGCTGATTCGTCCTCCATTGTACCCCAATGGGCGAGGATCTCGTATCAATTCAGGTTCTGCAGTTCCATCTCTCTGTAAATTCCCAACTTGG
CGATCATACTCCATGGCCAATATACAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAAAGTGATGAATGGAAGCCCGGCAGATGAGGATAAGGCCTTGGGCTTTCCTTTTCGGAGTTCTTTATCCTTTTCATTAACTCTCTCATCCTAGATGATATTACTCTT
CTCTTCTCCTTCATTAATTGTCTACAAATCCATAATTTTCTATATTTAAATTCTTGTCTCTTCTTCTCTACACAATCTCTCCACTCCCATCGATATATCAATGCCAAACT
ATATTTCTTAATCTCATCTTCATTTTAAAACTATAATCTTCTTCCTTCTCTATCTCATTTGAATCACTCAATTATGTCAATTGCTCTGGAAACCAATACCGTTTTTTCTC
AACCTGGATTGCCCTCTTACTGTTCTGTCTTGAATACCACCGGAATTATTCCGGTAGTTCGGCGAGAGGCGGCTCTTGCTGATGCGGTGGCGCCAGCGGATGTGGATAGA
TGTAGTTCCTCTTCATCGTCCTCGATCGGAGAAAATAGTGGTTTCTCTGTACGATCATCGGATAATGACGATGGAGAGGATAATGAGGCGGAAAGTTCGTATAAAGGACC
TCTAGGAATGGAGTCGTTGGAAGAAGTTCTGCCTATCAGGAGAGGAATTTCAAATTTCTATAACGGGAAATCGAAATCCTTCACAAGTCTAGTAGACGCTTCCTCCTCCT
CCTCCATTAAAGACATAGCGAAGCCTGAAAACGCTTTCTCTCGAAAACGGAGGAATCTTCTTGCATCTAATCTAATCGCCGGCGGCATATCAAAGCGTCCGATTATTAGT
TCAAGTCGAAGCTCGTTAGCGTTGGCCGTCGTCCTGAGCAGTTCTGAAATCCACAAAAATAACGATCTGAATTCAATATTACCTCCGCCGACGCTGATTCGTCCTCCATT
GTACCCCAATGGGCGAGGATCTCGTATCAATTCAGGTTCTGCAGTTCCATCTCTCTGTAAATTCCCAACTTGGCGATCATACTCCATGGCCAATATACAGTAGCTAGCGT
AGGGAAGGGTTTTCCCATGGCGTCCATGGAAGCTAAATCACCATGAAAGACTAACTTAACCTCTTGTGAAACCGAGTTTCATCGAATTGGTTTCTGACGAATAACTCATT
TTCTTTCAAATTTCCCACGATCTTAGGAACTCTGTTTTGATTTCCTTTTTGTATGAATGTATGTAAAGTGAAAAGAGAAAAAGCATAGCAGTTCATATTTTGAATCGATT
TCTGTTTGTTCATACAATTTGAATCAGCAAATGGAGAGAGCATGAGAGTTTCTTTTTTTAAATAAAGTAATGGGAAAAATACAGATAAAAGTTTGGGGCAAACTGAAAAG
GAATTGGTAATGAATGTGTCAATGTCATATAAAGCTGATGGACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSIALETNTVFSQPGLPSYCSVLNTTGIIPVVRREAALADAVAPADVDRCSSSSSSSIGENSGFSVRSSDNDDGEDNEAESSYKGPLGMESLEEVLPIRRGISNFYNGKS
KSFTSLVDASSSSSIKDIAKPENAFSRKRRNLLASNLIAGGISKRPIISSSRSSLALAVVLSSSEIHKNNDLNSILPPPTLIRPPLYPNGRGSRINSGSAVPSLCKFPTW
RSYSMANIQ